penta N-benzyloxycarbonyl-apramycin | 82002-36-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: penta N-benzyloxycarbonyl-apramycin
• 英文别名: 1,3,2',7',4"-pentakis-N-(benzyloxycarbonyl)apramycin；penta-N-Cbz-apramycin；benzyl N-[(2R,3S,4R,4aR,6S,7R,8aS)-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-2,3-dihydroxy-4,6-bis(phenylmethoxycarbonylamino)cyclohexyl]oxy-2-[(2R,3R,4S,5S,6S)-3,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-(phenylmethoxycarbonylamino)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-7-(phenylmethoxycarbonylamino)-2,3,4,4a,6,7,8,8a-octahydropyrano[3,2-b]pyran-3-yl]-N-methylcarbamate
• CAS: 82002-36-6
• 化学式: C₆₁H₇₁N₅O₂₁
• 分子量: 1210.26
• InChiKey: SIZDDCVIZYYNAY-GWJMLISPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  87
• 可旋转键数：
  25
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  350
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  penta N-benzyloxycarbonyl-apramycin 在 barium hydroxide octahydrate 、 水 、 sodium hydride 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 1,3,2'-tris-N-(benzyloxycarbonyl)-7'-N,6'-O-carbonyl-apramycin
  参考文献：
  名称：

  TREATMENT OF BACTERIAL INFECTIOUS DISEASES

  摘要：

  本发明涉及一种新型的药理治疗人类细菌感染疾病的方法。具体而言，该发明涉及使用式（I）的阿帕霉素或阿帕霉素衍生物来治疗人类细菌感染疾病。实验证明，阿帕霉素出人意料地并没有观察到与相关氨基糖苷类抗生素相似的高毒性水平，而实际上甚至比已在人类医学中使用的庆大霉素等化合物毒性显著更低。

  公开号：

  US20130165397A1
• 作为产物：
  描述：

  安普霉素 、 氯甲酸苄酯 在 sodium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 生成 penta N-benzyloxycarbonyl-apramycin
  参考文献：
  名称：

  安普霉素生物合成过程中八糖核心的生物合成起源及其组装机​​制

  摘要：

  安普霉素是一种从链球菌和印度链球菌中分离出来的氨基糖苷类抗生素，已在兽医学中得到临床应用。安普霉素结构以其非典型的八碳双环二醛糖（辛糖）部分而闻名。虽然安普霉素生物合成基因簇 ( apr ) 已被鉴定，并且几个编码基因的功能得到表征，但辛糖核心本身的组装方式仍然难以捉摸。然而，最近的基因缺失研究暗示N-乙酰氨基糖是辛糖的关键前体，并且这一假设与本报告中描述的其他喂养实验一致。此外，生物信息学分析表明，AprG 可能在结构上与 GlcNAc-2-差向异构酶相似，因此可识别 GlcNAc 或结构相似的底物，表明在辛糖形成中具有潜在作用。因此，具有延伸的N末端序列的 AprG 在体外被表达、纯化和测定，证明它确实催化 GlcNAc 或 GalNAc 与 6'-氧代-柠檬酸之间的转醛醇反应，以提供具有相同 6 的 7'- N-乙酰基去甲基阿普罗胺。 ' -R和 7'- S立体化学与安普霉素产品中观

  DOI：

  10.1021/jacs.3c06354

文献信息

• EP3330275
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Selective Inhibition of Bacterial and Human Topoisomerases by <i>N</i>-Arylacyl <i>O</i>-Sulfonated Aminoglycoside Derivatives
  作者：Amanda M. Fenner、Lisa M. Oppegard、Hiroshi Hiasa、Robert J. Kerns

  DOI：10.1021/ml3004507

  日期：2013.5.9

  Numerous therapeutic applications have been proposed for molecules that bind heparin-binding proteins. Development of such compounds has primarily focused on optimizing the degree and orientation of anionic groups on a scaffold, but utility of these polyanions has been diminished by their typically large size and nonspecific interactions with many proteins. In this study, N-arylacyl O-sulfonated aminoglycosides were synthesized and evaluated for their ability to selectively inhibit structurally similar bacterial and human topoisomerases. It is demonstrated that the structure of the aminoglycoside and of the N-arylacyl moiety imparts selective inhibition of different topoisomerases and alters the mechanism. The results here outline a strategy that will be applicable to identifying small, structurally defined oligosaccharides that bind heparin-binding proteins with a high degree of selectivity.
• TREATMENT OF BACTERIAL INFECTIOUS DISEASES
  申请人：Boettger Erik

  公开号：US20130165397A1

  公开（公告）日：2013-06-27

  The present invention relates to a novel pharmacological treatment of bacterial infectious diseases in humans. Specifically the invention relates to the use of apramycin of formula (I) or apramycin derivatives to treat bacterial infectious diseases in humans. It is demonstrated that apramycin surprisingly does not have the expected high level of toxicity observed with related aminoglycoside antibiotics but actually is even significantly less toxic than compounds already used in human medicine such as gentamicin.

  本发明涉及一种新型的药理治疗人类细菌感染疾病的方法。具体而言，该发明涉及使用式（I）的阿帕霉素或阿帕霉素衍生物来治疗人类细菌感染疾病。实验证明，阿帕霉素出人意料地并没有观察到与相关氨基糖苷类抗生素相似的高毒性水平，而实际上甚至比已在人类医学中使用的庆大霉素等化合物毒性显著更低。
• Biosynthetic Origin of the Octose Core and Its Mechanism of Assembly during Apramycin Biosynthesis
  作者：Po-Hsun Fan、Shusuke Sato、Yu-Cheng Yeh、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.3c06354

  日期：2023.10.4

  Apramycin is an aminoglycoside antibiotic isolated from Streptoalloteichus tenebrarius and S. hindustanus that has found clinical use in veterinary medicine. The apramycin structure is notable for its atypical eight-carbon bicyclic dialdose (octose) moiety. While the apramycin biosynthetic gene cluster (apr) has been identified and several of the encoded genes functionally characterized, how the octose

  安普霉素是一种从链球菌和印度链球菌中分离出来的氨基糖苷类抗生素，已在兽医学中得到临床应用。安普霉素结构以其非典型的八碳双环二醛糖（辛糖）部分而闻名。虽然安普霉素生物合成基因簇 ( apr ) 已被鉴定，并且几个编码基因的功能得到表征，但辛糖核心本身的组装方式仍然难以捉摸。然而，最近的基因缺失研究暗示N-乙酰氨基糖是辛糖的关键前体，并且这一假设与本报告中描述的其他喂养实验一致。此外，生物信息学分析表明，AprG 可能在结构上与 GlcNAc-2-差向异构酶相似，因此可识别 GlcNAc 或结构相似的底物，表明在辛糖形成中具有潜在作用。因此，具有延伸的N末端序列的 AprG 在体外被表达、纯化和测定，证明它确实催化 GlcNAc 或 GalNAc 与 6'-氧代-柠檬酸之间的转醛醇反应，以提供具有相同 6 的 7'- N-乙酰基去甲基阿普罗胺。 ' -R和 7'- S立体化学与安普霉素产品中观