Fmoc-环戊基-D-Gly-OH | 136555-16-3

• 物质功能分类: 生物化工 - 多肽
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: Fmoc-环戊基-D-Gly-OH
• 中文别名: Fmoc-D-环戊基甘氨酸；FMOC-D-环戊基甘氨酸
• 英文名称: (R)-2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-2-cyclopentylacetic acid
• 英文别名: Fmoc-D-Cpg-OH；(R)-2-((((9H-Fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-cyclopentylacetic acid；(2R)-2-cyclopentyl-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)acetic acid
• CAS: 136555-16-3
• 化学式: C₂₂H₂₃NO₄
• 分子量: 365.429
• InChiKey: JGWHUIQSEKGLAQ-HXUWFJFHSA-N

物化性质

• 沸点：
  590.5±33.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.266±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 海关编码：
  29225090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-环戊基-D-Gly-OH 在 盐酸 、 亚硝酸异戊酯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 H-D-Trp-D-Asp(OtBu)-Pro-D-Gly(cPent)-Leu-N3
  参考文献：
  名称：

  环状五肽内皮素A受体拮抗剂的构效关系。

  摘要：

  天然产物内皮素A（ETA）受体拮抗剂的类似物环（-D-Trp1-D-Glu2-Ala3-D-Val4-Leu5-）（1）和环（-D-Trp1-D-Glu2-Ala3-D -alloIle4-Leu5-）（2）的制备和测试对[125I]内皮素（ET-1）与蛋白质ETA受体结合的抑制活性。天然产物的DDLDL手性序列似乎对于抑制活性至关重要，因为D-Trp或D-Glu（或两者）在1中转化为相应的L-异构体消除了该特性。在天然产物的每个位置上的系统修饰阐明了结构-活性关系，并导致了高效和选择性的ETA受体拮抗剂。D-Trp1和Leu5多数被其他氨基酸替代导致抑制活性的显着降低。相反，用D-Asp2替代D-Glu2增强了活性。关于Ala3的位置，所有具有亚氨基酸的类似物，无论是环状的还是无环的，都比氨基酸类似物具有更高的亲和力。另外，大多数在其侧链中具有各种官能团的氨基酸替代物并未显着改变ETA结合亲和力。D-Val4

  DOI：

  10.1021/jm00021a021

文献信息

• Enhancement of Hydrophobic Interactions and Hydrogen Bond Strength by Cooperativity: Synthesis, Modeling, and Molecular Dynamics Simulations of a Congeneric Series of Thrombin Inhibitors
  作者：Laveena Muley、Bernhard Baum、Michael Smolinski、Marek Freindorf、Andreas Heine、Gerhard Klebe、David G. Hangauer

  DOI：10.1021/jm9016416

  日期：2010.3.11

  that engages in a hydrogen bond with Gly 216. The first series of inhibitors has a m-chlorobenzyl moiety binding in the S1 pocket, and the second has a benzamidine moiety. When the adjacent hydrogen bond is present, the enhanced binding affinity per Å2 of hydrophobic contact surface in the S3 pocket improves by 75% and 59%, respectively, over the inhibitors lacking this hydrogen bond. This improvement

  通过计算方法准确预测配体与其受体的结合亲和力是基于结构的药物设计的主要挑战之一。这些预测中潜在的重大错误之一是非共价相互作用的配体结合亲和力贡献是可加的共同假设。本文中，我们介绍了从两个单独的凝血酶抑制剂系列中获得的数据，这些凝血酶抑制剂的大小不断增加，并结合在S3口袋中，并带有或不带有与Gly 216氢键键合的相邻胺的疏水侧链。一米的S1'袋-氯苄基部分结合，并且所述第二具有苄脒部分。当相邻氢键存在时，增强的每的结合亲和力2与缺少该氢键的抑制剂相比，S3袋中疏水接触表面的表面张力分别提高了75％和59％。每结合亲和力的这种改进2演示了疏水相互作用和氢键间的协同性。
• The discovery of a potent and selective lethal factor inhibitor for adjunct therapy of anthrax infection
  作者：Yusheng Xiong、Judyann Wiltsie、Andrea Woods、Jian Guo、James V. Pivnichny、Wei Tang、Alka Bansal、Richard T. Cummings、Barry R. Cunningham、Arthur M. Friedlander、Cameron M. Douglas、Scott P. Salowe、Dennis M. Zaller、Edward M. Scolnick、Dennis M. Schmatz、Kenneth Bartizal、Jeffrey D. Hermes、Malcolm MacCoss、Kevin T. Chapman

  DOI：10.1016/j.bmcl.2005.10.088

  日期：2006.2

  A potent and selective anthrax LF inhibitor 40, (2R)-2-[(4-fluoro-3-methylphenyl)sulfonylamino]-N-hydroxy-2-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)acetamide, was identified through SAR study of a high throughput screen lead. It has an IC50 of 54 nM in the enzyme assay and an IC50 of 210 nM in the macrophage cytotoxicity assay. Compound 40 is also effective in vivo in several animal model studies. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• WO2022/265577
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• Structure-Activity Relationships of Cyclic Pentapeptide Endothelin A Receptor Antagonists
  作者：Takehiro Fukami、Toshio Nagase、Kagari Fujita、Takashi Hayama、Kenji Niiyama、Toshiaki Mase、Shigeru Nakajima、Takahiro Fukuroda、Toshihiko Saeki

  DOI：10.1021/jm00021a021

  日期：1995.10

  D-heteroarylglycine was preferable at this position. Among synthesized cyclic pentapeptides, compound 36 (BQ-518) was the most potent ETA receptor antagonist, with a pA2 of 8.1 against ET-1-induced vasoconstriction in isolated porcine coronary arteries. This compound also showed the greatest selectivity between ETA and ETB receptors (IC50 for human ETA = 1.2 nM, IC50 for human ETB = 55 microM). In contrast, compound

  天然产物内皮素A（ETA）受体拮抗剂的类似物环（-D-Trp1-D-Glu2-Ala3-D-Val4-Leu5-）（1）和环（-D-Trp1-D-Glu2-Ala3-D -alloIle4-Leu5-）（2）的制备和测试对[125I]内皮素（ET-1）与蛋白质ETA受体结合的抑制活性。天然产物的DDLDL手性序列似乎对于抑制活性至关重要，因为D-Trp或D-Glu（或两者）在1中转化为相应的L-异构体消除了该特性。在天然产物的每个位置上的系统修饰阐明了结构-活性关系，并导致了高效和选择性的ETA受体拮抗剂。D-Trp1和Leu5多数被其他氨基酸替代导致抑制活性的显着降低。相反，用D-Asp2替代D-Glu2增强了活性。关于Ala3的位置，所有具有亚氨基酸的类似物，无论是环状的还是无环的，都比氨基酸类似物具有更高的亲和力。另外，大多数在其侧链中具有各种官能团的氨基酸替代物并未显着改变ETA结合亲和力。D-Val4