1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-3-fluoro-D-glucitol | 852234-97-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 英文名称: 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-3-fluoro-D-glucitol
• CAS: 852234-97-0
• 化学式: C₁₃H₁₅FO₄
• 分子量: 254.258
• InChiKey: DRZILFBDKUOTIC-ZOLYEBIHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  18.0
• 可旋转键数：
  1.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  47.92
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-3-fluoro-D-glucitol 在 吡啶 、 1‐methyl‐2‐azaadamantane‐N‐oxyl 、 碘苯二乙酸 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 1,5-anhydro-3-deoxy-3-fluoro-D-arabino-hex-3-en-2-ulose
  参考文献：
  名称：

  1,5-脱水-d-果糖衍生物的合成及其炎性体抑制剂的评价

  摘要：

  几个1,5-脱水-的合成d -fructose（1,5- AF）衍生物的炎性进行评价抑制活性。近来，据报道1，5-AF抑制炎症小体，尽管活性低。我们着眼于2-酮形式的1,5-AF的水合，并推测这种水合是低活性的原因。因此，我们合成了一些1,5-AF衍生物，这些衍生物将无法形成二聚体构象，并且有望对炎症小体具有较高的活性，然后通过使用小鼠骨髓-核糖核酸评估它们对NLRP3炎症小体的抑制活性。衍生的巨噬细胞和人类THP-1细胞。结果，某些合成的2-酮形式的化合物对NLRP3炎性小体的抑制活性比1,5-AF高得多。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2017.11.041
• 作为产物：
  描述：

  在 三乙基硼 、 三(三甲基硅基)硅烷 、 camphor-10-sulfonic acid 、 sodium methylate 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 57.0h， 生成 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-3-deoxy-3-fluoro-D-glucitol
  参考文献：
  名称：

  1,5-脱水-d-果糖衍生物的合成及其炎性体抑制剂的评价

  摘要：

  几个1,5-脱水-的合成d -fructose（1,5- AF）衍生物的炎性进行评价抑制活性。近来，据报道1，5-AF抑制炎症小体，尽管活性低。我们着眼于2-酮形式的1,5-AF的水合，并推测这种水合是低活性的原因。因此，我们合成了一些1,5-AF衍生物，这些衍生物将无法形成二聚体构象，并且有望对炎症小体具有较高的活性，然后通过使用小鼠骨髓-核糖核酸评估它们对NLRP3炎症小体的抑制活性。衍生的巨噬细胞和人类THP-1细胞。结果，某些合成的2-酮形式的化合物对NLRP3炎性小体的抑制活性比1,5-AF高得多。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2017.11.041

文献信息

• Synthesis, Improved Antisense Activity and Structural Rationale for the Divergent RNA Affinities of 3′-Fluoro Hexitol Nucleic Acid (FHNA and Ara-FHNA) Modified Oligonucleotides
  作者：Martin Egli、Pradeep S. Pallan、Charles R. Allerson、Thazha P. Prakash、Andres Berdeja、Jinghua Yu、Sam Lee、Andrew Watt、Hans Gaus、Balkrishen Bhat、Eric E. Swayze、Punit P. Seth

  DOI：10.1021/ja207086x

  日期：2011.10.19

  The synthesis, biophysical, structural, and biological properties of both isomers of 3'-fluoro hexitol nucleic acid (FHNA and Ara-FHNA) modified oligonucleotides are reported. Synthesis of the FHNA and Ara-FHNA thymine phosphoramidites was efficiently accomplished starting from known sugar precursors. Optimal RNA affinities were observed with a 3'-fluorine atom and nucleobase in a trans-diaxial orientation. The Ara-FHNA analog with an equatorial fluorine was found to be destabilizing. However, the magnitude of destabilization was sequence-dependent. Thus, the loss of stability is sharply reduced when Ara-FHNA residues were inserted at pyrimidine-purine (Py-Pu) steps compared to placement within a stretch of pyrimidines (Py-Py). Crystal structures of A-type DNA duplexes modified with either monomer provide a rationalization for the opposing stability effects and point to a steric origin of the destabilization caused by the Ara-FHNA analog. The sequence dependent effect can be explained by the formation of an internucleotide C-F center dot center dot center dot H-C pseudo hydrogen bond between F3' of Ara-FHNA and C8-H of the nucleobase from the 3'-adjacent adenosine that is absent at Py-Py steps. In animal experiments, FHNA-modified antisense oligonudeotides formulated in saline showed a potent downregulation of gene expression in liver tissue without producing hepatotoxicity. Our data establish FHNA as a useful modification for antisense therapeutics and also confirm the stabilizing influence of F(Py)center dot center dot center dot H-C(Pu) pseudo hydrogen bonds in nucleic acid structures.