[(3R)-3-({[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}methyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-1,4-benzodiazepin-1-yl]acetic acid | 896746-87-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: [(3R)-3-({[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}methyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-1,4-benzodiazepin-1-yl]acetic acid
• 英文别名: (R)-[3-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl]acetic acid；(R)-[3-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydrobenzo[e][1,4]diazepin-1-yl]-acetic acid；(R)-[3-(tert-butyl-dimethyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-benzo[e][1,4]diazepin-1-yl]-acetic acid；2-[(3R)-3-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-2-oxo-5-phenyl-3H-1,4-benzodiazepin-1-yl]acetic acid
• CAS: 896746-87-5
• 化学式: C₂₄H₃₀N₂O₄Si
• 分子量: 438.599
• InChiKey: YEFYHGDZQDJJRD-LJQANCHMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.35
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  79.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(3R)-3-({[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}methyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-1,4-benzodiazepin-1-yl]acetic acid 在 四丁基氟化铵 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 {(3R)-1-[2-(allylamino)-2-oxoethyl]2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-1,4-benzodiazepin-3-yl}methyl[4-chloro-2-(trifluoromethyl)phenyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  在极性和非极性介质中具有不同行为的强效木瓜蛋白酶家族组织蛋白酶 L 样半胱氨酸蛋白酶抑制剂的 NMR 表征和构象分析

  摘要：

  摘要 我们最近报道了一种有效的木瓜蛋白酶家族组织蛋白酶 L 样半胱氨酸蛋白酶抑制剂的合成，作为开发可用作抗原虫药物的新药物的新先导化合物。对其构象特征的研究对于深入了解其生物学行为至关重要。我们仔细的 NMR 分析基于 CDCl3 和 CD3OH 中分子的 1H、13C、15N 和 19F 信号的完整和全部分配，这可以以某种方式将极性相和非极性相重现到生物环境中。通过这种方式，揭示了分子在极性和非极性介质中的不同行为。在CDCl3中，可以根据通过空间接触检测到的情况来定义稳定的构象排列，而，

  DOI：

  10.1016/j.molstruc.2014.07.046
• 作为产物：
  描述：

  (R)-3-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-phenyl-1,3-dihydro-benzo[e][1,4]diazepin-2-one 在 甲醇 、 sodium hydride 、 lithium hydroxide 作用下， 反应 19.0h， 生成 [(3R)-3-({[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}methyl)-2-oxo-5-phenyl-2,3-dihydro-1H-1,4-benzodiazepin-1-yl]acetic acid
  参考文献：
  名称：

  在极性和非极性介质中具有不同行为的强效木瓜蛋白酶家族组织蛋白酶 L 样半胱氨酸蛋白酶抑制剂的 NMR 表征和构象分析

  摘要：

  摘要 我们最近报道了一种有效的木瓜蛋白酶家族组织蛋白酶 L 样半胱氨酸蛋白酶抑制剂的合成，作为开发可用作抗原虫药物的新药物的新先导化合物。对其构象特征的研究对于深入了解其生物学行为至关重要。我们仔细的 NMR 分析基于 CDCl3 和 CD3OH 中分子的 1H、13C、15N 和 19F 信号的完整和全部分配，这可以以某种方式将极性相和非极性相重现到生物环境中。通过这种方式，揭示了分子在极性和非极性介质中的不同行为。在CDCl3中，可以根据通过空间接触检测到的情况来定义稳定的构象排列，而，

  DOI：

  10.1016/j.molstruc.2014.07.046

文献信息

• Development of Peptidomimetics with a Vinyl Sulfone Warhead as Irreversible Falcipain-2 Inhibitors
  作者：Roberta Ettari、Emanuela Nizi、Maria Emilia Di Francesco、Marie-Adrienne Dude、Gabriele Pradel、Radim Vičík、Tanja Schirmeister、Nicola Micale、Silvana Grasso、Maria Zappalà

  DOI：10.1021/jm701141u

  日期：2008.2.1

  This paper describes the synthesis of a new class of peptidomimetic cysteine protease inhibitors based on a 1,4-benzodiazepine scaffold and on an electrophilic vinyl sulfone moiety. The former was introduced internally to a peptide sequence that mimics the fragment D-Ser-Gly; the latter was built on the P1-P1' site and reacts as a classical "Michael acceptor", leading to an alkylated enzyme by irreversible

  本文介绍了一种新型的拟肽半胱氨酸蛋白酶抑制剂的合成，该抑制剂基于1,4-苯并二氮杂pine骨架和亲电子乙烯基砜部分。前者在内部被引入到模拟片段D-Ser-Gly的肽序列中。后者建立在P1-P1'位点上，并作为经典的“迈克尔受体”反应，通过不可逆地添加活性位点半胱氨酸的硫醇基团生成烷基化酶。乙烯基砜部分的引入已通过烯烃交叉复分解完成，烯烃复分解是形成碳-碳双键的有力工具。新化合物2-3已被证明是有效的和选择性的falcipain-2抑制剂，falcipain-2是一种从恶性疟原虫中分离出来的半胱氨酸蛋白酶，具有抗血浆活性。
• Constrained peptidomimetics as antiplasmodial falcipain-2 inhibitors
  作者：Floriana Bova、Roberta Ettari、Nicola Micale、Caterina Carnovale、Tanja Schirmeister、Christoph Gelhaus、Matthias Leippe、Silvana Grasso、Maria Zappalà

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.06.010

  日期：2010.7

  we report the synthesis of a series of novel constrained peptidomimetics 2–10 endowed with a dipeptide backbone (d-Ser-Gly) and a vinyl ester warhead, structurally related to a previously identified lead compound 1, an irreversible inhibitor of falcipain-2, the main haemoglobinase of lethal malaria parasite Plasmodium falciparum. The new compounds were evaluated for their inhibition against falcipain-2

  本文中我们报道了一系列具有二肽骨架（d -Ser-Gly）和乙烯基酯弹头的新型约束拟肽2-10的合成，该结构与先前鉴定的铅化合物1（falcipain-2的不可逆抑制剂）结构相关，致命疟疾寄生虫恶性疟原虫的主要血红蛋白酶。评价了新化合物对falcipain-2的抑制作用以及对培养的恶性疟原虫的抑制作用。还评估了合成化合物对另一种原生动物半胱氨酸蛋白酶，即布鲁氏锥虫的罗得沙氏菌的抑制活性。
• Development of Rhodesain Inhibitors with a 3-Bromoisoxazoline Warhead
  作者：Roberta Ettari、Lucia Tamborini、Ilenia C. Angelo、Silvana Grasso、Tanja Schirmeister、Leonardo Lo Presti、Carlo De Micheli、Andrea Pinto、Paola Conti

  DOI：10.1002/cmdc.201300390

  日期：2013.12

  Novel rhodesain inhibitors were obtained by combining an enantiomerically pure 3‐bromoisoxazoline warhead with a specific peptidomimetic recognition moiety. All derivatives behaved as inhibitors of rhodesain, with low micromolar Ki values. Their activity against the enzyme was found to be paralleled by an in vitro antitrypanosomal activity, with IC50 values in the mid‐micromolar range. Notably, a preference

  通过将对映体纯的3-溴异恶唑啉战斗部与特定的拟肽识别部分相结合，可获得新型的罗德萨因抑制剂。所有衍生物均表现为罗得沙星的抑制剂，其微摩尔K i值低。发现它们对酶的活性与体外抗锥虫活性平行，IC 50值在中微摩尔范围内。值得注意的是，观察到寄生虫优于人蛋白酶，特别是组织蛋白酶B和L。
• Synthesis and biological evaluation of novel peptidomimetics as rhodesain inhibitors
  作者：Roberta Ettari、Santo Previti、Sandro Cosconati、Jochen Kesselring、Tanja Schirmeister、Silvana Grasso、Maria Zappalà

  DOI：10.3109/14756366.2015.1108972

  日期：2016.11.1

  Novel rhodesain inhibitors were developed by combining an enantiomerically pure 3-bromoisoxazoline warhead with a 1,4-benzodiazepine scaffold as specific recognition moiety. All compounds were proven to inhibit rhodesain with Ki values in the low-micromolar range. Their activity towards rhodesain was found to be coupled to an in vitro antitrypanosomal activity, with IC50 values ranging from the mid-micromolar

  通过将对映体纯的3-溴异恶唑啉战斗部与作为特定识别部分的1,4-苯并二氮杂sc骨架相结合，开发出了新型罗得沙因抑制剂。事实证明，所有化合物均能抑制罗得沙因，其Ki值在低微摩尔范围内。发现它们对罗德沙因的活性与体外抗锥虫活性有关，IC50值范围从最活跃的罗德沙因抑制剂（R，S，S）-3的中微摩尔值到低微摩尔值。由于所有化合物均被证明是人组织蛋白酶L的弱抑制剂，因此所有化合物均对目标酶具有良好的选择性。
• Novel Peptidomimetic Cysteine Protease Inhibitors as Potential Antimalarial Agents
  作者：Nicola Micale、Alan P. Kozikowski、Roberta Ettari、Silvana Grasso、Maria Zappalà、Jong-Jin Jeong、Ajay Kumar、Manjit Hanspal、Athar H. Chishti

  DOI：10.1021/jm060405f

  日期：2006.6.1

  The synthesis of a new class of peptidomimetics 1a-j, based on a 1,4-benzodiazepine scaffold and on a C-terminal aspartyl aldehyde building block, is described. Compounds 1a-j provided significant inhibitory activity against falcipains 2A and 2B (FP-2A and FP-2B), two cysteine proteases from Plasmodium falciparum.