5'-N-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]-tert-butyl ester-5'-deoxy-2',3'-O,O-(1-methyl ethylidene)adenosine | 1227195-11-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 5'-N-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]-tert-butyl ester-5'-deoxy-2',3'-O,O-(1-methyl ethylidene)adenosine
• 英文别名: tert-butyl (S)-4-((((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)butanoate；tert-butyl (S)-4-((((3αR,4R,6R,6αR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)methyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)butanoate；tert-butyl (2S)-4-[[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methylamino]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoate
• CAS: 1227195-11-0
• 化学式: C₂₆H₄₁N₇O₇
• 分子量: 563.654
• InChiKey: KTOQJFJMZGNJDC-UQEZQTQMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  174
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-N-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]-tert-butyl ester-5'-deoxy-2',3'-O,O-(1-methyl ethylidene)adenosine 在 三氟乙酸 作用下， 以 水 、 苯甲醚 为溶剂， 反应 3.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Development of rationally designed DNA N6 adenine methyltransferase inhibitors

  摘要：

  A series of bisubstrate inhibitors for DNA N6 adenine methyltransferase (Dam) have been synthesized by linking an amine analogue of S-adenosylmethionine to an aryl moiety designed to probe the binding pocket of the DNA adenine base. An initial structure-activity relationship study has identified substituents that increase inhibitor potency to the similar to 10 mu M range and improve selectivity against the human cytosine methyltransferase Dnmt1. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2012.03.072
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 叠氮磷酸二苯酯 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.33h， 生成 5'-N-[4-{(2S)-2-(N-tert-butoxycarbonyl)aminobutyric acid}]-tert-butyl ester-5'-deoxy-2',3'-O,O-(1-methyl ethylidene)adenosine
  参考文献：
  名称：

  Design, synthesis, and kinetic analysis of potent protein N-terminal methyltransferase 1 inhibitors

  摘要：

  设计并合成了一种新型的双底物类似物（NAM-TZ-SPKRIA），它被设计成一种强效、选择性和首个NTMT1抑制剂。

  DOI：

  10.1039/c5ob00120j

文献信息

• [EN] NOVEL HISTONE METHYLTRANSFERASE INHIBITORS<br/>[FR] NOUVEAUX INHIBITEURS D'HISTONE MÉTHYLTRANSFÉRASES
  申请人：UNIV FREIBURG ALBERT LUDWIGS

  公开号：WO2021053158A1

  公开（公告）日：2021-03-25

  The present invention relates to novel compounds of formula (I) as defined herein. The compounds are inhibitors of histone methyltransferases of the seven-beta-strand family, in particular of KMT9.

  本发明涉及式(I)定义的新的化合物。这些化合物是七-β-链家族组蛋白甲基转移酶的抑制剂，特别是KMT9的抑制剂。
• Potent Inhibition of Nicotinamide <i>N</i>-Methyltransferase by Alkene-Linked Bisubstrate Mimics Bearing Electron Deficient Aromatics
  作者：Yongzhi Gao、Matthijs J. van Haren、Ned Buijs、Paolo Innocenti、Yurui Zhang、Davide Sartini、Roberto Campagna、Monica Emanuelli、Richard B. Parsons、Willem Jespers、Hugo Gutiérrez-de-Terán、Gerard J. P. van Westen、Nathaniel I. Martin

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01094

  日期：2021.9.9

  the development of new bisubstrate inhibitors that include electron-deficient aromatic groups to mimic the nicotinamide moiety. In addition, a trans-alkene linker was found to be optimal for connecting the substrate and cofactor mimics in these inhibitors. The most potent NNMT inhibitor identified exhibits an IC50 value of 3.7 nM, placing it among the most active NNMT inhibitors reported to date. Complementary

  烟酰胺N-甲基转移酶 (NNMT) 将烟酰胺（维生素 B3）甲基化以生成 1-甲基烟酰胺 (MNA)。NNMT 过表达与多种疾病有关，最突出的是人类癌症，表明其作为治疗靶点的潜力。近年来，小分子 NNMT 抑制剂的开发引起了人们的兴趣，其中最有效的抑制剂具有基于烟酰胺底物和S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 辅因子元素的结构特征。我们在这里报告了新的双底物抑制剂的开发，其中包括缺电子的芳族基团来模拟烟酰胺部分。此外，一个跨发现 - 烯烃接头最适合连接这些抑制剂中的底物和辅因子模拟物。鉴定出的最有效的 NNMT 抑制剂的 IC 50值为 3.7 nM，使其成为迄今为止报道的最活跃的 NNMT 抑制剂之一。补充分析技术、建模研究和基于细胞的检测提供了对这些抑制剂的结合模式、亲和力和选择性的深入了解。
• [EN] BROAD SPECTRUM ANTI-CANCER COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS ANTICANCÉREUX À LARGE SPECTRE
  申请人：UNIV CALIFORNIA

  公开号：WO2021076617A1

  公开（公告）日：2021-04-22

  Described herein, inter alia, are compounds for treating cancer and methods of use. This disclosure features chemical entities (e.g., small hairpin RNAs (shRNAs), micro RNA (miRNAs), small interfering RNA (siRNAs), small molecule inhibitors, antisense nucleic acids, peptides, viruses, CRISPR-sgRNAs, or combinations thereof) that inhibit one or more of m6A writers (e.g., methyltransferase like 3 (Mettl3 or MT-A70) or methyltransferase like-14 (Mettl14)), m6Am writers (e.g., phosphorylated CTD interacting factor I (PCIF 1), or Mettl3/14), m6A erasers (e.g., fat-mass and obesity-associated protein (FTO) or ALKB homolog 5 (ALKBH5)), m6Am erasers (e.g., FTO), m6A readers (e.g., YTH domain-containing family proteins (YTHs)), YTF domain family member 1 (YTHDF 1), YTF domain family member 2 (YTHDF 2), YTF domain family member 3 (YTHDF 3), or tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2 (PTPN2).

  本文描述了用于治疗癌症的化合物和使用方法。该公开涉及抑制m6A编写酶（例如，甲基转移酶类3（Mettl3或MT-A70）或甲基转移酶类14（Mettl14））、m6Am编写酶（例如，磷酸化CTD相互作用因子I（PCIF 1）或Mettl3/14）、m6A擦除酶（例如，脂肪质量和肥胖相关蛋白（FTO）或ALKB同源物5（ALKBH5））、m6Am擦除酶（例如，FTO）、m6A读取器（例如，YTH结构域含家族蛋白（YTHs））、YTF结构域家族成员1（YTHDF 1）、YTF结构域家族成员2（YTHDF 2）、YTF结构域家族成员3（YTHDF 3）或酪氨酸蛋白磷酸酶非受体型2（PTPN2）等化学实体（例如，小发夹RNA（shRNAs）、微RNA（miRNAs）、小干扰RNA（siRNAs）、小分子抑制剂、反义核酸、肽、病毒、CRISPR-sgRNAs或其组合）。
• Toward the development of potent and selective bisubstrate inhibitors of protein arginine methyltransferases
  作者：James Dowden、Wei Hong、Richard V. Parry、Richard A. Pike、Stephen G. Ward

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.02.069

  日期：2010.4

  Prototype inhibitors of protein arginine methyltransferases (PRMTs) have been constructed by attaching guanidine functionality via a variable linker to non-reactive amine analogues of the cellular co-factor (S)-adenosyl methionine (AdoMet). Potent inhibition of PRMT1 (IC50 of ∼3–6 μM) combined with weak inhibition of the lysine methyltransferase SET7 (∼50% of activity at 100 μM) was observed for two

  蛋白质精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 的原型抑制剂是通过通过可变接头将胍功能连接到细胞辅因子 ( S )-腺苷甲硫氨酸 (AdoMet)的非反应性胺类似物来构建的。对于两种这样的化合物，观察到对PRMT1 的有效抑制（IC 50为 ∼3-6 μM）以及对赖氨酸甲基转移酶 SET7 的弱抑制（在 100 μM 时的活性约为 50%）。
• Discovery of Potent Small-Molecule Inhibitors of MLL Methyltransferase
  作者：Ting-Rong Chern、Liu Liu、Elyse Petrunak、Jeanne A. Stuckey、Mi Wang、Denzil Bernard、Haibin Zhou、Shirley Lee、Yali Dou、Shaomeng Wang

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.0c00229

  日期：2020.6.11

  report the design, synthesis, and evaluation of an S-adenosylmethionine-based focused chemical library which led to the discovery of potent small-molecule inhibitors directly targeting the MLL SET domain. Determination of cocrystal structures for a number of these MLL inhibitors reveals that they adopt a unique binding mode that locks the MLL SET domain in an open, inactive conformation.

  混合谱系白血病（MLL）蛋白，也称为MLL1，是一种赖氨酸甲基转移酶，专门负责组蛋白3赖氨酸4的甲基化。MLL已被视为具有MLL融合基因或MLL白血病。在此，我们报告了基于S-腺苷甲硫氨酸的重点化学文库的设计，合成和评估，该文库导致发现了直接靶向MLL SET域的强效小分子抑制剂。对许多这些MLL抑制剂的共晶结构的测定表明，它们采用了独特的结合模式，将MLL SET域锁定在开放的，无活性的构象中。