N-(2-aminoethyl)-2-[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxyacetamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N-(2-aminoethyl)-2-[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxyacetamide
• 化学式: C₁₄H₂₁N₇O₅
• 分子量: 367.365
• InChiKey: GNGWROZTLSKLHA-FRJWGUMJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-O-[N-(aminoethyl)carbamoyl]methyladenosine 3'-(thymidine-5'-phosphate) 在 phosphodiesterase I from Crotalus adamanteus venom 、 三羟甲基氨基甲烷 、 sodium chloride 、 magnesium chloride 作用下， 以 水 、 甘油 为溶剂， 反应 168.0h， 生成 N-(2-aminoethyl)-2-[(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxyacetamide 、 thymidine 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  含 2'-O-[N-(氨基乙基)氨基甲酰基]甲基腺苷的二核苷酸的合成和稳定性

  摘要：

  为了合成 2'-O-[N-（氨基乙基）氨基甲酰基]甲基修饰的二核苷酸和寡核苷酸，我们合成了受保护的 2'-O-[N-（氨基乙基）氨基甲酰基]甲基修饰的腺苷，其中修改是在一个方便的一锅三步程序中引入的。还合成了相应的 H-膦酸酯结构单元，并且可以从该中间体制备含 2'-O-[N-（氨基乙基）氨基甲酰基]甲基的二核苷酸。我们还对该二核苷酸的化学和酶稳定性进行了研究。二核苷酸经历了不同的氨解和其他碱性条件，HPLC 分析表明修饰在大多数条件下是完整的，但在 55°C 下使用 NH3（浓缩水溶液）时有一些轻微的水解。在其他几组条件下，包括甲醇中的饱和 NH3，和乙二胺，酰胺保持完整。用来自 Crotalus adamanteus 毒液的磷酸二酯酶 I 和来自牛脾的磷酸二酯酶 II 处理二核苷酸表明，N-（氨基乙基）氨基甲酰基甲基部分为磷酸二酯键提供了对酶促降解的实质性保护；磷酸二酯在 7 天后完全没有被

  DOI：

  10.1002/ejoc.201300699

文献信息

• Cell-Penetrating Oligonucleotides
  申请人：OLIGOMER SCIENCES AB

  公开号：US20160008389A1

  公开（公告）日：2016-01-14

  The present invention relates to modified oligonucleotides of 5-50 nucleotide residues, wherein at least 25% of the nucleotides are independently modified at the 2′ position to comprise the structure of formula (I), wherein base is a purine or pyrimidine moiety; and R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , p and q are as defined in the description. The modified oligonucleotides comprising said structures are useful as medicaments for enhancement of drug uptake in oligonucleotide based therapy in humans and animals.

  本发明涉及5-50个核苷酸残基的修饰寡核苷酸，其中至少25％的核苷酸在2'位独立修饰，包括式（I）的结构，其中碱基是嘌呤或嘧啶基团；且R1，R2，R3，R4，p和q如描述中所定义。包含所述结构的修饰寡核苷酸在人类和动物的寡核苷酸基治疗中用作增强药物摄取的药物。
• CELL-PENETRATING OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：Oligomer Sciences AB

  公开号：EP2961757A1

  公开（公告）日：2016-01-06
• US9463200B2
  申请人：——

  公开号：US9463200B2

  公开（公告）日：2016-10-11
• [EN] CELL-PENETRATING OLIGONUCLEOTIDES<br/>[FR] OLIGONUCLÉOTIDES PÉNÉTRANT LES CELLULES
  申请人：OLIGOMER SCIENCES AB

  公开号：WO2014131892A1

  公开（公告）日：2014-09-04

  The present invention relates to modified oligonucleotides of 5-50 nucleotide residues, wherein at least 25% of the nucleotides are independently modified at the 2' position to comprise the structure of formula (I), wherein base is a purine or pyrimidine moiety; and R1, R2, R3, R4, p and q are as defined in the description. The modified oligonucleotides comprising said structures are useful as medicaments for enhancement of drug uptake in oligonucleotide based therapy in humans and animals.
• Synthesis and Stability of a 2′-<i>O</i>-[<i>N</i>-(Aminoethyl)carbamoyl]methyladenosine-Containing Dinucleotide
  作者：Stefan Milton、Charlotte Ander、Dmytro Honcharenko、Małgorzata Honcharenko、Esther Yeheskiely、Roger Strömberg

  DOI：10.1002/ejoc.201300699

  日期：2013.11

  towards the synthesis of 2′-O-[N-(aminoethyl)carbamoyl]methyl-modified di- and oligonucleotides, we have synthesised a protected 2′-O-[N-(aminoethyl)carbamoyl]methyl-modified adenosine where the modification is introduced in a convenient one-pot three-step procedure. The corresponding H-phosphonate building block was also synthesised, and from this intermediate, a 2′-O-[N-(aminoethyl)carbamoyl]methyl-containing

  为了合成 2'-O-[N-（氨基乙基）氨基甲酰基]甲基修饰的二核苷酸和寡核苷酸，我们合成了受保护的 2'-O-[N-（氨基乙基）氨基甲酰基]甲基修饰的腺苷，其中修改是在一个方便的一锅三步程序中引入的。还合成了相应的 H-膦酸酯结构单元，并且可以从该中间体制备含 2'-O-[N-（氨基乙基）氨基甲酰基]甲基的二核苷酸。我们还对该二核苷酸的化学和酶稳定性进行了研究。二核苷酸经历了不同的氨解和其他碱性条件，HPLC 分析表明修饰在大多数条件下是完整的，但在 55°C 下使用 NH3（浓缩水溶液）时有一些轻微的水解。在其他几组条件下，包括甲醇中的饱和 NH3，和乙二胺，酰胺保持完整。用来自 Crotalus adamanteus 毒液的磷酸二酯酶 I 和来自牛脾的磷酸二酯酶 II 处理二核苷酸表明，N-（氨基乙基）氨基甲酰基甲基部分为磷酸二酯键提供了对酶促降解的实质性保护；磷酸二酯在 7 天后完全没有被