N,N'-bis(2-nitrobenzenesulfonyl)-bis(3-aminopropyl) ether | 344950-59-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N,N'-bis(2-nitrobenzenesulfonyl)-bis(3-aminopropyl) ether
• 英文别名: bis[3-(2-nitrophenylsulfonylamino)propyl] ether；2-nitro-N-[3-[3-[(2-nitrophenyl)sulfonylamino]propoxy]propyl]benzenesulfonamide
• CAS: 344950-59-0
• 化学式: C₁₈H₂₂N₄O₉S₂
• 分子量: 502.526
• InChiKey: RAOILUXMMTUMHQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  210
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N'-bis(2-nitrobenzenesulfonyl)-bis(3-aminopropyl) ether 在 氢溴酸 、 sodium carbonate 、 溶剂黄146 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 15-(3-aminopropoxy)-3,11-bis(2-nitrobenzenesulfonyl)-7-oxa-3,11,17-triazabicyclo[11.3.1]heptadeca-1(17),13,15-triene
  参考文献：
  名称：

  Design and Synthesis of Fluorescent Probe for Polyhistidine Tag Using Macrocyclic Nickel(II) Complex and Fluorescein Conjugate

  摘要：

  我们报告了一种新设计的聚组氨酸标签（His-tag）靶向荧光探针--NiLODCF，该探针是我们基于荧光团置换机制合成的。我们利用大环镍(II)配合物（NiLO）作为 His-tag 主题的新型结合位点，并选择二氯荧光素（DCF）（=2′,7′-二氯-3′,6′-二羟基螺[异苯并呋喃-1(3H),9′-(9H)氧杂蒽]-3-酮）作为荧光团。在吸收光谱中，NiLODCF 与金属未结合形式（LODCF）相比发生了低色度偏移，这表明 DCF 的酚氧原子直接与 NiLO 复合物相互作用，从而在中性水溶液中产生了有效的荧光淬灭（Φ = 0.084）。当在 NiLODCF 溶液中加入具有六组氨酸序列（H6Y1: YHHHHH）的模型肽时，观察到发射荧光显著增强（Φ = 0.60）。NiLODCF 和 H6Y1 之间的三元复合物的化学计量为 1:1。荧光强度随着 H6Y1 浓度的增加而增加，解离常数（Kd）被测定为 24 ± 1 µM，与 Ni-NTA 复合物和 His6 融合蛋白的解离常数（Kd = 1-20 µM）一致。这些结果表明，大环 NiLO 可作为多组氨酸序列的新型结合位点，NiLODCF 将适用于此类 His 标记蛋白质的可切换荧光探针。

  DOI：

  10.1246/bcsj.20100288
• 作为产物：
  描述：

  氨基丙基醚 、 邻硝基苯磺酰氯 在 碳酸氢钠 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 N,N'-bis(2-nitrobenzenesulfonyl)-bis(3-aminopropyl) ether
  参考文献：
  名称：

  Design and Synthesis of Fluorescent Probe for Polyhistidine Tag Using Macrocyclic Nickel(II) Complex and Fluorescein Conjugate

  摘要：

  我们报告了一种新设计的聚组氨酸标签（His-tag）靶向荧光探针--NiLODCF，该探针是我们基于荧光团置换机制合成的。我们利用大环镍(II)配合物（NiLO）作为 His-tag 主题的新型结合位点，并选择二氯荧光素（DCF）（=2′,7′-二氯-3′,6′-二羟基螺[异苯并呋喃-1(3H),9′-(9H)氧杂蒽]-3-酮）作为荧光团。在吸收光谱中，NiLODCF 与金属未结合形式（LODCF）相比发生了低色度偏移，这表明 DCF 的酚氧原子直接与 NiLO 复合物相互作用，从而在中性水溶液中产生了有效的荧光淬灭（Φ = 0.084）。当在 NiLODCF 溶液中加入具有六组氨酸序列（H6Y1: YHHHHH）的模型肽时，观察到发射荧光显著增强（Φ = 0.60）。NiLODCF 和 H6Y1 之间的三元复合物的化学计量为 1:1。荧光强度随着 H6Y1 浓度的增加而增加，解离常数（Kd）被测定为 24 ± 1 µM，与 Ni-NTA 复合物和 His6 融合蛋白的解离常数（Kd = 1-20 µM）一致。这些结果表明，大环 NiLO 可作为多组氨酸序列的新型结合位点，NiLODCF 将适用于此类 His 标记蛋白质的可切换荧光探针。

  DOI：

  10.1246/bcsj.20100288

文献信息

• Synthesis and Structure−Activity Relationships of Azamacrocyclic C-X-C Chemokine Receptor 4 Antagonists: Analogues Containing a Single Azamacrocyclic Ring are Potent Inhibitors of T-Cell Tropic (X4) HIV-1 Replication
  作者：Gary J. Bridger、Renato T. Skerlj、Pedro E. Hernandez-Abad、David E. Bogucki、Zhongren Wang、Yuanxi Zhou、Susan Nan、Eva M. Boehringer、Trevor Wilson、Jason Crawford、Markus Metz、Sigrid Hatse、Katrien Princen、Erik De Clercq、Dominique Schols

  DOI：10.1021/jm901530b

  日期：2010.2.11

  bicyclam AMD3100 (1) are a class of potent and selective anti-HIV-1 agents that inhibit virus replication by binding to the chemokine receptor CXCR4, the coreceptor for entry of X4 viruses. By sequential replacement and/or deletion of the amino groups within the azamacrocyclic ring systems, we have determined the minimum structural features required for potent antiviral activity in this class of compounds

  Bis-tetraazamacrocycles，例如bicyclam AMD3100（1），是一类有效的选择性HIV-1药物，可通过与趋化因子受体CXCR4（X4病毒进入的核心受体）结合而抑制病毒复制。通过连续置换和/或删除氮杂大环系统中的氨基，我们确定了此类化合物中强效抗病毒活性所需的最小结构特征。活性并不需要全部八个氨基，每个环上的关键氨基是不相同的，并且可以在不影响效能的情况下降低生理pH值下的总电荷。这种方法导致鉴定了几种单环氮杂大环类似物，例如AMD3465（3d），36，和40，分别对9.0、1.0和4.0 nM的HIV-1的细胞毒性作用表现出EC 50，抗病毒效力可与1相当（对HIV-1的4.0 nM的EC 50）。但是，更重要的是，抗病毒活性所需的1的关键结构要素可能有助于设计适合于通过口服HIV治疗的非大环CXCR4拮抗剂。
• Design and Synthesis of Fluorescent Probe for Polyhistidine Tag Using Macrocyclic Nickel(II) Complex and Fluorescein Conjugate
  作者：Masayasu Taki、Fumiyoshi Asahi、Tasuku Hirayama、Yukio Yamamoto

  DOI：10.1246/bcsj.20100288

  日期：2011.4.15

  We report a newly designed polyhistidine tag (His-tag) targeting fluorescent probe, NiLODCF, which we synthesized based on the fluorophore displacement mechanism. A macrocyclic nickel(II) complex (NiLO) was employed as a novel binding site for a His-tag motif, and we chose dichlorofluorescein (DCF) (=2′,7′-dichloro-3′,6′-dihydroxyspiro[isobenzofuran-1(3H),9′-(9H)xanthen]-3-one) as the fluorophore. A hypochromic shift of NiLODCF from the metal-unbound form (LODCF) in the absorption spectrum suggested that the phenolic oxygen atom of DCF interacted directly with the NiLO complex, resulting in efficient fluorescence quenching (Φ = 0.084) in a neutral aqueous solution. When a model peptide having a hexahistidine sequence (H6Y1: YHHHHHH) was added to the solution of NiLODCF, a significant fluorescence enhancement in the emission (Φ = 0.60) was observed. The stoichiometry of the ternary complex between NiLODCF and H6Y1 was 1:1. The fluorescence intensity increased as the concentration of H6Y1 increased, and the dissociation constant (Kd) was determined to be 24 ± 1 µM, consistent with that for the Ni–NTA complex and His6-fused proteins (Kd = 1–20 µM). These results indicate that macrocyclic NiLO can serve as a novel binding site for the polyhistidine sequence and that NiLODCF would be applicable to a switchable fluorescent probe for such His-tagged proteins.

  我们报告了一种新设计的聚组氨酸标签（His-tag）靶向荧光探针--NiLODCF，该探针是我们基于荧光团置换机制合成的。我们利用大环镍(II)配合物（NiLO）作为 His-tag 主题的新型结合位点，并选择二氯荧光素（DCF）（=2′,7′-二氯-3′,6′-二羟基螺[异苯并呋喃-1(3H),9′-(9H)氧杂蒽]-3-酮）作为荧光团。在吸收光谱中，NiLODCF 与金属未结合形式（LODCF）相比发生了低色度偏移，这表明 DCF 的酚氧原子直接与 NiLO 复合物相互作用，从而在中性水溶液中产生了有效的荧光淬灭（Φ = 0.084）。当在 NiLODCF 溶液中加入具有六组氨酸序列（H6Y1: YHHHHH）的模型肽时，观察到发射荧光显著增强（Φ = 0.60）。NiLODCF 和 H6Y1 之间的三元复合物的化学计量为 1:1。荧光强度随着 H6Y1 浓度的增加而增加，解离常数（Kd）被测定为 24 ± 1 µM，与 Ni-NTA 复合物和 His6 融合蛋白的解离常数（Kd = 1-20 µM）一致。这些结果表明，大环 NiLO 可作为多组氨酸序列的新型结合位点，NiLODCF 将适用于此类 His 标记蛋白质的可切换荧光探针。