5-chloro-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile | 1356564-11-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡唑并嘧啶类
• 英文名称: 5-chloro-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile
• 英文别名: 5-Chloro-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile
• CAS: 1356564-11-8
• 化学式: C₁₀H₈ClN₅
• 分子量: 233.66
• InChiKey: NWXHPGJRZSIXSQ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.67±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  66
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-chloro-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile 在 吡啶 、 [RuH2(PPh3)4] 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 sodium carbonate 、 caesium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N-{3-[3-cyano-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]-1-methyl-1H-indol-5-yl}acetamide
  参考文献：
  名称：

  Potent and Selective Inhibitors of CK2 Kinase Identified through Structure-Guided Hybridization

  摘要：

  In this paper we describe a series of 3-cyano-5-aryl-7-aminopyrazolo[1,5-a]-pyrimidine hits identified by kinase-focused subset screening as starting points for the structure-based design of conformationally constrained 6-acetamido-indole inhibitors of CK2. The synthesis, SAR, and effects of this novel series on Akt signaling and cell proliferation in vitro are described.

  DOI：

  10.1021/ml200257n
• 作为产物：
  描述：

  7-羟基-5-氧代-4,5-二氢吡唑并[1,5-a]嘧啶-3-甲腈 在 五氯化磷 、 N,N-二甲基苯胺 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 15.33h， 生成 5-chloro-7-(cyclopropylamino)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  [EN] 3 -CYANO- 5 -ARYLAMINO-7 -CYCLOALKYLAMINOPYRROLO [1, 5 -A] PYRIMIDINE DERIVATIVES AND THEIR USE AS ANTITUMOR AGENTS
  [FR] DÉRIVÉS DE PYRIMIDINE 3-CYANO-5-ARYLAMINO -7-CYCLOALKYLAMINOPYRROLO [1, 5-A] ET LEURS UTILISATIONS COMME AGENTS ANTITUMORAUX

  摘要：

  该发明涉及化合物的化学结构式(I)：或其盐。在某些实施例中，该发明涉及CK2的抑制剂。在更进一步的实施例中，该发明涉及包括本文披露的化合物的药物组合物及其在预防和治疗与CK2相关的疾病和疾病，例如癌症中的应用。

  公开号：

  WO2013144532A1

文献信息

• CK2 INHIBITORS, COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF
  申请人：Polaris Pharmaceuticals

  公开号：US20170369489A1

  公开（公告）日：2017-12-28

  The present invention provides synthesis, pharmaceutically acceptable formulations and uses of compounds in accordance with Formula (I), or a stereoisomer, a tautomer or a pharmaceutically acceptable salt thereof. For Formula (I) compounds R 1 , R 2 , R 3 , Ar and Z are as defined in the specification. The inventive Formula (I) compounds are inhibitors of CK2 and find utility in any number of therapeutic applications, including but not limited to treatment of proliferative disorders such as cancer, inflammation and immunological disorders.

  本发明提供了根据式（I）的化合物的合成、药用可接受的配方和用途，或其立体异构体、互变异构体或药用可接受的盐。对于式（I）化合物，R1、R2、R3、Ar和Z的定义如规范中所述。这种创新的式（I）化合物是CK2的抑制剂，在许多治疗应用中发挥作用，包括但不限于治疗增生性疾病，如癌症、炎症和免疫性疾病。
• Discovery of Pyrazolo[1,5-<i>a</i>]pyrimidine B-Cell Lymphoma 6 (BCL6) Binders and Optimization to High Affinity Macrocyclic Inhibitors
  作者：William McCoull、Roman D. Abrams、Erica Anderson、Kevin Blades、Peter Barton、Matthew Box、Jonathan Burgess、Kate Byth、Qing Cao、Claudio Chuaqui、Rodrigo J. Carbajo、Tony Cheung、Erin Code、Andrew D. Ferguson、Shaun Fillery、Nathan O. Fuller、Eric Gangl、Ning Gao、Matthew Grist、David Hargreaves、Martin R. Howard、Jun Hu、Paul D. Kemmitt、Jennifer E. Nelson、Nichole O’Connell、D. Bryan Prince、Piotr Raubo、Philip B. Rawlins、Graeme R. Robb、Junjie Shi、Michael J. Waring、David Whittaker、Marta Wylot、Xiahui Zhu

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b00359

  日期：2017.5.25

  identified a pyrazolo[1,5-a]pyrimidine series of BCL6 binders from a fragment screen in parallel with a virtual screen. Using structure-based drug design, binding affinity was increased 100000-fold. This involved displacing crystallographic water, forming new ligand–protein interactions and a macrocyclization to favor the bioactive conformation of the ligands. Optimization for slow off-rate constant kinetics

  抑制B细胞淋巴瘤6（BCL6）和共抑制因子之间的蛋白相互作用是在弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）癌症中的治疗目标，有效和选择性BCL6抑制剂的概况分析对于检验该假设至关重要。我们鉴定了吡唑并[1,5- a片段筛选中的] pyrimidine系列BCL6结合物与虚拟筛选平行。使用基于结构的药物设计，结合亲和力增加了100000倍。这包括置换结晶水，形成新的配体-蛋白质相互作用和大环化，以促进配体的生物活性构象。进行了慢速离解速率恒定动力学的优化，并提高了对脱靶激酶CK2的选择性。进一步优化了细胞BCL6分析的效价，以提供高度选择性的探针分子。在许多DLBCL细胞系和多发性骨髓瘤细胞系中仅观察到微弱的抗增殖作用，而与BCL6的效力没有明显的关系。结果，我们得出结论，DLBCL癌症中的BCL6假设仍未得到证实。
• Structure and Property Based Design of Pyrazolo[1,5-a]pyrimidine Inhibitors of CK2 Kinase with Activity in Vivo
  作者：James E. Dowling、Marat Alimzhanov、Larry Bao、Michael H. Block、Claudio Chuaqui、Emma L. Cooke、Christopher R. Denz、Alex Hird、Shan Huang、Nicholas A. Larsen、Bo Peng、Timothy W. Pontz、Caroline Rivard-Costa、Jamal Carlos Saeh、Kumar Thakur、Qing Ye、Tao Zhang、Paul D. Lyne

  DOI：10.1021/ml400197u

  日期：2013.8.8

  design, synthesis, and structure-activity relationship of 5-anilinopyrazolo[1,5-a]pyrimidine inhibitors of CK2 kinase. Property-based optimization of early leads using the 7-oxetan-3-yl amino group led to a series of matched molecular pairs with lower lipophilicity, decreased affinity for human plasma proteins, and reduced binding to the hERG ion channel. Agents in this study were shown to modulate

  在这封信中，我们描述了CK2激酶的5-苯胺基吡唑并[1,5-a]嘧啶抑制剂的设计，合成和构效关系。使用7-氧杂环丁-3-基氨基基团对基于先导的属性进行优化，可得到一系列匹配的分子对，这些亲和力降低，亲脂性降低，对人血浆蛋白的亲和力降低，与hERG离子通道的结合降低。这项研究的药物在体外和体内均显示出可调节pAKT（S129）（CK2的直接底物），并且在鼠DLD-1异种移植物中口服给药时表现出肿瘤生长抑制作用。
• CK2 inhibitors, compositions and methods thereof
  申请人：Polaris Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US10227344B2

  公开（公告）日：2019-03-12

  The present invention provides synthesis, pharmaceutically acceptable formulations and uses of compounds in accordance with Formula (I), or a stereoisomer, a tautomer or a pharmaceutically acceptable salt thereof. For Formula (I) compounds R1, R2, R3, Ar and Z are as defined in the specification. The inventive Formula (I) compounds are inhibitors of CK2 and find utility in any number of therapeutic applications, including but not limited to treatment of proliferative disorders such as cancer, inflammation and immunological disorders.

  本发明提供了符合式（I）的化合物或其立体异构体、同分异构体或药学上可接受的盐的合成、药学上可接受的制剂和用途。 对于式（I）化合物，R1、R2、R3、Ar 和 Z 如说明书中所定义。本发明的式（I）化合物是 CK2 的抑制剂，可用于多种治疗领域，包括但不限于癌症、炎症和免疫疾病等增殖性疾病的治疗。
• 10.1021/acs.jmedchem.4c00962
  作者：Ong, Han Wee、Yang, Xuan、Smith, Jeffery L.、Dickmander, Rebekah J.、Brown, Jason W.、Havener, Tammy M.、Taft-Benz, Sharon、Howell, Stefanie、Sanders, Marcia K.、Capener, Jacob L.、Couñago, Rafael M.、Chang, Edcon、Krämer, Andreas、Moorman, Nathaniel J.、Heise, Mark、Axtman, Alison D.、Drewry, David H.、Willson, Timothy M.

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.4c00962

  日期：——

  The pyrazolo[1,5-a]pyrimidine scaffold is a promising scaffold to develop potent and selective CSNK2 inhibitors with antiviral activity against β-coronaviruses. Herein, we describe the discovery of a 1,2,4-triazole group to substitute a key amide group for CSNK2 binding present in many potent pyrazolo[1,5-a]pyrimidine inhibitors. Crystallographic evidence demonstrates that the 1,2,4-triazole replaces

  吡唑并[1,5- a ]嘧啶支架是一种很有前途的支架，可用于开发具有抗β-冠状病毒活性的有效、选择性CSNK2抑制剂。在此，我们描述了 1,2,4-三唑基团的发现，该基团取代了许多有效的吡唑并[1,5- a ]嘧啶抑制剂中存在的 CSNK2 结合的关键酰胺基团。晶体学证据表明，1,2,4-三唑取代了酰胺，与 Lys68 和埋在 ATP 结合袋中的水分子形成关键氢键。这种等排替代以溶解度为代价提高了效力和代谢稳定性。效力、溶解度和代谢稳定性的优化导致了有效且选择性 CSNK2 抑制剂的发现53 。尽管具有优异的体外代谢稳定性，但在体内观察到53的血浆浓度快速下降，并且可能归因于肺蓄积，尽管没有观察到体内药理作用。这种新型化学型的进一步优化可能会验证 CSNK2 作为体内抗病毒靶点。