4-hydroxy-L-citrulline | 3618-90-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-hydroxy-L-citrulline
• 英文别名: L-Ornithine, N5-(aminocarbonyl)-4-hydroxy-, threo-；(2S,4S)-2-amino-5-(carbamoylamino)-4-hydroxypentanoic acid
• CAS: 3618-90-4
• 化学式: C₆H₁₃N₃O₄
• 分子量: 191.187
• InChiKey: WSFLFFUIEVIDJY-IMJSIDKUSA-N

物化性质

• 熔点：
  185-187 °C
• 沸点：
  497.7±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.429±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.9
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  139
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-hydroxy-L-citrulline 在 2,6-二甲基吡啶 、 三乙基硅基三氟甲磺酸酯 、 碳酸氢钠 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 2-肟氰乙酸乙酯 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 80.58h， 生成 tert-butyl (2S,3R)-2-(((2S,4S)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-1-methoxy-1-oxo-5-ureidopentan-2-yl)carbamoyl)-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  GE81112 B1 和相关类似物的模块化化学酶法合成能够阐明其关键药效团

  摘要：

  GE81112 复合物因其广泛的抗菌特性和独特的抑制细菌翻译起始的能力而备受关注。在此，我们报告了使用化学酶促策略完成 GE81112 B1 的首次全合成。通过将 GE81112 生物合成中发现的铁和 α-酮戊二酸依赖性羟化酶与传统合成方法配对，我们能够通过 11 个步骤（最长的线性序列）获得天然产物。遵循这一策略，合成了 10 个 GE81112 B1 类似物，从而确定了其关键药效团。我们药物化学工作的一个关键特征是在模块化类似物合成中加入额外的生物催化羟基化，以快速探索相关的化学空间。

  DOI：

  10.1021/jacs.0c13424
• 作为产物：
  描述：

  L-瓜氨酸 在 ferrous(II) sulfate heptahydrate 、 wild-type α-ketoglutarate dependent enzyme dioxygenase GetI 、 disodium α-ketoglutarate 、 维生素 C 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 4-hydroxy-L-citrulline
  参考文献：
  名称：

  从非核糖体肽GE81112的生物合成瓜氨酸4-羟化酶的表征及其对Enduracididine的化学酶促合成的底物特异性工程。

  摘要：

  GE81112四肽是一小类不寻常的非核糖体肽同源物，对原核翻译起始具有有效的抑制活性。除3-羟基-1-哌酸单元外，对天然产物家族的非蛋白氨基酸单体的生物合成起源知之甚少。在这里，我们阐明了4-羟基-1-瓜氨酸单元的生物发生，并确定了铁和α-酮戊二酸依赖性酶（Fe /αKG）在该途径中的作用。同源性建模和序列比对分析进一步促进了该酶的合理工程化，使其成为特异性的4-精氨酸羟化酶。随后，我们证明了该工程化酶在合成抗生素耐力酸肽的二肽片段中的效用。

  DOI：

  10.1002/anie.201910659

文献信息

• Modular Chemoenzymatic Synthesis of GE81112 B1 and Related Analogues Enables Elucidation of Its Key Pharmacophores
  作者：Christian R. Zwick、Max B. Sosa、Hans Renata

  DOI：10.1021/jacs.0c13424

  日期：2021.1.27

  initiation. Herein we report the use of a chemoenzymatic strategy to complete the first total synthesis of GE81112 B1. By pairing iron and α-ketoglutarate dependent hydroxylases found in GE81112 biosynthesis with traditional synthetic methodology, we were able to access the natural product in 11 steps (longest linear sequence). Following this strategy, 10 GE81112 B1 analogues were synthesized, allowing for identification

  GE81112 复合物因其广泛的抗菌特性和独特的抑制细菌翻译起始的能力而备受关注。在此，我们报告了使用化学酶促策略完成 GE81112 B1 的首次全合成。通过将 GE81112 生物合成中发现的铁和 α-酮戊二酸依赖性羟化酶与传统合成方法配对，我们能够通过 11 个步骤（最长的线性序列）获得天然产物。遵循这一策略，合成了 10 个 GE81112 B1 类似物，从而确定了其关键药效团。我们药物化学工作的一个关键特征是在模块化类似物合成中加入额外的生物催化羟基化，以快速探索相关的化学空间。
• Characterization of a Citrulline 4‐Hydroxylase from Nonribosomal Peptide GE81112 Biosynthesis and Engineering of Its Substrate Specificity for the Chemoenzymatic Synthesis of Enduracididine
  作者：Christian R. Zwick、Max B. Sosa、Hans Renata

  DOI：10.1002/anie.201910659

  日期：2019.12.19

  further facilitate the rational engineering of this enzyme to become a specific 4-arginine hydroxylase. We subsequently demonstrate the utility of this engineered enzyme in the synthesis of a dipeptide fragment of the antibiotic enduracidin. This work highlights the value of applying a bioinformatics-guided approach in the discovery of novel enzymes and engineering of new catalytic activity into existing

  GE81112四肽是一小类不寻常的非核糖体肽同源物，对原核翻译起始具有有效的抑制活性。除3-羟基-1-哌酸单元外，对天然产物家族的非蛋白氨基酸单体的生物合成起源知之甚少。在这里，我们阐明了4-羟基-1-瓜氨酸单元的生物发生，并确定了铁和α-酮戊二酸依赖性酶（Fe /αKG）在该途径中的作用。同源性建模和序列比对分析进一步促进了该酶的合理工程化，使其成为特异性的4-精氨酸羟化酶。随后，我们证明了该工程化酶在合成抗生素耐力酸肽的二肽片段中的效用。