ImPyPyPy-Dp trifluoroacetate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: ImPyPyPy-Dp trifluoroacetate
• 英文别名: N-[5-[[5-[[5-[3-(dimethylamino)propylcarbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methylimidazole-2-carboxamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
• 化学式: C30H37F3N10O6
• 分子量: 690.7
• InChiKey: JYDFUTXBGJDZLG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.51
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  190
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-4-硝基-2-(三氟乙酰)-1H-吡咯 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 、 lithium hydroxide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 ImPyPyPy-Dp trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  针对 5'-WGWWCW-3' 基序的生物活性 DNA 小沟结合物的光谱、生化和计算研究

  摘要：

  光谱、生化和计算模型研究已用于评估一组小沟结合 (MGB) 配体对自我互补 DNA 序列 5'-d(CGCGCG)-3' 和 5'-d( CGCGCG)-3′。配体经过精心设计，以 DNA 响应元件 5'-WGWWCW-3' 为靶点，它是几种核受体的结合位点。用三种 MGB 配体制备的 DNA 样品的基本 1D H NMR 谱显示出细微的变化，表明每种配体如何与两种 DNA 序列的双螺旋结构结合。所研究的配体之间的变化反映在 1D H 和 P-{H} NMR 谱的线形和强度中。事实证明，对这些 1D NMR 谱进行快速目视检查有助于提供有关 MGB 结合分子的宝贵见解。 NMR 结果与 UV DNA 变性和分子建模研究的结果一致。核磁共振波谱和计算分析均表明，所研究的配体以头尾相连的方式作为反平行并排二聚体与小沟结合。此外，与生化研究结果的比较为了解 MGB 的作用机制以及与其结构相关的抗肿瘤活性提供了宝贵的见解，这是未来优化

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2024.107414