我们已经设计,合成和体外测试了一类新型的非共价凝血酶
抑制剂。这些
抑制剂的主要特征是6,5-稠合的双环核心结构,该结构充满了凝血酶活性位点的S2口袋。自行车将构象约束引入
配体中,并将Xaa-Pro酰胺键锁定为所需的反式构型。在已知的环系统中,我们通过分子建模选择了7-
噻吩并
吲哚并酮(BTD)作为我们的基本模板。分析了几个结构特征的影响:精
氨酸侧链的长度,C6处的立体
化学以及优化利用S3袋的重要性。最后,以2.3 A的分辨率获得了与凝血酶结合的
抑制剂15的X射线晶体结构。这些设计的凝血酶
抑制剂,通过高效合成制备的蛋白质显示出比胰
蛋白酶和其他
丝氨酸蛋白酶高的选择性。基于通过X射线晶体学获得的信息的进一步推导当然应该允许提高效力。