(R)-1-(3-(2-(tert-butoxy)-2-oxoethoxy)phenyl)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl (S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carboxylate | 195202-26-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 直链 1,3-二芳基丙烷
• 英文名称: (R)-1-(3-(2-(tert-butoxy)-2-oxoethoxy)phenyl)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl (S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carboxylate
• 英文别名: [(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[3-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxoethoxy]phenyl]propyl] (2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carboxylate
• CAS: 195202-26-7
• 化学式: C₄₂H₅₅NO₁₁
• 分子量: 749.899
• InChiKey: MDHCYMDTBUJQAY-XFCANUNOSA-N

物化性质

• 沸点：
  808.3±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.160±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.6
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-1-(3-(2-(tert-butoxy)-2-oxoethoxy)phenyl)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl (S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carboxylate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 2-(3-((R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(((S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carbonyl)oxy)propyl)phenoxy)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  研究蛋白质-配体与具有设计的特异性口袋的突变型FKBP的相互作用。

  摘要：

  使用基于结构的设计和蛋白质诱变，我们对FKBP12配体结合位点进行了重塑，以包括相当大的疏水性特异性口袋。该突变体（F36V-FKBP）能够以低或亚纳摩尔亲和力结合具有设计取代基的新型合成配体，这些取代基在空间上阻止了与野生型蛋白质的结合。使用隆起的化合物的结合和结构分析，我们在这里显示该口袋高度混杂，能够以可比的亲和力结合一系列疏水性烷基和芳基部分。因此，配体亲和力似乎对口袋的占用程度或包装质量不敏感。NMR光谱分析表明相似的配体可以采用根本不同的结合方式，从而使结构-活性关系的解释变得复杂。

  DOI：

  10.1021/jm9904396
• 作为产物：
  描述：

  (S)-1-(9H-fluoren-9-yl)methyl 2-((R)-1-(3-(2-tert-butoxy-2-oxo-ethoxy) phenyl)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl) piperidine-1,2-dicarboxylate 在 哌啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 bromo-tris(1-pyrrolidinyl)phosphonium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (R)-1-(3-(2-(tert-butoxy)-2-oxoethoxy)phenyl)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl (S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  研究蛋白质-配体与具有设计的特异性口袋的突变型FKBP的相互作用。

  摘要：

  使用基于结构的设计和蛋白质诱变，我们对FKBP12配体结合位点进行了重塑，以包括相当大的疏水性特异性口袋。该突变体（F36V-FKBP）能够以低或亚纳摩尔亲和力结合具有设计取代基的新型合成配体，这些取代基在空间上阻止了与野生型蛋白质的结合。使用隆起的化合物的结合和结构分析，我们在这里显示该口袋高度混杂，能够以可比的亲和力结合一系列疏水性烷基和芳基部分。因此，配体亲和力似乎对口袋的占用程度或包装质量不敏感。NMR光谱分析表明相似的配体可以采用根本不同的结合方式，从而使结构-活性关系的解释变得复杂。

  DOI：

  10.1021/jm9904396

文献信息

• Multidirectional Activity Control of Cellular Processes by a Versatile Chemo-optogenetic Approach
  作者：Xi Chen、Muthukumaran Venkatachalapathy、Leif Dehmelt、Yao-Wen Wu

  DOI：10.1002/anie.201806976

  日期：2018.9.10

  The spatiotemporal dynamics of proteins or organelles plays a vital role in controlling diverse cellular processes. However, acute control of activity at distinct locations within a cell is challenging. A versatile multidirectional activity control (MAC) approach is presented, which employs a photoactivatable system that may be dimerized upon chemical inducement. The system comprises second‐generation

  蛋白质或细胞器的时空动力学在控制各种细胞过程中起着至关重要的作用。然而，对细胞内不同位置的活性进行急性控制是具有挑战性的。提出了一种通用的多向活性控制（MAC）方法，该方法采用了可光激活的系统，该系统在化学诱导下可能会二聚。该系统包括第二代SLF * -TMP（S * T）和光笼NvocTMP-Cl二聚体；其中，SLF * -TMP具有FKBP（F36V）结合蛋白的合成配体，Nvoc是笼基，TMP是抗生素甲氧苄啶。两种MAC策略被证明可以时空控制细胞信号传导和细胞内货物运输。这种新颖的平台可以对活细胞中多个隔室的活动进行可调，可逆和快速控制。
• Photocleavable linker
  申请人：City of Hope

  公开号：US09096844B2

  公开（公告）日：2015-08-04

  There are provided, inter alia, photolabile compounds and methods useful for the formation of dimers of biological molecules and subsequent dissociation of the dimers.

  提供了可溶于光的化合物和方法，可用于生物分子二聚体的形成和随后的二聚体分解。
• [EN] SYNTHETIC DERIVATIVES OF RAPAMYCIN AS MULTIMERIZING AGENTS FOR CHIMERIC PROTEINS WITH IMMUNOPHILIN-DERIVED DOMAINS<br/>[FR] DERIVES SYNTHETIQUES DE RAPAMYCINE UTILISES COMME AGENTS DE MULTIMERISATION DE PROTEINES CHIMERES A DOMAINES DERIVES DE L'IMMUNOPHILINE
  申请人：ARIAD GENE THERAPEUTICS, INC.

  公开号：WO1997031898A1

  公开（公告）日：1997-09-04

  (EN) New compounds are disclosed for multimerizing immunophilins and proteins containing immunophilin or immunophilin-related domains. The compounds are of the formula (I): M-L-Q, a resolved stereoisomer thereof or mixture of one or more such stereoisomers, and pharmaceutically acceptable salts thereof, wherein M is an immunophilin-binding group comprising a moiety of formula (II); G is independently selected from the group consisting of (a), (b), and (c); Q comprises a moiety of formula (II), a naturally occurring macrocyclic FKBP ligand or derivative thereof, or is a synthetic FKBP ligand of formula (III); n = 1 or 2; X = O, NH or CH2; B1 and B2 are independently H or aliphatic, heteroaliphatic, aryl or heteroaryl; Y = O, S, NH, -NH(C=O)-, -NH(C=O)-O-, -NH(SO2)- or NR3, or represents a covalent bond from R2 to carbon 9; R1, R2, and R3 are the same or different and are independently aliphatic, heteroaliphatic, aryl or heteroaryl; and, L is a linker moiety covalently linking monomers M to Q or covalently linking M1 to M2 through covalent bonds to either R1, R2, not necessarily the same in each of M1 and M2.(FR) L'invention concerne de nouveaux composés de multimérisation d'immunophilines et des protéines contenant de l'immunophiline ou des domaines apparentés à l'immunophiline. Les composés ont la formule (I) M-L-Q, un de leur stéréoisomère résolu ou un mélange d'un ou de plusieurs de ces stéréoisomères, et leurs sels pharmaceutiquement acceptables, formule dans laquelle M représente un groupe de liaison d'immunophiline comprenant une fraction de la formule (II) dans laquelle G est choisi indépendamment dans le groupe constitué de (a, b, c), Q comprend une fraction de formule (II), un ligand FKBP macrocyclique naturel ou un dérivé de celui-ci, ou bien un ligand FKBP synthétique de formule (III) dans lesquelles n = 1 ou 2; X = O, NH ou CH2; B1 and B2 représentent indépendamment H ou aryle ou hétéroaryle aliphatique, hétéroaliphatique; Y = O, S, NH, -NH(C=O)-, -NH(C=O)-O, -NH(SO2)- ou NR3, ou il représente une liaison covalente de R2 à l'atome de carbone 9, R1, R2, et R3 sont identiques ou différents et représentent indépendamment aryle ou hétéroaryle aliphatique, hétéroaliphatique, et L représente une fraction de liaison liant de manière covalente des monomères M à Q ou liant de manière covalente M1 à M2 par des liaisons covalentes à soit R1 soit R2, non nécessairement identiques dans chacun de M1 et M2.

  (中) 揭示了用于多聚免疫蛋白和含有免疫蛋白或免疫蛋白相关域的蛋白质的新化合物。该化合物的化学式为(I): M-L-Q，其已解析立体异构体或一个或多个此类立体异构体的混合物以及其药学上可接受的盐。其中，M是一个免疫蛋白结合基团，包括式(II)的基团；G独立地选择自(a)、(b)和(c)组成的群体；Q包括式(II)的基团、自然存在的大环FKBP配体或其衍生物，或式(III)的合成FKBP配体；n=1或2；X=O、NH或CH2；B1和B2独立地是H或脂肪族、杂脂族、芳基或杂芳基；Y=O、S、NH、-NH(C=O)-、-NH(C=O)-O-、-NH(SO2)-或NR3，或代表从R2到碳9的共价键；R1、R2和R3相同或不同，独立地是脂肪族、杂脂族、芳基或杂芳基；L是一个连接单体M到Q的连接基团，或通过共价键将M1与M2连接起来，通过共价键连接到R1或R2，M1和M2中的每个不一定相同。
• 一种合成S-1-[(S)-2-(3,4,5-三甲氧苯基)丁酰基]哌啶-2-羧酸的方法
  申请人：上海晋鲁医药科技有限公司

  公开号：CN105198796A

  公开（公告）日：2015-12-30

  本发明公开了一种合成S-1-[(S)-2-(3,4,5-三甲氧苯基)丁酰基]哌啶-2-羧酸的方法。采用消旋的2-(3,4,5-三甲氧苯基)丁酸与手性的S-哌啶-2-羧酸甲酯发生缩合和水解后得到非对映异构体(R,S)-型Ⅱ’和(S,S)-型Ⅱ，利用该非对映异构体酸与手性的R-苯乙胺成盐速度的差别，成功地将非对映异构体进行了有效成盐拆分分离，成盐后加入酸，将拆分剂去除后得到所需要构型的(S,S)-型化合物Ⅱ。母液加碱回流后，又可以将非需要的构型再次转变成非对映异构体原料，循环利用。
• Synthesis of <b>Shld</b> Derivatives, Their Binding to the Destabilizing Domain, and Influence on Protein Accumulation in Transgenic Plants
  作者：Frederik Præstholm Jørgensen、Daniel Madsen、Morten Meldal、Jacob Valdbjørn Olsen、Morten Petersen、Jeppe Granhøj、Mikael Bols

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00497

  日期：2019.5.23

  A series of 35 analogues of Shld with modifications in the A-residue and the C-residues were prepared and investigated for binding to FKBP and GFP accumulation in transgenic plants. The modifications investigated explored variations that were supposedly inside or outside the receptor binding site with the latter being important by influencing the overall polarity of the compounds in order to improve the absorption in plants. The binding of the new compounds to the destabilizing domain was determined using a fluorescence polarization competition assay, and the GFP expression in engineered Arabidopsis thaliana was studied. The results showed that modifications of the C-building block phenol with acidic, basic, and neutral groups led to better ligands with some being better than Shld in the plant. Generally small, polar substituents showed the best GFP accumulation.