3-(2,3,5-tri-O-benzyl-1-β-D-ribofuranosyl)benzonitrile | 935289-21-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3-(2,3,5-tri-O-benzyl-1-β-D-ribofuranosyl)benzonitrile
• CAS: 935289-21-7
• 化学式: C₃₃H₃₁NO₄
• 分子量: 505.613
• InChiKey: MMFUZGWFZPSFOT-LVVLYVGBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.39
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  60.71
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(2,3,5-tri-O-benzyl-1-β-D-ribofuranosyl)benzonitrile 在 乙醇 、 potassium trimethylsilonate 、 三溴化硼 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 3-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-二羟基-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]苯甲酰胺
  参考文献：
  名称：

  靶向铜绿假单胞菌 NAD 激酶的 NAD+ 类似物的基于结构的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  多重耐药性是一个重大的公共卫生问题，需要紧急开发新的抗生素，因此需要确定新的细菌靶标。烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶 NADK 的活性在迄今为止测试的所有细菌中都是必不可少的，包括许多表现出抗生素耐药性导致当前治疗失败的人类病原体。因此，抑制 NADK 是一种有前途的创新抗菌策略，因为目前市场上还没有针对这种酶的药物。通过基于片段的药物设计方法，我们最近开发了一种 NAD +竞争性 NADK 抑制剂，它显示出体内对金黄色葡萄球菌的活性. 在这里，我们表明该化合物是一种双腺苷衍生物，对来自革兰氏阴性菌铜绿假单胞菌(PaNADK) 的 NADK 酶没有活性。这种缺乏活性可以用 PaNADK 的晶体结构来解释，在本研究中它是在与 NADP +的复合物中确定的。结构分析使我们设计并合成了一种苯甲酰胺腺嘌呤二核苷类似物，对 PaNADK 具有活性。这种新型化合物在体外有效抑制 PaNADK 酶活性，K i为

  DOI：

  10.1111/febs.16604
• 作为产物：
  描述：

  间溴苯甲腈 在 三乙基硅烷 、 正丁基锂 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.08h， 生成 3-(2,3,5-tri-O-benzyl-1-β-D-ribofuranosyl)benzonitrile
  参考文献：
  名称：

  靶向铜绿假单胞菌 NAD 激酶的 NAD+ 类似物的基于结构的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  多重耐药性是一个重大的公共卫生问题，需要紧急开发新的抗生素，因此需要确定新的细菌靶标。烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶 NADK 的活性在迄今为止测试的所有细菌中都是必不可少的，包括许多表现出抗生素耐药性导致当前治疗失败的人类病原体。因此，抑制 NADK 是一种有前途的创新抗菌策略，因为目前市场上还没有针对这种酶的药物。通过基于片段的药物设计方法，我们最近开发了一种 NAD +竞争性 NADK 抑制剂，它显示出体内对金黄色葡萄球菌的活性. 在这里，我们表明该化合物是一种双腺苷衍生物，对来自革兰氏阴性菌铜绿假单胞菌(PaNADK) 的 NADK 酶没有活性。这种缺乏活性可以用 PaNADK 的晶体结构来解释，在本研究中它是在与 NADP +的复合物中确定的。结构分析使我们设计并合成了一种苯甲酰胺腺嘌呤二核苷类似物，对 PaNADK 具有活性。这种新型化合物在体外有效抑制 PaNADK 酶活性，K i为

  DOI：

  10.1111/febs.16604

文献信息

• Efficient Synthesis of Benzamide Riboside, a Potential Anticancer Agent
  作者：Laurent F. Bonnac、Guang-Yao Gao、Liqiang Chen、Steven E. Patterson、Hiremagalur N. Jayaram、Krzysztof W. Pankiewicz

  DOI：10.1080/15257770701528222

  日期：2007.11.26

  An efficient five step synthesis of benzamide riboside (BR) amenable for a large scale synthesis has been developed. It allows for extensive pre-clinical studies of BR as a potential anticancer agent.

  已经开发出适于大规模合成的有效的五步合成苯甲酰胺核糖苷（BR）。它可以对BR作为潜在的抗癌药进行广泛的临床前研究。
• Probing binding requirements of NAD kinase with modified substrate (NAD) analogues
  作者：Laurent Bonnac、Liqiang Chen、Rashmi Pathak、Guangyao Gao、Qian Ming、Eric Bennett、Krzysztof Felczak、Martin Kullberg、Steven E. Patterson、Francesca Mazzola、Giulio Magni、Krzysztof W. Pankiewicz

  DOI：10.1016/j.bmcl.2007.01.012

  日期：2007.3

  Synthesis of novel NAD(+) analogues that cannot be phosphorylated by NAD kinase is reported. In these analogues the C2' hydroxyl group of the adenosine moiety was replaced by fluorine in the ribo or arabino configuration (1 and 2, respectively) or was inverted into arabino configuration to give compound 3. Compounds 1 and 2 showed inhibition of human NAD kinase, whereas analogue 3 inhibited both the human and Mycobacterium tuberculosis NAD kinase. An uncharged benzamide adenine dinucleotide (BAD) was found to be the most potent competitive inhibitor (K-i = 90 mu M) of the human enzyme reported so far. (c) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• [EN] BENZAMIDE ADENINE DINUCLEOSIDE COMPOUNDS AND THEIR USES<br/>[FR] COMPOSÉS DE BENZAMIDE ADÉNINE DINUCLÉOSIDE ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：[en]INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MÉDICALE

  公开号：WO2024013349A1

  公开（公告）日：2024-01-18

  The inventors have now succeeded in developing compounds of Formula (I), described below, having the advantage of inhibiting NAD kinases, in particular P. aeruginosa NADK (PaNADK) enzyme, Listeria monocytogenes (LmNADK) enzyme and/or human cytosolic NADK (HsNADK) enzyme. The present invention relates to benzamide adenine dinucleoside compounds which are useful as inhibitors of NAD kinases, to pharmaceutical composition comprising such compounds, and to uses of such compounds in the treatment or prevention of bacterial infections.