1-methyl-2,6-bis[2-(indole-3-yl)vinyl]pyridinium iodide | 1268503-63-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 1-methyl-2,6-bis[2-(indole-3-yl)vinyl]pyridinium iodide
• CAS: 1268503-63-4
• 化学式: C₂₆H₂₂N₃*I
• 分子量: 503.385
• InChiKey: QJGZDTQBGYKJJI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.82
• 重原子数：
  30.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.04
• 拓扑面积：
  35.46
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  0.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,6-二甲基吡啶 在 哌啶 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 1-methyl-2,6-bis[2-(indole-3-yl)vinyl]pyridinium iodide
  参考文献：
  名称：

  在细胞水平上的生物分子识别：低光毒性阳离子探针对DNA成像的几何和化学功能依赖性。

  摘要：

  采用了一种组合方法来了解分子探针的结构几何形状以及合适的化学功能对其在DNA小沟中的有效结合的影响。不同的FT标记物（P1-P5）的小型化学文库的开发和使用DFT计算的分子模拟清楚地表明，配备必需化学功能的分子探针的半月形构象是其在小沟中正确结合的关键参数。脱氧核糖核酸。这些探针（P1-P5）的比较光学响应以及理论研究表明，由于P3具有半月形几何形状和特殊的化学结构，因此只有P3在DNA存在下显示出显着的荧光增强。此外，生物测定清楚地表明，该探针可以穿透活细胞和死细胞的细胞膜，而无需任何通透剂的帮助。显微细胞成像证实，探针P3可以高对比度和可忽略的细胞质溢出来染色细胞的核区域，而不会引起任何细胞变质。通过进行DNase / RNase酶切试验和凝胶电泳实验，确定P3对DNA的特异性和结合效率。最重要的是，P3在连续暴露于光源下的细胞培养基中表现出最小的光毒性和高的耐光漂白性，这对于许多生物

  DOI：

  10.1039/c6tb00787b

文献信息

• 多苯乙烯取代吡啶化合物作为G-四链体核酸 荧光探针
  申请人：广东工业大学

  公开号：CN106147754B

  公开（公告）日：2020-03-06

  本发明公开了一种荧光探针及其制备方法和在检测核酸G‑四链体结构中的应用。该类探针具有通式(I)的结构，且结构简单、稳定，容易制备。本发明还公开了该类探针可用于特异性检测核酸G‑四链体二级结构，可通过荧光分光光度计检测出溶液中的G‑四链体二级结构；该类探针可用于检测琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶中核酸G‑四链体结构；也可以用于检测、标记或显示活细胞中G‑四链体结构的存在与分布。本发明的荧光材料对于核酸G‑四链体结构具有高效专一的识别能力，同时具有很好的细胞膜通透性，较低的光致毒性、生物毒性和光漂白性等优点，克服了其他检测方法价格昂贵，设备要求高，技术操作相对复杂等缺点。
• Synthesis, absorption and fluorescence spectral characteristics of trinucleus dimethine cyanine dyes as fluorescent probes for DNA detection
  作者：Jun-Jie Su、Lan-Ying Wang、Xiang-Han Zhang、Yi-Le Fu、Yi Huang、Yong-Sheng Wei

  DOI：10.1590/s0103-50532011000100009

  日期：——

  The preparation of six trinucleus dimethine cyanine dyes with pyridine nucleus obtained by the condensation of trimethylpyridinium iodides with heterocyclic aromatic aldehyde was described. The absorption and fluorescence properties of the dyes were studied in different polarity solvents. Blue shift of the maxima absorption of the dyes was observed with the increase of solvents polarity. The fluorescence properties of the dyes in solution and in presence of DNA were studied. Significant enhancement of the fluorescent quantum yield was observed in four dyes in the presence of DNA. Specially, one of six dyes emitted weak fluorescence in Tris-HCl buffer, but displayed bright fluorescence in the presence of DNA.