N-(9-{(2R,3R,3aR,9aR)-3-[2-(1,3-Dioxo-1,3-dihydro-isoindol-2-yloxy)-ethoxy]-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-benzamide | 212061-07-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N-(9-{(2R,3R,3aR,9aR)-3-[2-(1,3-Dioxo-1,3-dihydro-isoindol-2-yloxy)-ethoxy]-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-benzamide
• 英文别名: N-[9-[(6aR,8R,9R,9aR)-9-[2-(1,3-dioxoisoindol-2-yl)oxyethoxy]-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 212061-07-9
• 化学式: C₃₉H₅₀N₆O₉Si₂
• 分子量: 803.032
• InChiKey: KTZMLFKXOVKYFQ-ZOXBLHLASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.55
• 重原子数：
  56.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  165.46
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(9-{(2R,3R,3aR,9aR)-3-[2-(1,3-Dioxo-1,3-dihydro-isoindol-2-yloxy)-ethoxy]-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-benzamide 在 氢氟酸 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 生成 N-(9-{(2R,3R,4R,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-3-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-isoindol-2-yloxy)-ethoxy]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-9H-purin-6-yl)-benzamide
  参考文献：
  名称：

  2'-O-氨氧基乙基（2'-O- AOE）修饰寡核苷酸的合成，杂交和耐核酸酶性能

  摘要：

  新的RNA模拟物2'-O- AOE已被掺入反义寡核苷酸中。该2'-O-修饰显着增强了针对靶RNA的杂交，此外，相对于DNA表现出对RNA的特异性。2'-O- AOE修饰的磷酸二酯寡核苷酸的核酸酶抗性（SVPD）显着高于未修饰的DNA，与2'-O- MOE寡核苷酸相当。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(98)02498-8
• 作为产物：
  描述：

  2'-O-(2-hydroxyethyl)-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)adenosine 在 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 为溶剂， 生成 N-(9-{(2R,3R,3aR,9aR)-3-[2-(1,3-Dioxo-1,3-dihydro-isoindol-2-yloxy)-ethoxy]-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl}-9H-purin-6-yl)-benzamide
  参考文献：
  名称：

  2'-O-氨氧基乙基（2'-O- AOE）修饰寡核苷酸的合成，杂交和耐核酸酶性能

  摘要：

  新的RNA模拟物2'-O- AOE已被掺入反义寡核苷酸中。该2'-O-修饰显着增强了针对靶RNA的杂交，此外，相对于DNA表现出对RNA的特异性。2'-O- AOE修饰的磷酸二酯寡核苷酸的核酸酶抗性（SVPD）显着高于未修饰的DNA，与2'-O- MOE寡核苷酸相当。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(98)02498-8