3',5'-bis-O-isobutyryl-2'-deoxyguanosine | 104706-81-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 3',5'-bis-O-isobutyryl-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: isobutyryl(-3)[isobutyryl(-5)]2-deoxy-D-eryPenf(b)-guanin-9-yl；[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-(2-methylpropanoyloxy)oxolan-2-yl]methyl 2-methylpropanoate
• CAS: 104706-81-2
• 化学式: C₁₈H₂₅N₅O₆
• 分子量: 407.426
• InChiKey: GCACLCRLDFYTKY-QJPTWQEYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.53±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-bis-O-isobutyryl-2'-deoxyguanosine 在 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 97.0h， 生成 O6-carboxymethyl-2'-deoxyguanosine sodium salt
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of deuterium and C-13-labelled ethyl glycolate and their subsequent use in the synthesis of labelled analogues of the DNA adduct O6-carboxymethyl-2′-deoxyguanosine

  摘要：

  加合物 O6-羧甲基-2′-脱氧鸟苷（O6CMdG）非常重要，因为它曾与人类的高红肉饮食有关，但由于缺乏适当的标准，至今尚未开发出液相色谱-质谱（LC-MS）方法。合成氚代和 C-13 类似物需要使用[2H2]-和[13C2]乙醇酸乙酯来标记 O6CMdG 的羧甲基。[2H2]Ethyl glycolate 是通过使用氚代溶剂对重氮乙酸乙酯进行酸水解合成的（产率为 59%），而 [13C2]ethyl glycolate 则是通过三步法从 [13C2]glycine 合成的（产率为 35%）。标记的乙醇酸乙酯随后被用于合成 [2H2]- 和 [13C2]O6CMdG，以便将来在生物样本的 LC-MS 分析中用作内标。版权 © 2011 John Wiley & Sons, Ltd. 保留所有权利。

  DOI：

  10.1002/jlcr.1923
• 作为产物：
  描述：

  异丁酸酐 、 2'-脱氧鸟苷 在 4-二甲氨基吡啶 、 碳酸氢钠 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 18.0h， 以85%的产率得到3',5'-bis-O-isobutyryl-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of deuterium and C-13-labelled ethyl glycolate and their subsequent use in the synthesis of labelled analogues of the DNA adduct O6-carboxymethyl-2′-deoxyguanosine

  摘要：

  加合物 O6-羧甲基-2′-脱氧鸟苷（O6CMdG）非常重要，因为它曾与人类的高红肉饮食有关，但由于缺乏适当的标准，至今尚未开发出液相色谱-质谱（LC-MS）方法。合成氚代和 C-13 类似物需要使用[2H2]-和[13C2]乙醇酸乙酯来标记 O6CMdG 的羧甲基。[2H2]Ethyl glycolate 是通过使用氚代溶剂对重氮乙酸乙酯进行酸水解合成的（产率为 59%），而 [13C2]ethyl glycolate 则是通过三步法从 [13C2]glycine 合成的（产率为 35%）。标记的乙醇酸乙酯随后被用于合成 [2H2]- 和 [13C2]O6CMdG，以便将来在生物样本的 LC-MS 分析中用作内标。版权 © 2011 John Wiley & Sons, Ltd. 保留所有权利。

  DOI：

  10.1002/jlcr.1923

文献信息

• Synthesis of 8-Heteroaryl-2′-deoxyguanosine Derivatives
  作者：José Rivera、Gerard Hobley、Vladimir Gubala、María Del C. Rivera-Sánchez

  DOI：10.1055/s-2007-1077795

  日期：2008.6

  We describe the synthesis of 8-heteroaromatic-2′-de­oxyguanosine analogues using Suzuki-Miyaura or Stille conditions. Unprotected and protected 8-bromo-2′-deoxyguanosine was coupled with commercially available heteroarylboronic acids or the trialkyltin derivatives of 2-pyridylbromides either with or without microwave irradiation in good yields.

  我们介绍了利用铃木-宫浦或 Stille 条件合成 8-杂芳基-2′-脱氧鸟苷类似物的方法。在使用或不使用微波辐照的情况下，将未受保护和受保护的 8-溴-2′-脱氧鸟苷与市售的杂芳基硼酸或 2-吡啶溴化物的三烷基锡衍生物进行偶联，产量很高。
• A Convenient Method for the Selective Acylation of Guanine Nucleosides
  作者：A. Matsuda、M. Shinozaki、M. Suzuki、K. Watanabe、T Miyasaka

  DOI：10.1055/s-1986-31644

  日期：——
• Expanding the Hoogsteen Edge of 2‘-Deoxyguanosine:  Consequences for G-Quadruplex Formation
  作者：Vladimir Gubala、José E. Betancourt、José M. Rivera

  DOI：10.1021/ol048013v

  日期：2004.12.1

  The synthesis and self-assembling properties of 8-aryl-2'-deoxyguanosine derivatives are described. Our studies suggest that a properly placed acetyl group can increase the stability and specificity of the resulting G-quadruplex supramolecules by enhancing noncovalent interactions such as hydrogen bonds and z-stacking.
• Synthesis of deuterium and C-13-labelled ethyl glycolate and their subsequent use in the synthesis of labelled analogues of the DNA adduct O6-carboxymethyl-2′-deoxyguanosine
  作者：Sharon A. Moore、David E. G. Shuker

  DOI：10.1002/jlcr.1923

  日期：2011.12

  The adduct O6-carboxymethyl-2′-deoxyguanosine (O6CMdG) is of importance as it has been previously linked to high red meat diet in humans, and as yet, a liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) method has not been developed due to lack of appropriate standards. The synthesis of the deuterated and C-13 analogues required the use of [2H2]- and [13C2]ethyl glycolate to label the carboxymethyl moiety of O6CMdG. [2H2]Ethyl glycolate was synthesised via acid hydrolysis of ethyl diazoacetate using deuterated solvents (59% yield), whilst [13C2]ethyl glycolate was synthesised from [13C2]glycine in a three-step procedure (35% yield). The labelled ethyl glycolates were then used to synthesise [2H2]- and [13C2]O6CMdG for future use as internal standards in the LC-MS analysis of biological samples. Copyright © 2011 John Wiley & Sons, Ltd.

  加合物 O6-羧甲基-2′-脱氧鸟苷（O6CMdG）非常重要，因为它曾与人类的高红肉饮食有关，但由于缺乏适当的标准，至今尚未开发出液相色谱-质谱（LC-MS）方法。合成氚代和 C-13 类似物需要使用[2H2]-和[13C2]乙醇酸乙酯来标记 O6CMdG 的羧甲基。[2H2]Ethyl glycolate 是通过使用氚代溶剂对重氮乙酸乙酯进行酸水解合成的（产率为 59%），而 [13C2]ethyl glycolate 则是通过三步法从 [13C2]glycine 合成的（产率为 35%）。标记的乙醇酸乙酯随后被用于合成 [2H2]- 和 [13C2]O6CMdG，以便将来在生物样本的 LC-MS 分析中用作内标。版权 © 2011 John Wiley & Sons, Ltd. 保留所有权利。