diphenylmethyl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-4,4,7-trioxo-4-thia-1-aza-bicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate | 188249-92-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: diphenylmethyl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-4,4,7-trioxo-4-thia-1-aza-bicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate
• 英文别名: (2S,3R,5R)-benzhydryl 3-formyl-3-methyl-7-oxo-4-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate-4,4-dioxide；benzhydryl 2β-formyl-1,1-dioxopenicillanate；diphenylmethyl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-7-oxo-4-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate, 4,4-dioxide；benzhydryl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-4,4,7-trioxo-4lambda6-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate；benzhydryl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-4,4,7-trioxo-4λ6-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate
• CAS: 188249-92-5
• 化学式: C₂₁H₁₉NO₆S
• 分子量: 413.451
• InChiKey: JEIJPESVPUIFJH-LMNJBCLMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.63
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  97.82
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  diphenylmethyl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-4,4,7-trioxo-4-thia-1-aza-bicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium chlorite 、 sodium dihydrogenphosphate 、 2-甲基-2-丁烯 、 草酰氯 、 苯甲醚 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 PSR-3-226
  参考文献：
  名称：

  Crystal Structures of KPC-2 β-Lactamase in Complex with 3-Nitrophenyl Boronic Acid and the Penam Sulfone PSR-3-226

  摘要：

  摘要 A 类碳青霉烯酶是碳青霉烯类抗生素效力的主要威胁。一种广泛存在的碳青霉烯酶 KPC-2 不易被β-内酰胺酶抑制剂（即克拉维酸、舒巴坦和他唑巴坦）抑制。为了探索 KPC-2 的不同抑制机制，我们测定了 KPC-2 与两种β-内酰胺酶抑制剂的晶体结构，这两种抑制剂遵循不同的失活途径和动力学。第一个复合物是一种小型硼酸化合物--3-硝基苯硼酸（3-NPBA）与 KPC-2 结合的复合物，分辨率为 1.62 Å。3-NPBA 与 KPC-2 K m 对 KPC-2 的 K m 值为 1.0 ± 0.1 μM（平均值 ± 标准误差），并通过与催化 S70 残基的可逆共价作用阻断活性位点。3-NPBA 的两个硼羟基原子分别位于氧阴离子孔和脱酰化水袋中。此外，3-NPBA 的芳香环还与活性位点中的 W105 形成了边对边的相互作用。以 1.26 埃的分辨率测定了 KPC-2 与五价砜 PSR-3-226 的结构。PSR-3-226 显示了 K m 值为 3.8 ± 0.4 μM，而 KPC-2 的失活速率常数 ( k inact ）为 0.034 ± 0.003 s -1 .当与 S70 共价结合时，PSR-3-226 会形成一个 反式 -烯胺中间体。主要的活性位点相互作用是通过羰基氧（位于氧阴离子孔中）和 PSR-3-226 的羧基（与 N132、N170 和 E166 相互作用）产生的。3-NPBA 和 PSR-3-226 是第一种与 KPC-2 形成酰酶复合物的β-内酰胺酶抑制剂。本研究在结构和抑制方面获得的启示有助于设计强效的 KPC-2 抑制剂。

  DOI：

  10.1128/aac.06099-11
• 作为产物：
  描述：

  benzhydryl 2β-(chloroacetoxy)methyl-1,1-dioxo-penicillanate 在 戴斯-马丁氧化剂 、 硫脲 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 diphenylmethyl (2S,3R,5R)-3-formyl-3-methyl-4,4,7-trioxo-4-thia-1-aza-bicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Crystal Structures of KPC-2 β-Lactamase in Complex with 3-Nitrophenyl Boronic Acid and the Penam Sulfone PSR-3-226

  摘要：

  摘要 A 类碳青霉烯酶是碳青霉烯类抗生素效力的主要威胁。一种广泛存在的碳青霉烯酶 KPC-2 不易被β-内酰胺酶抑制剂（即克拉维酸、舒巴坦和他唑巴坦）抑制。为了探索 KPC-2 的不同抑制机制，我们测定了 KPC-2 与两种β-内酰胺酶抑制剂的晶体结构，这两种抑制剂遵循不同的失活途径和动力学。第一个复合物是一种小型硼酸化合物--3-硝基苯硼酸（3-NPBA）与 KPC-2 结合的复合物，分辨率为 1.62 Å。3-NPBA 与 KPC-2 K m 对 KPC-2 的 K m 值为 1.0 ± 0.1 μM（平均值 ± 标准误差），并通过与催化 S70 残基的可逆共价作用阻断活性位点。3-NPBA 的两个硼羟基原子分别位于氧阴离子孔和脱酰化水袋中。此外，3-NPBA 的芳香环还与活性位点中的 W105 形成了边对边的相互作用。以 1.26 埃的分辨率测定了 KPC-2 与五价砜 PSR-3-226 的结构。PSR-3-226 显示了 K m 值为 3.8 ± 0.4 μM，而 KPC-2 的失活速率常数 ( k inact ）为 0.034 ± 0.003 s -1 .当与 S70 共价结合时，PSR-3-226 会形成一个 反式 -烯胺中间体。主要的活性位点相互作用是通过羰基氧（位于氧阴离子孔中）和 PSR-3-226 的羧基（与 N132、N170 和 E166 相互作用）产生的。3-NPBA 和 PSR-3-226 是第一种与 KPC-2 形成酰酶复合物的β-内酰胺酶抑制剂。本研究在结构和抑制方面获得的启示有助于设计强效的 KPC-2 抑制剂。

  DOI：

  10.1128/aac.06099-11

文献信息

• PENAM DERIVATIVES FOR TREATING BACTERIAL INFECTIONS
  申请人：TenNor Therapeutics Limited

  公开号：US20210070774A1

  公开（公告）日：2021-03-11

  Novel iron chelating group conjugated penam derivatives described herein show antibacterial activity, and could be used as antibacterial agents or beta-lactamase inhibitors (BLIs) which are of value for application in combination with other antibacterial agents.

  本文描述的新型铁螯合基团共轭的青霉素衍生物表现出抗菌活性，可用作抗菌剂或β-内酰胺酶抑制剂（BLIs），与其他抗菌剂联合应用具有价值。
• Penam sulfones as .beta.-lactamase inhibitors
  申请人：Syphar Laboratories, Inc.

  公开号：US05686441A1

  公开（公告）日：1997-11-11

  Novel 3-(substituted)-3-methyl-4-thia-1-azabicyclo\x9b3.2.0!heptane-2-carboxylate, 4,4-dioxides which are of value for use in combination with .beta.-lactam antibiotics to increase the effectiveness of the antibiotics.

  这是一种Novel 3-(取代)-3-甲基-4-硫-1-氮杂双环[3.2.0]庚烷-2-羧酸酯，4,4-二氧化物，与β-内酰胺类抗生素联合使用可以增加抗生素的有效性。
• Penam derivatives for treating bacterial infections
  申请人：TenNor Therapeutics Limited

  公开号：US11040987B2

  公开（公告）日：2021-06-22

  Novel iron chelating group conjugated penam derivatives described herein show antibacterial activity, and could be used as antibacterial agents or beta-lactamase inhibitors (BLIs) which are of value for application in combination with other antibacterial agents.

  本文所述的新型铁螯合基团共轭五氯化萘衍生物具有抗菌活性，可用作抗菌剂或β-内酰胺酶抑制剂（BLIs），具有与其他抗菌剂联合应用的价值。
• Synthesis and biological evaluation of penam sulfones as inhibitors of β-lactamases
  作者：Oludotun A. Phillips、Andhe V.N. Reddy、Eduardo L. Setti、Paul Spevak、David P. Czajkowski、Herninder Atwal、Sameeh Salama、Ronald G. Micetich、Samarendra N. Maiti

  DOI：10.1016/j.bmc.2005.02.020

  日期：2005.4

  The chemical synthesis of a series of new penam sulfone derivatives bearing a 2 beta-substituted-oxyimino and -hydrazone substituents, their beta-lactamase inhibitory properties against selected enzymes representing class A and C beta-lactamases are reported. The oxime containing pertain sulfones strongly inhibited the Escherichia coli TEM-1 and Klebsiella pneumoniae cefotaximase (CTX-1) enzymes, but moderately inhibited the Pseudomonas aeruginosa 46012 cephalosporinase; while the 2 beta-substituted-hydrazone derivatives were generally less active against these enzymes. Furthermore, most of the inhibitors enhanced the antibacterial activities of piperacillin (PIP) and ceftazidime (CAZ) particularly against TEM-1 and CTX-1 producing bacterial strains. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.