N²-(deoxyguanosine-8-yl)-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole | 269736-22-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N²-(deoxyguanosine-8-yl)-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole
• 英文别名: N-(deoxyguanosin-8-yl)-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole；2'-Deoxy-8-[(9H-pyrido[2,3-b]indol-2-yl)amino]guanosine；2-amino-9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-8-(9H-pyrido[2,3-b]indol-2-ylamino)-1H-purin-6-one
• CAS: 269736-22-3
• 化学式: C₂₁H₂₀N₈O₄
• 分子量: 448.441
• InChiKey: ZRBVUIRPSABEGI-GZBFAFLISA-N

物化性质

• 沸点：
  909.7±75.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.92±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  176
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²-(deoxyguanosine-8-yl)-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 2-(guanin-8-yl)amino-9H-pyrido[2,3-b]indole
  参考文献：
  名称：

  模型致癌物 2-N-(新戊酰氧基)-2-氨基-α-咔啉在水溶液中分解过程中产生的 2-(α-Carbolinyl) nitrenium 离子及其共轭碱的表征

  摘要：

  模型最终致癌物 2-N-(新戊酰氧基)-2-氨基-α-咔啉 (4a) 及其 9-甲基类似物 (4b) 在 20 vol% CH3CN-H2O 中的分解动力学，μ = 0.5 (NaClO4) 在 20 °C 时，与中性酯的未催化 N-O 键杂解一致。通过动力学和分光光度滴定法检测到的质子化酯 4aH+ (pKa = 1.6) 在这些条件下是不反应的。4b 的分光光度滴定也表明在酸性条件下形成了质子化物质 4bH+ (pKa = 0.9)。4a 和 4b 都产生亲电子中间体，确定为氮鎓离子 5a 和 5b，它们被 N3-、Br-和 2'-脱氧鸟苷、dG 有效捕获，而酯的整体分解速率没有增加。N3- 和 dG 捕获效率，kaz+/ks+ 和 kd-G+/ks+，对于 5a 和 5b，它们彼此非常相似，并且与之前对 2-芴基硝基鎓离子 (6) 测量的 N3- 和 dG 的捕获效率相差 4 倍。该车

  DOI：

  10.1021/ja993433e
• 作为产物：
  描述：

  N-acetyloxy-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole 、 2'-脱氧鸟苷 生成 N²-(deoxyguanosine-8-yl)-2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole
  参考文献：
  名称：

  通过线性四极杆离子阱/多级串联质谱法鉴定人唾液中的致癌物 DNA 加合物

  摘要：

  通过液相色谱-电喷雾电离/多级串联质谱 (LC-ESI/MS/MS n ) 在来自 37 名无限制饮食的人类志愿者的唾液样本中鉴定了源自烟草烟雾和熟肉的致癌物的 DNA 加合物。杂环芳香胺 2-amino-1-methyl-6-phenylimidazo[4,5- b ]pyridine (PhIP), 2-amino-9 H的N -(deoxyguanosin-8-yl) (dG-C8) 加合物-吡啶并[2,3- b ]吲哚(AαC)、2-氨基-3,8-二甲基咪唑[4,5- f ]喹喔啉(MeIQx)和芳香胺4-氨基联苯(4-ABP)是通过 LC-ESI/MS/MS n 进行表征和定量，在 MS 3处采用连续反应监测使用线性四极杆离子阱 (LIT) 质谱仪 (MS) 的扫描阶段模式。PhIP 的 DNA 加合物最常被发现：dG-C8-PhIP 在 29 名曾经吸烟者中有 13 名的唾液样本和

  DOI：

  10.1021/tx100098f

文献信息

• Kinetics of Hydrolysis of 8-(Arylamino)-2‘-deoxyguanosines
  作者：Michael Novak、Megan Ruenz、Shahrokh Kazerani、Krisztina Toth、Thach-Mien Nguyen、Brian Heinrich

  DOI：10.1021/jo0163492

  日期：2002.4.1

  the C-N bond of the neutral nucleoside, 1, occurs that has not been previously reported for simple purine nucleosides. Finally, under mildly alkaline conditions a process consistent with spontaneous decomposition of the anion 1(-) or OH(-)-induced decomposition of 1 is observed. The latter process has been observed for other purine nucleosides, including the closely related 1d, and involves nucleophilic

  8-（芳基氨基）-2'-脱氧鸟苷或C-8加合物是由衍生自致癌胺和诱变胺的N-芳基氮鎓离子与DNA的2'-脱氧鸟苷（dG）和鸟苷残基反应形成的主要加合物。通过UV和HPLC方法在20℃在酸性，中性和弱碱性条件下测定三种C-8加合物1a-c的水解动力学。在pH <2时，主要的水解过程是双质子化底物1H（2）（+ 2）的CN键的自发裂解（方案2）。在这些条件下，C-8加合物的反应活性比dG高2至5倍。在3
• Screening for DNA Adducts by Data-Dependent Constant Neutral Loss-Triple Stage Mass Spectrometry with a Linear Quadrupole Ion Trap Mass Spectrometer
  作者：Erin E. Bessette、Angela K. Goodenough、Sophie Langouët、Isil Yasa、Ivan D. Kozekov、Simon D. Spivack、Robert J. Turesky

  DOI：10.1021/ac802096p

  日期：2009.1.15

  A two-dimensional linear quadrupole ion trap mass spectrometer (LIT/MS) was employed to simultaneously screen for DNA adducts of environmental, dietary, and endogenous genotoxicants, by data-dependent constant neutral loss scanning followed by triple-stage mass spectrometry (CNL-MS3). The loss of the deoxyribose (dR) from the protonated DNA adducts ([M + H − 116]+) in the MS/MS scan mode triggered the acquisition of MS3 product ion spectra of the aglycone adducts [BH2]+. Five DNA adducts of the tobacco carcinogen 4-aminobiphenyl (4-ABP) were detected in human hepatocytes treated with 4-ABP, and three DNA adducts of the cooked-meat carcinogen 2-amino-3,8-dimethylimidazo[4,5-f]quinoxaline (MeIQx) were identified in the livers of rats exposed to MeIQx, by the CNL-MS3 scan mode. Buccal cell DNA from tobacco smokers was screened for DNA adducts of various classes of carcinogens in tobacco smoke including 4-ABP, 2-amino-9H-pyrido[2,3-b]indole (AαC), and benzo[a]pyrene (BaP); the cooked-meat carcinogens MeIQx, AαC, and 2-amino-1-methyl-6-phenylmidazo[4,5-b]pyridine (PhIP); and the lipid peroxidation products acrolein (AC) and trans-4-hydroxynonenal (HNE). The CNL-MS3 scanning technique can be used to simultaneously screen for multiple DNA adducts derived from different classes of carcinogens, at levels of adduct modification approaching 1 adduct per 108 unmodified DNA bases, when 10 μg of DNA is employed for the assay.

  利用二维线性四极杆离子阱质谱仪（LIT/MS），通过数据依赖性恒定中性损失扫描和三级质谱（CNL-MS3），同时筛选环境、饮食和内源性基因毒性物质的 DNA 加合物。在 MS/MS 扫描模式下，质子化 DNA 加合物（[M + H - 116]+）中脱氧核糖（dR）的损失触发了琼脂糖核苷酸加合物 [BH2]+ 的 MS3 产物离子谱的获取。通过 CNL-MS3 扫描模式，在经 4-ABP 处理的人类肝细胞中检测到五种烟草致癌物 4- 氨基联苯（4-ABP）的 DNA 加合物，在暴露于 MeIQx 的大鼠肝脏中检测到三种熟肉致癌物 2-氨基-3,8-二甲基咪唑并[4,5-f]喹喔啉（MeIQx）的 DNA 加合物。对烟草烟雾中各类致癌物质（包括 4-ABP、2-氨基-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚（AαC）和苯并[a]芘（BaP））的 DNA 加合物进行了筛查；熟肉致癌物 MeIQx、AαC 和 2-氨基-1-甲基-6-苯基咪唑并[4,5-b]吡啶 (PhIP)；以及脂质过氧化产物丙烯醛 (AC) 和反式-4-羟基壬烯醛 (HNE)。CNL-MS3 扫描技术可用于同时筛查来自不同类别致癌物的多种 DNA 加合物，当使用 10 μg DNA 进行检测时，加合物修饰水平接近每 108 个未修饰 DNA 碱基 1 个加合物。
• Characterization of the 2-(α-Carbolinyl)nitrenium Ion and Its Conjugate Base Produced during the Decomposition of the Model Carcinogen 2-<i>N</i>-(Pivaloyloxy)-2-amino-α-carboline in Aqueous Solution
  作者：Michael Novak、Shahrokh Kazerani

  DOI：10.1021/ja993433e

  日期：2000.4.1

  The kinetics of the decomposition of the model ultimate carcinogen 2-N-(pivaloyloxy)-2-amino-α-carboline (4a), and its 9-methyl analogue (4b), in 20 vol % CH3CN−H2O, μ = 0.5 (NaClO4) at 20 °C, are consistent with the uncatalyzed N−O bond heterolysis of the neutral esters. The protonated ester 4aH+ (pKa = 1.6), detected kinetically and by spectrophotometric titration, is unreactive under these conditions

  模型最终致癌物 2-N-(新戊酰氧基)-2-氨基-α-咔啉 (4a) 及其 9-甲基类似物 (4b) 在 20 vol% CH3CN-H2O 中的分解动力学，μ = 0.5 (NaClO4) 在 20 °C 时，与中性酯的未催化 N-O 键杂解一致。通过动力学和分光光度滴定法检测到的质子化酯 4aH+ (pKa = 1.6) 在这些条件下是不反应的。4b 的分光光度滴定也表明在酸性条件下形成了质子化物质 4bH+ (pKa = 0.9)。4a 和 4b 都产生亲电子中间体，确定为氮鎓离子 5a 和 5b，它们被 N3-、Br-和 2'-脱氧鸟苷、dG 有效捕获，而酯的整体分解速率没有增加。N3- 和 dG 捕获效率，kaz+/ks+ 和 kd-G+/ks+，对于 5a 和 5b，它们彼此非常相似，并且与之前对 2-芴基硝基鎓离子 (6) 测量的 N3- 和 dG 的捕获效率相差 4 倍。该车
• Identification of Carcinogen DNA Adducts in Human Saliva by Linear Quadrupole Ion Trap/Multistage Tandem Mass Spectrometry
  作者：Erin E. Bessette、Simon D. Spivack、Angela K. Goodenough、Tao Wang、Shailesh Pinto、Fred F. Kadlubar、Robert J. Turesky

  DOI：10.1021/tx100098f

  日期：2010.7.19

  DNA adducts of carcinogens derived from tobacco smoke and cooked meat were identified by liquid chromatography−electrospray ionization/multistage tandem mass spectrometry (LC-ESI/MS/MSn) in saliva samples from 37 human volunteers on unrestricted diets. The N-(deoxyguanosin-8-yl) (dG-C8) adducts of the heterocyclic aromatic amines 2-amino-1-methyl-6-phenylimidazo[4,5-b]pyridine (PhIP), 2-amino-9H-pyrido[2

  通过液相色谱-电喷雾电离/多级串联质谱 (LC-ESI/MS/MS n ) 在来自 37 名无限制饮食的人类志愿者的唾液样本中鉴定了源自烟草烟雾和熟肉的致癌物的 DNA 加合物。杂环芳香胺 2-amino-1-methyl-6-phenylimidazo[4,5- b ]pyridine (PhIP), 2-amino-9 H的N -(deoxyguanosin-8-yl) (dG-C8) 加合物-吡啶并[2,3- b ]吲哚(AαC)、2-氨基-3,8-二甲基咪唑[4,5- f ]喹喔啉(MeIQx)和芳香胺4-氨基联苯(4-ABP)是通过 LC-ESI/MS/MS n 进行表征和定量，在 MS 3处采用连续反应监测使用线性四极杆离子阱 (LIT) 质谱仪 (MS) 的扫描阶段模式。PhIP 的 DNA 加合物最常被发现：dG-C8-PhIP 在 29 名曾经吸烟者中有 13 名的唾液样本和