[(1R)-1-[3-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethylamino]-2-oxoethoxy]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate | 919519-98-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 直链 1,3-二芳基丙烷
• 英文名称: [(1R)-1-[3-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethylamino]-2-oxoethoxy]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate
• CAS: 919519-98-5
• 化学式: C₃₈H₅₅N₃O₁₀
• 分子量: 713.869
• InChiKey: YDIQNOIFMNLESD-IOWSJCHKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  165
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(1R)-1-[3-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethylamino]-2-oxoethoxy]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate 、 6-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 以7.5 mg的产率得到4-((2-(2-(2-(2-(3-((R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(((S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carbonyl)oxy)propyl)phenoxy)acetamido)ethoxy)ethoxy)ethyl)carbamoyl)-2-(6-(dimethylamino)-3-(dimethyliminio)-3H-xanthen-9-yl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  靶向共价抑制疟原虫FK506结合蛋白35

  摘要：

  FK506结合蛋白35，FKBP35，已被认为是必需的疟疾酶。雷帕霉素和FK506在培养的寄生虫中表现出抗疟原虫活性。然而，由于FKBP的结合口袋的高度保守的性质和这些药物的免疫抑制特性，需要选择性地抑制FKBP35并且缺乏不良副作用的化合物。与人FKBP相比，FKBP35在雷帕霉素结合口袋附近包含一个半胱氨酸C106，为开发靶向疟原虫FKBP35的共价抑制剂提供了机会。在这里，我们合成了FKBP35的抑制剂，表明它们在模型细胞环境中直接结合FKBP35，选择性地共价修饰C106，并在血阶段培养的寄生虫中表现出抗疟原虫活性。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00272
• 作为产物：
  描述：

  H-高脯氨酸-OMe盐酸盐 在 4-二甲氨基吡啶 、 碘代三甲硅烷 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.17h， 生成 [(1R)-1-[3-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethylamino]-2-oxoethoxy]phenyl]-3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl] (2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  靶向共价抑制疟原虫FK506结合蛋白35

  摘要：

  FK506结合蛋白35，FKBP35，已被认为是必需的疟疾酶。雷帕霉素和FK506在培养的寄生虫中表现出抗疟原虫活性。然而，由于FKBP的结合口袋的高度保守的性质和这些药物的免疫抑制特性，需要选择性地抑制FKBP35并且缺乏不良副作用的化合物。与人FKBP相比，FKBP35在雷帕霉素结合口袋附近包含一个半胱氨酸C106，为开发靶向疟原虫FKBP35的共价抑制剂提供了机会。在这里，我们合成了FKBP35的抑制剂，表明它们在模型细胞环境中直接结合FKBP35，选择性地共价修饰C106，并在血阶段培养的寄生虫中表现出抗疟原虫活性。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00272

文献信息

• Fluorophore Labeling of Native FKBP12 by Ligand-Directed Tosyl Chemistry Allows Detection of Its Molecular Interactions in Vitro and in Living Cells
  作者：Tomonori Tamura、Yoshiyuki Kioi、Takayuki Miki、Shinya Tsukiji、Itaru Hamachi

  DOI：10.1021/ja401956b

  日期：2013.5.8

  specific endogenous proteins and analyzing their function in living cells are a great challenge in chemical biology. Toward this end, we demonstrate the target-selective and site-specific fluorescent labeling of native FKBP12 (FK506-binding protein 12) in vitro and in living cells using ligand-directed tosyl (LDT) chemistry. The LDT-mediated labeling yielded a semisynthetic FKBP12 containing the Oregon green

  将合成荧光团引入特定的内源性蛋白质并分析它们在活细胞中的功能是化学生物学中的一项巨大挑战。为此，我们使用配体定向甲苯磺酰 (LDT) 化学在体外和活细胞中证明了天然 FKBP12（FK506 结合蛋白 12）的目标选择性和位点特异性荧光标记。LDT 介导的标记产生了一种半合成的 FKBP12，在催化口袋附近含有俄勒冈绿 (OG) 染料。OG 标记的 FKBP12 (OG-FKBP12) 充当荧光报告分子，允许在体外监测其与雷帕霉素和 FRB（FKBP-雷帕​​霉素结合域）的相互作用。
• SMALL MOLECULE PRINTING
  申请人：Barnes David W.

  公开号：US20130261023A1

  公开（公告）日：2013-10-03

  The present invention provides compositions and methods to facilitate the identification of compounds that are capable of interacting with a biological macromolecule of interest. In one aspect, a composition is provided that comprises an array of one or more types of chemical compounds attached to a solid support using isocyanate or isothiocyanate chemistry, wherein the density of the array of compounds is at least 1000 spots per cm 2 . In general, these inventive arrays are generated by: (1) providing a solid support, wherein said solid support is functionalized with an isocyanate or isothiocyanate moiety capable of interacting with a desired chemical compound to form a covalent attachment; (2) providing one or more solutions of one or more types of compounds to be attached to the solid support; (3) delivering said one or more types of compounds to the solid support; and (4) catalyzing the attachment of the compound to the solid support, whereby an array is formed and the array of compounds has a density of at least 1000 spots per cm 2 . In another aspect, the present invention provides methods for utilizing these arrays to identify small molecule partners for biological macromolecules of interest.