In silico evaluation of molecular interactions between macrocyclic inhibitors with the HCV NS3 protease. Docking and identification of antiviral pharmacophore site
作者:Hind Lafridi、Faisal A. Almalki、Taibi Ben Hadda、Malika Berredjem、Sarkar M. A. Kawsar、Ali M. Alqahtani、Eman R. Esharkawy、Brahim Lakhrissi、Hsaine Zgou
DOI:10.1080/07391102.2022.2029571
日期:2023.4.13
inhibitor derivatives containing either P2 cyclopentane P1 carboxylic acid moiety (1-9) or a P1 cyclopropyl acyl sulfonamide (10-13). To further recognize binding interactions and their activity trends, molecular docking studies were carried out with the use of HCV, which can be used to accurately predict the interactions of ligands with the receptor. The QSAR models are developed through the use of
摘要 一系列计算方法 DFT/QSAR/POM 方法已用于更好地了解有关 13 种抑制剂衍生物的药物特性,这些衍生物包含 P2 环戊烷 P1 羧酸部分 (1-9) 或 P1 环丙基酰基磺酰胺( 10-13 )。为了进一步认识结合相互作用及其活性趋势,利用HCV进行了分子对接研究,可用于准确预测配体与受体的相互作用。QSAR 模型是通过使用多元线性回归 (MLR) 和主成分分析 (PCA) 方法开发的。统计结果表明多重相关系数R 2 = 0.840,这显示了良好的估计稳定性,并显示了所研究化合物的 HCV NS3 蛋白酶与其电子接受能力之间的显着相关性。化合物1-13的物理化学性质的 POM 分析表明它们带有 (O1, O2) 和/或 (O1, O2, O3) 抗病毒口袋,其中所有氧原子都是 Osp2 并带有负电荷。与参考配体 (F9K) 类似,最活跃的化合物10深入结合到 NS3 蛋白酶的结合腔中,与残基