2,5-dioxopyrrolidin-1-yl (S)-2,5-bis((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoate | 34404-35-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2,5-dioxopyrrolidin-1-yl (S)-2,5-bis((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoate
• 英文别名: L-Ornithine, N2,N5-bis[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]-, 2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl ester；(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) (2S)-2,5-bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoate
• CAS: 34404-35-8
• 化学式: C₁₉H₃₁N₃O₈
• 分子量: 429.47
• InChiKey: HHHMPKPELVYPMM-LBPRGKRZSA-N

物化性质

• 熔点：
  116-118 °C(Solv: ethanol (64-17-5))
• 密度：
  1.23±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.79
• 重原子数：
  30.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  140.34
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,5-dioxopyrrolidin-1-yl (S)-2,5-bis((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoate 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 caesium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 37.17h， 生成 [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[4-[[4-[4-[4-(hex-5-ynoylamino)benzoyl]anilino]-4-oxobutanoyl]amino]butoxy]-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl N-[(2S)-2,5-diaminopentanoyl]sulfamate
  参考文献：
  名称：

  Active site-directed proteomic probes for adenylation domains in nonribosomal peptide synthetases

  摘要：

  将主动定向蛋白质组学探针与可点击的苯酮功能基团偶联到5'-O-N-(氨酰基)磺胺腺苷（AMS）支架上，通过配体定向蛋白质标记选择性地靶向天然产物生产者蛋白质组中的非核糖体肽合酶（NRPS）腺苷化（A）结构域。

  DOI：

  10.1039/c4cc09412c
• 作为产物：
  描述：

  二碳酸二叔丁酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 2,5-dioxopyrrolidin-1-yl (S)-2,5-bis((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoate
  参考文献：
  名称：

  Quinone-Amino Acid Conjugates Targeting Leishmania Amino Acid Transporters

  摘要：

  本研究的目的是探讨通过适当设计的化学探针靶向利什曼原虫转运蛋白的可行性。导致脏器利什曼病的寄生虫利什曼原虫（Leishmania donovani）对精氨酸和赖氨酸呈营养依赖，具有特定的转运蛋白（LdAAP3和LdAAP7）来摄取这些营养物质。探针1-15是通过酰胺连接将细胞毒性醌片段（II和III）与氨基酸（即精氨酸和赖氨酸）结合而制得的。我们研究了合成的结合物对利什曼原虫的细胞外（前鞭毛体）和细胞内（无鞭毛体）形式的毒性，以及它们对相关氨基酸转运蛋白的抑制作用。我们观察到某些结合物确实显示出对寄生虫的毒性；特别是，7被确定为最有效的衍生物（在1 µg/mL和2.5 µg/mL的浓度下，前鞭毛体和无鞭毛体的残留细胞活力分别降至15%和48%）。值得注意的是，6在保留醌II细胞毒活性的同时，对哺乳动物THP1细胞显示无毒性。转运实验表明，新型结合物抑制了赖氨酸、精氨酸和脯氨酸转运蛋白的转运活性。此外，分析结果表明，这些毒性结合物可能通过转运蛋白转位进入细胞。无毒探针通过与天然底物竞争结合转运蛋白而抑制转运，但未被转运。因此，6可能通过利用氨基酸转运蛋白，选择性地将其毒性作用传递至利什曼原虫细胞。这项工作提供了第一个证据，表明人类病原体利什曼原虫的氨基酸转运蛋白可能受到小分子的调节，值得进一步从药物发现和化学生物学的角度进行研究。

  DOI：

  10.1371/journal.pone.0107994

文献信息

• Amide-based cationic lipids
  申请人：Promega Biosciences, Inc.

  公开号：US06339173B1

  公开（公告）日：2002-01-15

  The present invention provides novel amide-based cationic lipids of the general structure: or a salt, or solvate, or enantiomers thereof wherein; (a) Y is a direct link or an alkylene of 1 to about 20 carbon atoms; (b) R1 is H or a lipophilic moiety; (c) R2, R3, and R4 are positively charged moieties, or at least one but not all of R2,R3, or R4 is a positive moiety and the remaining are independently selected from H, an alkyl moiety of 1 to about 6 carbon atoms, or a heterocyclic moiety of about 5 to about 10 carbon atoms; (d) n and p are independently selected integers from 0 to 8, such that the sum of n and o is from 1 to 16; (e) X− is an anion or polyanion and (f) m is an integer from 0 to a number equivalent to the positive charge(s) present on the lipid; provided that if Y is a direct link and the sum of n and p is 1 then one of either R3 or R4 must have an alkyl moiety of at least 10 carbon atoms. The present invention further provides compositions of these lipids with polyanionic macromolecules, methods for interfering with protein expression in a cell utilizing these compositions and a kit for preparing the same.

  本发明提供了一种新型的基于酰胺的阳离子脂质，其一般结构如下： 或其盐、溶剂合物、对映体，其中；(a) Y是直链或1至约20个碳原子的烷基；(b) R1是H或亲脂性基团；(c) R2、R3和R4是带正电荷的基团，或者R2、R3或R4中至少一个而不是全部是正电荷基团，其余的可独立选择自H、1至约6个碳原子的烷基或约5至约10个碳原子的杂环基团；(d) n和p是独立选择的0至8的整数，使得n和o的总和为1至16；(e) X-是阴离子或多阴离子，(f) m是0到与脂质上存在的正电荷数等效的数字；但如果Y是直链且n和p的总和为1，则R3或R4中的一个必须具有至少10个碳原子的烷基。本发明还提供了这些脂质与多阴离子大分子的组合物，利用这些组合物干扰细胞中蛋白质表达的方法以及用于制备相同的试剂盒。
• Selective Water-Soluble Gelatinase Inhibitor Prodrugs
  作者：Major Gooyit、Mijoon Lee、Valerie A. Schroeder、Masahiro Ikejiri、Mark A. Suckow、Shahriar Mobashery、Mayland Chang

  DOI：10.1021/jm200566e

  日期：2011.10.13

  SB-3CT (1), a selective and potent thiirane-based gelatinase inhibitor, is effective in animal models of cancer metastasis and stroke; however, it is limited by poor aqueous solubility and extensive metabolism. We addressed these issues by blocking the primary site of metabolism and capitalizing on a prodrug strategy to achieve >5000-fold increased solubility. The amide prodrugs were quantitatively hydrolyzed in human blood to a potent gelatinase inhibitor, ND-322 (3). The arginyl amide prodrug (ND-478, 5d) was metabolically stable in mouse, rat, and human liver microsomes. Both 5d and 3 were nonmutagenic in the Ames II mutagenicity assay. The prodrug 5d showed moderate clearance of 0.0582 L/min/kg, remained mostly in the extracellular fluid compartment (Vd = 0.0978 L/kg), and had a terminal half-life of >4 h. The prodrug 5d had superior pharmacokinetic properties than those of 3, making the thiirane class of selective gelatinase inhibitors suitable for intravenous administration in the treatment of acute gelatinase-dependent diseases.
• pH-sensitive cationic lipopeptides for the design of drug-delivery systems
  作者：Yu. L. Sebyakin、U. A. Budanova

  DOI：10.1134/s1068162006050025

  日期：2006.9

  Lipopeptides on the basis of L-glutamic acid and glutamine di- and monoesters with aliphatic alcohols of various lengths that contain L-arginine, L-ornithine, and L-lysine were synthesized. The behavior of these amphiphiles in aqueous medium was shown to depend on their structure.
• [EN] LINKERS, DRUG LINKERS AND CONJUGATES THEREOF AND METHODS OF USING THE SAME<br/>[FR] LIEURS, LIEURS DE MÉDICAMENT, CONJUGUÉS DE CEUX-CI ET LEURS MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：[en]PROFOUNDBIO US CO.

  公开号：WO2023280227A2

  公开（公告）日：2023-01-12

  The present invention provides Polar units, Linker intermediates, Linkers, Drug-Linkers and Conjugates thereof