1-(3-methylbutyl)-1H-indole-3-carbaldehyde | 1176037-50-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-(3-methylbutyl)-1H-indole-3-carbaldehyde
• 英文别名: 1-isopentyl-1H-indol-3-carboxaldehyde；1-isopentyl-1H-indole-3-carbaldehyde；1-(3-methyl-1-butyl)-1H-indole-3-carbaldehyde；1-(3-Methylbutyl)indole-3-carbaldehyde
• CAS: 1176037-50-5
• 化学式: C₁₄H₁₇NO
• 分子量: 215.295
• InChiKey: PFBJXBLYZUVFPX-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  358.8±15.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.03±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  22
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-methylbutyl)-1H-indole-3-carbaldehyde 在 sodium ethanolate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 6-(1-pentyl-1H-indol-3-yl)-2,4-dioxo-5-hexenoic acid
  参考文献：
  名称：

  终端脱氧核苷酸转移酶的新型核苷酸竞争性非核苷抑制剂：发现，表征和晶体结构与目标复杂。

  摘要：

  末端脱氧核糖核酸转移酶（TdT）在某些类型的癌症中过表达，在通过非同源末端连接（NHEJ）途径诱变修复双链断裂（DSB）的过程中，末端脱氧核糖核酸转移酶可能与polμ竞争。在这里我们报告发现和表征的吡咯基和吲哚基二酮酸，专门针对TdT和表现为核苷酸竞争性抑制剂。与HeLa细胞相比，这些化合物对MOLT-4具有选择性毒性，而HeLa细胞与TdT的体外选择性密切相关。通过与TdT共结晶确定了这两种抑制剂的结合位点，从而解释了为什么这些化合物是脱氧核苷酸三磷酸（dNTP）的竞争性抑制剂。此外，由于观察到的苯基取代基的双重定位，

  DOI：

  10.1021/jm4010187
• 作为产物：
  描述：

  吲哚 在 sodium hydride 、 三氯氧磷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 1-(3-methylbutyl)-1H-indole-3-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  基于结构的苯并噻二嗪对不同基因型HCV NS5b聚合酶（1a、1b和4）的活性预测模型及其在新衍生物发现中的应用

  摘要：

  这项工作提出了第一个基于结构的苯并噻二嗪对各种基因型 HCV NS5b 聚合酶（1a、1b 和 4）的活性预测模型。该模型是基于结构的字段模板和引导对接的综合工作流程。字段模板用作预过滤器和提供良好方向和位置的命中的工具。它是基于详细的分子相互作用场分析创建的，包括 Topomer CoMFA、网格无关分析和 Superstar。另一方面，引导对接被用作改进和评估工具。它受到两个分数的积极指导： Moldock 分数作为交互描述符（r 2 = 0.65）和模板相似度得分作为准确的绑定模式合规性的衡量标准。对接模板基于基于能量的药效团分析。为筛选（AUC 的 ROC = 0.91）和活动预测（r 20.8) 用于基因型 1a。为了扩大模型范围，线性相互作用能被用作基于对接配体位姿预测其他基因型活性的工具，而突变结合能被用于研究基因型4中每个氨基酸突变的影响。模型是通过筛选反应枚举设计的文库，

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2012.01.031

文献信息

• Structural optimization of natural product nordihydroguaretic acid to discover novel analogues as AcrB inhibitors
  作者：Yinhu Wang、Rawaf Alenzy、Di Song、Xingbang Liu、Yuetai Teng、Rumana Mowla、Yingang Ma、Steven W. Polyak、Henrietta Venter、Shutao Ma

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111910

  日期：2020.1

  targets. Herein, we present initial chemical optimization and structure-activity relationship (SAR) data around a previously described efflux pump inhibitor, nordihydroguaretic acid (NDGA). Four series of novel NDGA analogues that target Escherichia coli AcrB were designed, synthesized and evaluated for their ability to potentiate the activity of antibiotics, to inhibit AcrB-mediated substrate efflux

  药物外排泵对危险的细菌病原体具有多重耐药性，这使这些蛋白质成为有希望的药物靶标。在本文中，我们围绕先前描述的外排泵抑制剂降冰片二氢乙酸（NDGA）提出了初始化学优化和结构-活性关系（SAR）数据。设计，合成和评估了针对大肠杆菌AcrB的四个系列的新型NDGA类似物，以评估它们增强抗生素活性，抑制AcrB介导的底物外流并降低脱靶活性的能力。鉴定出九种新颖结构，这些结构提高了一组抗生素的功效，抑制了药物外排并降低了细菌外膜和内膜的通透性。其中，WA7，具有广谱抗菌增敏活性的WB11和WD6被鉴定为具有良好特性的NDGA类似物，可作为潜在的AcrB抑制剂，与NDGA相比，其效能有中等程度的提高。尤其是，WD6是最广泛活性的类似物，可提高所有四类抗菌药物的活性。
• Novel Inhibitors of Hepatitis C Virus Replication
  申请人：Beigelman Leonid

  公开号：US20090257979A1

  公开（公告）日：2009-10-15

  The embodiments provide compounds of the general Formula I, as well as compositions, including pharmaceutical compositions, comprising a subject compound. The embodiments further provide treatment methods, including methods of treating a hepatitis C virus infection and methods of treating liver fibrosis, the methods generally involving administering to an individual in need thereof an effective amount of a subject compound or composition.

  实施例提供了一般式I的化合物，以及包括药物组合物在内的组合物，其中包括一种主体化合物。实施例进一步提供了治疗方法，包括治疗丙型肝炎病毒感染的方法和治疗肝纤维化的方法，这些方法通常涉及向需要的个体施用一种主体化合物或组合物的有效量。
• Aurones and derivatives as promising New Delhi metallo-β-lactamase (NDM-1) inhibitors
  作者：Jérémy Caburet、Federica Verdirosa、Matis Moretti、Brayan Roulier、Giorgia Simoncelli、Romain Haudecoeur、Somayeh Ghazi、Hélène Jamet、Jean-Denis Docquier、Benjamin Boucherle、Marine Peuchmaur

  DOI：10.1016/j.bmc.2023.117559

  日期：2024.1

  hydrolytically inactivate β-lactam antibiotics. Currently, there are no inhibitors of MBLs in clinical use to rescue antibiotic action and the New Delhi metallo-β-lactamase-1 (NDM-1) is still considered as one of the most relevant targets for inhibitor development. Following a fragment-based strategy to find new NDM-1 inhibitors, we identified aurone as a promising scaffold. A series of 60 derivatives

  细菌耐药性无疑是主要的公共卫生问题之一，尤其是随着能够水解灭活 β-内酰胺抗生素的金属-β-内酰胺酶 (MBL) 的出现。目前，临床上尚无用于挽救抗生素作用的 MBL 抑制剂，新德里金属-β-内酰胺酶-1 (NDM-1) 仍被认为是抑制剂开发最相关的靶点之一。按照基于片段的策略寻找新的 NDM-1 抑制剂，我们发现 aurone 是一种有前途的支架。随后对一系列 60 种衍生物进行了评估，其中两种被鉴定为有前景的抑制剂，其K i值低至 1.7 和 2.5 µM。此外，这两种最活跃的化合物能够在体外抗菌药敏试验中增强美罗培南的作用。分子模型提供了有关它们与 NDM-1 活性位点可能相互作用的见解，从而能够进一步改进这个新抑制剂家族的结构。
• Corrigendum to “Integrated structure-based activity prediction model of benzothiadiazines on various genotypes of HCV NS5b polymerase (1a, 1b and 4) and its application in the discovery of new derivatives” [Bioorg. Med. Chem. 20(7) (2012) 2455–2478]
  作者：Mohamed A.H. Ismail、Dalal A. Abou El Ella、Khaled A.M. Abouzid、Amr H. Mahmoud

  DOI：10.1016/j.bmc.2013.07.001

  日期：2013.9
• Integrated structure-based activity prediction model of benzothiadiazines on various genotypes of HCV NS5b polymerase (1a, 1b and 4) and its application in the discovery of new derivatives
  作者：Mohamed A.H. Ismail、Dalal A. Abou El Ella、Khaled A.M. Abouzid、Amr H. Mahmoud

  DOI：10.1016/j.bmc.2012.01.031

  日期：2012.4

  The docking template was based on energy-based pharmacophore analysis. The whole procedure was formulated and tweaked for both screening (ROC of AUC = 0.91) and activity prediction (r2 of 0.8) for the genotype 1a. In order to widen the model scope, linear interaction energy was used as a tool for predicting activities of other genotypes based on the docked ligand poses while mutation binding energy

  这项工作提出了第一个基于结构的苯并噻二嗪对各种基因型 HCV NS5b 聚合酶（1a、1b 和 4）的活性预测模型。该模型是基于结构的字段模板和引导对接的综合工作流程。字段模板用作预过滤器和提供良好方向和位置的命中的工具。它是基于详细的分子相互作用场分析创建的，包括 Topomer CoMFA、网格无关分析和 Superstar。另一方面，引导对接被用作改进和评估工具。它受到两个分数的积极指导： Moldock 分数作为交互描述符（r 2 = 0.65）和模板相似度得分作为准确的绑定模式合规性的衡量标准。对接模板基于基于能量的药效团分析。为筛选（AUC 的 ROC = 0.91）和活动预测（r 20.8) 用于基因型 1a。为了扩大模型范围，线性相互作用能被用作基于对接配体位姿预测其他基因型活性的工具，而突变结合能被用于研究基因型4中每个氨基酸突变的影响。模型是通过筛选反应枚举设计的文库，