2'-O-(pyren-1-ylmethyl)-adenosine | 945397-75-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2'-O-(pyren-1-ylmethyl)-adenosine
• 英文别名: 2'-O-(Pyren-1-yl-methyl)adenosine；(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)-4-(pyren-1-ylmethoxy)oxolan-3-ol
• CAS: 945397-75-1
• 化学式: C₂₇H₂₃N₅O₄
• 分子量: 481.511
• InChiKey: CXGWCIWXRHJXOB-GVDONAMHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-(pyren-1-ylmethyl)-adenosine 在 四氮唑 、 三甲基氯硅烷 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 N-[9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-3-(pyren-1-ylmethoxy)oxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  RNA双链体上的芳香族阵列作为螺旋模板。

  摘要：

  合成了在2'-O-糖残基上具有多个（2-4个）pyr烯基甲基取代基的RNA低聚物。紫外熔解研究表明，the修饰的RNA可以与互补的RNA序列形成双链体，而不会失去热稳定性。吸收光谱，荧光光谱和圆二色性（CD）光谱表明，掺入的-向A型RNA双链体的外部突出，并沿RNA双链体的小沟螺旋状排列成螺旋状。计算机模拟的结果与the的组装结构一致。螺旋pyr阵列显示出显着强的准分子荧光，这取决于RNA双链体的序列背景。

  DOI：

  10.1039/b705933g
• 作为产物：
  描述：

  1-氯甲基芘 、 腺苷 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以23%的产率得到2'-O-(pyren-1-ylmethyl)-adenosine
  参考文献：
  名称：

  RNA双链体上的芳香族阵列作为螺旋模板。

  摘要：

  合成了在2'-O-糖残基上具有多个（2-4个）pyr烯基甲基取代基的RNA低聚物。紫外熔解研究表明，the修饰的RNA可以与互补的RNA序列形成双链体，而不会失去热稳定性。吸收光谱，荧光光谱和圆二色性（CD）光谱表明，掺入的-向A型RNA双链体的外部突出，并沿RNA双链体的小沟螺旋状排列成螺旋状。计算机模拟的结果与the的组装结构一致。螺旋pyr阵列显示出显着强的准分子荧光，这取决于RNA双链体的序列背景。

  DOI：

  10.1039/b705933g

文献信息

• EMBODIMENTS OF A PROBE AND METHOD FOR TARGETING NUCLEIC ACIDS
  申请人：Hrdlicka Patrick Jerzy

  公开号：US20140220573A1

  公开（公告）日：2014-08-07

  Disclosed embodiments concern a probe comprising one or more pairs of monomers capable of targeting a nucleic acid target. The pair of monomers may be arranged in a manner that promotes thermoinstability of the probe complex, thus producing a probe capable of locating and/or detecting a target. The probe also may comprise one or more natural or non-natural nucleotides capable of Watson-Crick base pairing with an isosequential nucleic acid target. Particular disclosed embodiments concern a method of using the disclosed probe to target nucleic acids. In particular disclosed embodiments, the probe may be incubated with a target nucleic acid and then be detected.

  公开的实施例涉及一种探针，包括一个或多个能够定位到核酸靶标的单体对。这对单体可以被排列在一种促进探针复合物热不稳定性的方式下，从而产生一种能够定位和/或检测靶标的探针。该探针还可以包括一个或多个自然或非自然核苷酸，能够与同构核酸靶标进行Watson-Crick碱基配对。特定的实施例涉及使用所公开的探针来定位核酸的方法。在特定的实施例中，探针可以与靶向核酸一起孵育，然后被检测到。
• US9885082B2
  申请人：——

  公开号：US9885082B2

  公开（公告）日：2018-02-06