FMOC-L-硫代脯氨酸 | 423719-54-4

• 物质功能分类: 生物化工 - 生化试剂 - 氨基酸
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: FMOC-L-硫代脯氨酸
• 中文别名: (4R)-3-[(9H-F氟-9-甲氧基)羰基]-1,3-苯并噻唑-甲酸；(4R)-3-[(9h-芴-9-甲氧基)羰基]-1,3-噻唑烷-4-羧酸；(R)-3,4-噻唑烷二甲酸3-芴甲基酯
• 英文名称: Fmoc-Thz-OH
• 英文别名: Fmoc-(2R)-thiazolidine-4-carboxylic acid；Fmoc-L-thioproline；Fmoc-L-Thz-OH；Fmoc-thiazolidine-4-carboxylic acid；Fmoc-L-thiazolidine-4-carboxylic acid；N-Fmoc-thioproline；Fmoc-thiazolidine；Fmoc-thioPro-OH；SB02066；(R)-3-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)thiazolidine-4-carboxylic acid；(4R)-3-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-1,3-thiazolidine-4-carboxylic acid
• CAS: 423719-54-4；133054-21-4
• 化学式: C₁₉H₁₇NO₄S
• 分子量: 355.414
• InChiKey: HUWNZLPLVVGCMO-KRWDZBQOSA-N

物化性质

• 熔点：
  153-158 °C
• 沸点：
  591.6±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.402±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  92.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 危险品标志：
  Xn,Xi
• 安全说明：
  S26,S36
• 危险类别码：
  R22
• WGK Germany：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  FMOC-L-硫代脯氨酸 在 哌啶 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 L-硫代脯氨酸
  参考文献：
  名称：

  Inhibitors of an essential mycobacterial cell wall lipase (Rv3802c) as tuberculosis drug leads

  摘要：

  首次描述了一种针对结核分枝杆菌细胞壁脂肪酶Rv3802c的重要靶向抑制剂。领先化合物展示了对该酶的纳摩尔级抑制作用，并在体外对结核分枝杆菌表现出令人鼓舞的抗菌活性，支持将Rv3802c作为一种新型结核病药物靶点。

  DOI：

  10.1039/c0cc05635a
• 作为产物：
  描述：

  氯甲酸-9-芴基甲酯 、 L-硫代脯氨酸 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 FMOC-L-硫代脯氨酸
  参考文献：
  名称：

  蛋白质噻唑烷化的鉴定为氧化应激和甲醛暴露的新型分子签名。

  摘要：

  蛋白质的化学修饰已被充分证明在正常细胞生理中起重要作用，例如细胞信号传导和蛋白质功能。它们还被证明是许多人类疾病如癌症，与年龄相关的病理学和神经退行性疾病的病理生理学的里程碑之一。在这里，我们报告通过与内源性和外源性甲醛与蛋白质中的半胱氨酸残基反应，对新型蛋白质修饰，半胱氨酸噻唑烷化的初步鉴定。我们使用同位素稀释液相色谱-串联质谱法（LC-MS 3），通过对甲醛处理的大肠杆菌（E. coli）中的硫代脯氨酸进行定量，从而开始了这项研究。） 蛋白质。然后，该研究扩展到定量从甲醛和氧化剂暴露的大肠杆菌中获得的蛋白质中的硫代脯氨酸。此外，在一项比较研究中，利用N 6-甲酰赖氨酸（一种定义明确的甲醛与赖氨酸之间的甲酰化产物）来评估甲醛与蛋白质反应中半胱氨酸噻唑烷化的相对反应性和量。预期半胱氨酸噻唑烷化可以用作氧化应激和甲醛暴露的新型生物标记。

  DOI：

  10.1021/acs.chemrestox.6b00271

文献信息

• Cysteine/Penicillamine Ligation Independent of Terminal Steric Demands for Chemical Protein Synthesis
  作者：Yi Tan、Jiasheng Li、Kang Jin、Jiamei Liu、Ziyong Chen、Jun Yang、Xuechen Li

  DOI：10.1002/anie.202003652

  日期：2020.7.27

  The chemical ligation of two unprotected peptides to generate a natural peptidic linkage specifically at the C‐ and N‐termini is a desirable goal in chemical protein synthesis but is challenging because it demands high reactivity and selectivity (chemo‐, regio‐, and stereoselectivity). We report an operationally simple and highly effective chemical peptide ligation involving the ligation of peptides

  化学连接两个未保护的肽以产生天然肽键的化学连接，特别是在C和N端，这是化学蛋白质合成的理想目标，但具有挑战性，因为它需要很高的反应性和选择性（化学，区域和立体选择性） 。我们报道了一种操作简单且高效的化学肽连接方法，该方法包括将具有C末端水杨醛酯的肽与具有N末端半胱氨酸/青霉胺的肽连接。该方法的显着特征包括其对任一连接末端侧基的空间位阻的耐受性，从而允许在否则难以功能化的位点进行灵活断开。此外，该方法可以扩展到选择性脱硫和一锅法连接脱硫反应。
• Probing the Frontiers of Glycoprotein Synthesis: The Fully Elaborated β-Subunit of the Human Follicle-Stimulating Hormone
  作者：Pavel Nagorny、Neeraj Sane、Bernhard Fasching、Baptiste Aussedat、Samuel J. Danishefsky

  DOI：10.1002/anie.201107482

  日期：2012.1.23

  β‐subunit of the human follicle‐stimulating hormone (hFSH) displaying a N‐linked consensus sequence oligosaccharide at each of the two wild‐type sites was synthesized. The glycoprotein has been designed with acetamidomethyl protected cysteine residues, anticipating folding and association with the α‐subunit. This represents the largest realistically glycosylated homogeneous glycoprotein obtained by using

  雄心勃勃的任务：合成了在两个野生型位点上显示 N 连接共有序列寡糖的人卵泡刺激素 (hFSH) 的 β 亚基。该糖蛋白被设计为具有乙酰氨基甲基保护的半胱氨酸残基，预期折叠并与 α 亚基结合。这代表了通过严格使用化学方法获得的最大的实际糖基化均质糖蛋白。
• Solid-phase Synthesis of 2,3,5-Triketopiperadine
  作者：Shingo Makino、Eiji Nakanishi、Takashi Tsuji

  DOI：10.1055/s-2003-38757

  日期：——

  The synthesis of 2,3,5-triketopiperadines on solid-support has been achieved for the first time. Cyclization of 4 using oxalyl diimidazole proceeded excellently with N-methyl amino acids except for Sarcosine (Sar). On the other hand, this cyclization did not proceed well when amino acids without N-methyl substitution were used. This can be explained by the lower energy difference between the trans and cis configurations of oxalyl amide 5 by the introduction of N-methyl substitution, because cis conformation is necessary for the cyclization to proceed. This cyclization also worked well with amino acids with a six-membered ring such as tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid (Tic) and piperidine-2-carboxylic acid (Pic), which are N-alkylated amino acids. Although the purity of the target compounds was found to be low in the case of Sar and amino acids with a five-membered ring such as proline (Pro) and thiazolidine-4-carboxylic acid (Thz) under the same cyclization conditions, we were able to successfully optimize the reaction conditions to give the target compounds with good purity. Furthermore, it was demonstrated that 2,3,5-triketopiperadines with three points diversity could be prepared on solid-support with high purity, showing the generality of this method.

  首次实现了在固相载体上合成2,3,5-三酮哌啶。使用草酰二咪唑进行的4的环化反应在除肌氨酸（Sar）以外的N-甲基氨基酸中表现优异。另一方面，当使用没有N-甲基取代的氨基酸时，这种环化反应进展不佳。这可以解释为通过引入N-甲基取代，草酰胺5的顺反构型之间的能差降低，因为顺式构象是环化反应所必需的。这种环化反应对于具有六元环的氨基酸如四氢异喹啉-3-羧酸（Tic）和哌啶-2-羧酸（Pic）也同样有效，这些是N-烷基化的氨基酸。尽管在同样环化条件下，肌氨酸和具有五元环的氨基酸如脯氨酸（Pro）和噻唑烷-4-羧酸（Thz）的目标化合物纯度较低，但我们成功地优化了反应条件，得到了纯度良好的目标化合物。此外，证明了可以在固相载体上以高纯度制备具有三点多样性的2,3,5-三酮哌啶，显示了该方法的普遍性。
• Deprotection of <i>S</i>-acetamidomethyl cysteine with copper(<scp>ii</scp>) and 1,2-aminothiols under aerobic conditions
  作者：Daishiro Kobayashi、Naoto Naruse、Masaya Denda、Akira Shigenaga、Akira Otaka

  DOI：10.1039/d0ob01475c

  日期：——

  be deprotected with concomitant formation of a disulphide bond connecting the two Cys residues. A mechanistic study on the disulphide formation led to a general protocol for deprotection of the S-Acm group by CuSO4 and a 1,2-aminothiol under aerobic conditions. Application of this new deprotection reaction allowed for the synthesis of Apamin, a peptide with two-disulphides in a one-pot/stepwise disulphide-bridging

  1,3-噻唑烷羰基结构 (THz)的 CuSO 4作为 N 端半胱氨酸 (Cys) 残基的开环表明，分子内S-乙酰氨基甲基半胱氨酸 (Cys(Acm)) 也可以脱保护，同时形成连接两个半胱氨酸残基的二硫键。对二硫化物形成的机理研究导致了在需氧条件下通过 CuSO 4和 1,2-氨基硫醇对S -Acm 基团进行脱保护的一般方案。这种新的脱保护反应的应用允许在单锅/逐步二硫键桥接程序中合成 Apamin，这是一种具有两个二硫键的肽。
• Selection of DNA‐Encoded Dynamic Chemical Libraries for Direct Inhibitor Discovery
  作者：Yuqing Deng、Jianzhao Peng、Feng Xiong、Yinan Song、Yu Zhou、Jianfu Zhang、Fong Sang Lam、Chao Xie、Wenyin Shen、Yiran Huang、Ling Meng、Xiaoyu Li

  DOI：10.1002/anie.202005070

  日期：2020.8.24

  that can identify full ligand structures from large‐scale DEDLs. This method is also able to convert unbiased libraries into focused ones targeting specific protein classes. We demonstrated this method by selecting DEDLs against five proteins, and novel inhibitors were identified for all targets. Notably, several selective BD1/BD2 inhibitors were identified from the selections against bromodomain 4 (BRD4)

  动态组合库（DCL）是生物医学研究中配体发现的强大工具。但是，DCL的低多样性阻碍了它们的应用。最近，DCL中已经采用了DNA编码的概念来创建DNA编码的动态库（DEDL）。但是，当前所有的DEDL都仅限于片段识别，并且在选择后需要一个具有挑战性的片段链接过程。我们报告了一种锚定的DEDL方法，该方法可以从大规模DEDL中识别出完整的配体结构。这种方法还能够将无偏文库转换为针对特定蛋白质类别的集中文库。我们通过选择针对五种蛋白质的DEDLs证明了这种方法，并为所有靶标确定了新型抑制剂。值得注意的是 从针对重要的抗癌药物靶标bromodomain 4（BRD4）的选择中鉴定出了几种选择性的BD1 / BD2抑制剂。这项工作可以为抑制剂发现提供广泛适用的方法。