6-{[(tert-butyl)diphenylsilyloxy]methyl}-1-[5,6,7-trideoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hept-6-ynofuranosyl]uracil | 928034-58-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-{[(tert-butyl)diphenylsilyloxy]methyl}-1-[5,6,7-trideoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hept-6-ynofuranosyl]uracil
• CAS: 928034-58-6
• 化学式: C₃₁H₃₆N₂O₆Si
• 分子量: 560.722
• InChiKey: HFDAYVGBWODPGY-YULOIDQLSA-N

物化性质

• 熔点：
  139-141 °C
• 密度：
  1.24±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.05
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  91.78
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-iodo-2',3'-O-isopropylideneadenosine 、 6-{[(tert-butyl)diphenylsilyloxy]methyl}-1-[5,6,7-trideoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hept-6-ynofuranosyl]uracil 在 tris(dibenzylideneacetone)dipalladium (0) copper(l) iodide 、 P(fur)3 作用下， 以 三乙胺 、 甲苯 为溶剂， 以80%的产率得到2',3'-O-isopropylideneadenosin-8-yl-(8->7'-C)-6-{[(tert-butyl)diphenylsilyloxy]methyl}-1-(5,6,7-trideoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hept-6-ynofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第13部分†

  摘要：

  自身互补UA和AU二核苷酸类似物41 - 45，47，48，和51 - 60通过制备的Sonogashira与6- iodouridines耦合C（5'） -ethynylated腺苷和与8- iodoadenosines C（5'） -乙炔化尿苷。二核苷酸类似物在CDCl 3溶液中缔合。的C（6 / I） -未被取代的AU二聚体51和54更喜欢抗拉伸线性双链体取向uracilyl组和形式。UA炔丙醇41和43 – 45具有持久的分子内O（5'/ I）H⋅⋅⋅N（3 / I）H-键，因此，一个顺式取向的腺嘌呤基和GT -或TG取向乙炔基部分; 它们形成波纹状线性双工。所有其他的二聚体形成特征的循环复式顺式取向的核碱基。乙炔基部分的首选方向（C（4'），C（5'）扭转角）定义了gg和乙炔基超过O（4'/ I）的构象。所述UA二聚体42,47，和48形式的Watson-Crick氢键，该AU二聚体56和58

  DOI：

  10.1002/hlca.200690259
• 作为产物：
  描述：

  6-{[(tert-butyl)diphenylsilyloxy]methyl}-2',3'-O-isopropylideneuridine 在 咪唑 、 二氯乙酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 偶氮二异丁腈 、 乙基溴化镁 、 四丁基氟化铵 、 三正丁基氢锡 、 二甲基亚砜 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 55.5h， 生成 6-{[(tert-butyl)diphenylsilyloxy]methyl}-1-[5,6,7-trideoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hept-6-ynofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第13部分†

  摘要：

  自身互补UA和AU二核苷酸类似物41 - 45，47，48，和51 - 60通过制备的Sonogashira与6- iodouridines耦合C（5'） -ethynylated腺苷和与8- iodoadenosines C（5'） -乙炔化尿苷。二核苷酸类似物在CDCl 3溶液中缔合。的C（6 / I） -未被取代的AU二聚体51和54更喜欢抗拉伸线性双链体取向uracilyl组和形式。UA炔丙醇41和43 – 45具有持久的分子内O（5'/ I）H⋅⋅⋅N（3 / I）H-键，因此，一个顺式取向的腺嘌呤基和GT -或TG取向乙炔基部分; 它们形成波纹状线性双工。所有其他的二聚体形成特征的循环复式顺式取向的核碱基。乙炔基部分的首选方向（C（4'），C（5'）扭转角）定义了gg和乙炔基超过O（4'/ I）的构象。所述UA二聚体42,47，和48形式的Watson-Crick氢键，该AU二聚体56和58

  DOI：

  10.1002/hlca.200690259