6-amino-9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-1-((E)-3-methyl-5-((1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl)pent-2-en-1-yl)-9H-purin-1-ium

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-amino-9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-1-((E)-3-methyl-5-((1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl)pent-2-en-1-yl)-9H-purin-1-ium
• 英文别名: 1-Tuberculosinyladenosine；(2R,3R,4S,5R)-2-[6-amino-1-[(E)-5-[(1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-2,3,6,7,8,8a-hexahydronaphthalen-1-yl]-3-methylpent-2-enyl]purin-1-ium-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• 化学式: C₃₀H₄₆N₅O₄
• 分子量: 540.726
• InChiKey: QPSHCYXDFVVWPO-WAHYGVONSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-amino-9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-1-((E)-3-methyl-5-((1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl)pent-2-en-1-yl)-9H-purin-1-ium 在 二甲胺 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 1.5h， 以100%的产率得到(2R,3S,4R,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(6-(((E)-3-methyl-5-((1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl)pent-2-en-1-yl)amino)-9H-purin-9-yl)-tetrahydrofuran-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  1-结核菌素腺苷的立体选择性合成；结核分枝杆菌的毒力因子

  摘要：

  尽管结核分枝杆菌( Mtb ) 感染是世界上最流行和最致命的细菌病原体之一，但它并不能通过快速且高度可靠的检测进行常规诊断。一项发现Mtb特异性生物标志物的计划最近鉴定了两种天然化合物：1-结核菌素腺苷 (1-TbAd) 和N 6 -结核菌素腺苷 ( N 6 -TbAd)。基于它们与毒力的关联、自然界中缺乏类似化合物、存在多个立体中心以及需要丰富的产品来开发诊断测试，这些化合物的合成被认为具有高价值但具有挑战性。在此，描述了1-TbAd和N 6 -TbAd的多克规模立体选择性合成。作为关键步骤，开发了手性辅助介导的狄尔斯-阿尔德环加成反应，引入了具有高外切内比（10:1）和优异对映选择性（>98%ee）的三个立构中心。这是首次利用卤烷骨架立体选择性合成二萜。计算研究解释了观察到的立体化学结果。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b01332
• 作为产物：
  描述：

  (E)-3-methyl-5-(1α,2β,8aα)-(1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydro-1,2,5,5-tetramethyl-1-naphthalenyl)-2-penten-1-ol 在 N-氯代丁二酰亚胺 、 二甲基硫 、 sodium iodide 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 6-amino-9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-tetrahydrofuran-2-yl)-1-((E)-3-methyl-5-((1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl)pent-2-en-1-yl)-9H-purin-1-ium
  参考文献：
  名称：

  1-结核菌素腺苷的立体选择性合成；结核分枝杆菌的毒力因子

  摘要：

  尽管结核分枝杆菌( Mtb ) 感染是世界上最流行和最致命的细菌病原体之一，但它并不能通过快速且高度可靠的检测进行常规诊断。一项发现Mtb特异性生物标志物的计划最近鉴定了两种天然化合物：1-结核菌素腺苷 (1-TbAd) 和N 6 -结核菌素腺苷 ( N 6 -TbAd)。基于它们与毒力的关联、自然界中缺乏类似化合物、存在多个立体中心以及需要丰富的产品来开发诊断测试，这些化合物的合成被认为具有高价值但具有挑战性。在此，描述了1-TbAd和N 6 -TbAd的多克规模立体选择性合成。作为关键步骤，开发了手性辅助介导的狄尔斯-阿尔德环加成反应，引入了具有高外切内比（10:1）和优异对映选择性（>98%ee）的三个立构中心。这是首次利用卤烷骨架立体选择性合成二萜。计算研究解释了观察到的立体化学结果。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b01332

文献信息

• Molecular profiling of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> identifies tuberculosinyl nucleoside products of the virulence-associated enzyme Rv3378c
  作者：Emilie Layre、Ho Jun Lee、David C. Young、Amanda Jezek Martinot、Jeffrey Buter、Adriaan J. Minnaard、John W. Annand、Sarah M. Fortune、Barry B. Snider、Isamu Matsunaga、Eric J. Rubin、Tom Alber、D. Branch Moody

  DOI：10.1073/pnas.1315883111

  日期：2014.2.25

  Whereas most mycobacteria do not cause disease, Mycobacterium tuberculosis kills more than one million people each year. To better understand why Mycobacterium tuberculosis is virulent and to discover chemical markers of this pathogen, we compare its lipid profile with that of the attenuated but related mycobacterium, Mycobacterium bovis Bacillus Calmette–Guérin. This strategy identified a previously unknown Mycobacterium tuberculosis -specific lipid, 1-tuberculosinyladenosine, which is produced by the Rv3378c enzyme. The crystal structure of Rv3378c provides information supporting drug design to inhibit prenyl transfer. Discovery of 1-tuberculosinyladenosine provides insight into how Mycobacterium tuberculosis resists killing in macrophages and a new target for diagnosing tuberculosis disease.

  尽管大多数分枝杆菌不会引起疾病，但结核分枝杆菌每年仍会导致超过一百万人死亡。为了更好地了解为什么结核分枝杆菌具有毒力并发现这种病原体的化学标记，我们将其脂质谱与衰弱但相关的分枝杆菌——卡介苗分枝杆菌的脂质谱进行比较。这种策略发现了一个以前未知的结核分枝杆菌特异性脂质——1-结核菌素腺苷，它是由Rv3378c酶产生的。Rv3378c的晶体结构提供了支持药物设计以抑制异戊烷转移的信息。发现1-结核菌素腺苷为我们提供了了解结核分枝杆菌如何在巨噬细胞中抵抗杀菌和诊断结核病的新靶点。

• Stereoselective Synthesis of 1-Tuberculosinyl Adenosine; a Virulence Factor of <i>Mycobacterium tuberculosis</i>
  作者：Jeffrey Buter、Dorus Heijnen、Ieng Chim Wan、F. Matthias Bickelhaupt、David C. Young、Edwin Otten、D. Branch Moody、Adriaan J. Minnaard

  DOI：10.1021/acs.joc.6b01332

  日期：2016.8.5

  challenging. Here, a multigram-scale stereoselective synthesis of 1-TbAd and N6-TbAd is described. As a key-step, a chiral auxiliary-mediated Diels–Alder cycloaddition was developed, introducing the three stereocenters with a high exo endo ratio (10:1) and excellent enantioselectivity (>98% ee). This constitutes the first entry into the stereoselective synthesis of diterpenes with the halimane skeleton

  尽管结核分枝杆菌( Mtb ) 感染是世界上最流行和最致命的细菌病原体之一，但它并不能通过快速且高度可靠的检测进行常规诊断。一项发现Mtb特异性生物标志物的计划最近鉴定了两种天然化合物：1-结核菌素腺苷 (1-TbAd) 和N 6 -结核菌素腺苷 ( N 6 -TbAd)。基于它们与毒力的关联、自然界中缺乏类似化合物、存在多个立体中心以及需要丰富的产品来开发诊断测试，这些化合物的合成被认为具有高价值但具有挑战性。在此，描述了1-TbAd和N 6 -TbAd的多克规模立体选择性合成。作为关键步骤，开发了手性辅助介导的狄尔斯-阿尔德环加成反应，引入了具有高外切内比（10:1）和优异对映选择性（>98%ee）的三个立构中心。这是首次利用卤烷骨架立体选择性合成二萜。计算研究解释了观察到的立体化学结果。