Identification and analysis of residues contained on β → α loops of the dual-substrate (βα)<sub>8</sub>
phosphoribosyl isomerase A specific for its phosphoribosyl anthranilate isomerase activity
作者:Lianet Noda-García、Aldo R. Camacho-Zarco、Karina Verdel-Aranda、Helena Wright、Xavier Soberón、Vilmos Fülöp、Francisco Barona-Gómez
DOI:10.1002/pro.331
日期:2010.3
unnoticed residue contained on the functionally important beta --> alpha loop 5, namely, Arg(139), which was postulated on structural grounds to be important for the dual-substrate specificity of PriA, is presented for the first time. Indeed, enzyme kinetics analyses done on the mutant variants PriA_Ser(81)Thr and PriA_Arg(139)Asn showed that these residues, which are contained on beta --> alpha loops and
实验探索与酶功能相关的进化假设的一个很好的模型是古老的双底物 (beta alpha)(8) 磷酸核糖异构酶 A (PriA),它参与天蓝色链霉菌和相关生物的组氨酸和色氨酸生物合成。在这项研究中,我们确定了天蓝色野生型 PriA 和选定的单残基单功能突变体中异构酶活性的 Michaelis-Menten 酶动力学,在大肠杆菌体内互补实验后鉴定。对功能重要的 β-> α 环 5 中包含的迄今为止未被注意到的残基进行结构和功能分析,即 Arg(139),其在结构上被假定对 PriA 的双底物特异性很重要,用于第一次。的确,对突变变体 PriA_Ser(81)Thr 和 PriA_Arg(139)Asn 进行的酶动力学分析表明,这些残基包含在 β --> α 环上并靠近 N 端磷酸结合位点,是必不可少的仅用于 PriA 的磷酸核糖邻氨基苯甲酸异构酶活性。此外,对此处在 1.95 A 阐明的 PriA_Arg(139)Asn