[3-15N,4-15NH2]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)cytidine | 833447-60-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: [3-15N,4-15NH2]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)cytidine
• 英文别名: 3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)-[3-15N,4-amino-15N]cytidine；1-[(6aR,8R,9R,9aS)-9-hydroxy-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-4-(15N)azanyl(315N)pyrimidin-2-one
• CAS: 833447-60-2
• 化学式: C₂₁H₃₉N₃O₆Si₂
• 分子量: 487.715
• InChiKey: KPNSXQNKDQMBAW-ODVPDDBVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.04
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  乙酸酐 、 [3-15N,4-15NH2]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)cytidine 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 以100%的产率得到[3-15N,4-15NH2]-4-acetyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)cytidine
  参考文献：
  名称：

  同位素标记的嘌呤霉素衍生物的合成，用于核糖体催化肽键形成的动力学同位素效应分析

  摘要：

  核糖体催化肽键形成的机制仍存在争议。在这里，我们描述了可用于动力学同位素效应实验中的二核苷酸的合成，以评估核糖体催化的肽键形成的过渡态。这些底物是同位素标记的二核苷酸胞嘧啶-（3'-5'）-3'-氨基-3'-脱氧-3'-1-苯丙氨酰基-N 6，N 6-二甲基腺苷（Cm 6 A N Phe-NH 2）和胞嘧啶-（3'-5'）-3'-氨基-3'-脱氧-3'-（1-2-羟基-3-苯基丙酰基）-N 6，N 6-二甲基腺苷（Cm 6 A NPhe-OH）。这些底物在肽键形成中具有活性，可用于测量核糖体催化的蛋白质合成中的动力学同位素效应。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2004.10.023
• 作为产物：
  描述：

  1,3二氯-1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷 、 [3-15N,4-15NH2]-cytidine 在 吡啶 作用下， 反应 4.0h， 以90%的产率得到[3-15N,4-15NH2]-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)cytidine
  参考文献：
  名称：

  用于核糖体肽基转移酶反应的同位素标记 P 位点底物的合成

  摘要：

  核糖体 P 位点底物的同位素异构体，即三核苷酸肽偶联物 CCA-pcb（Zhong, M.；Strobel, SA Org. Lett. 2006 , 8 , 55-58），已通过 26-35 个步骤设计和合成。这些包括氨基酸的 α-氢、羰基碳和羰基氧、腺苷的 O2' 和 O3' 处的单个同位素取代，以及两个胞苷的 N3 和 N4 中的远程标记。这些同位素是通过将胞苷酰-(3',5')-胞苷亚磷酰胺同位素作为常见的合成中间体与同位素取代的 A-Phe-cap-生物素 (A-pcb) 偶联来合成的。1- 13 C (Phe)、2- 2 H (Phe) 和 3,4- 15 N 2的同位素富集率高于 99%(胞苷)，2'/3'- 18 O (腺苷)为 93% ，1- 18 O (Phe)为 64% 。已开发出一种高富集 [1- 18 O 2 ] 苯丙氨酸的新合成方法。[3'- 18 O]腺苷的合

  DOI：

  10.1021/jo702070m