4-{[3-(4-carboxybutyl)benzothiazol-2-ylidene]methyl}-1-(2-carboxyethyl)quinolinium bromide | 1415986-69-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 4-{[3-(4-carboxybutyl)benzothiazol-2-ylidene]methyl}-1-(2-carboxyethyl)quinolinium bromide
• 英文别名: 4-{[3-(4-Carboxybutyl) Benzothiazol-2-ylidene]methyl}-1-(2-Carboxyethyl)quinolinium Bromide；5-[2-[[1-(2-carboxyethyl)quinolin-1-ium-4-yl]methylidene]-1,3-benzothiazol-3-yl]pentanoic acid;bromide
• CAS: 1415986-69-4
• 化学式: Br*C₂₅H₂₅N₂O₄S
• 分子量: 529.454
• InChiKey: CMAXFVBORDANEK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.77
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-{[3-(4-carboxybutyl)benzothiazol-2-ylidene]methyl}-1-(2-carboxyethyl)quinolinium bromide 在 N-甲基吡咯烷酮 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 32.25h， 生成 N,N-bis(({[3-(4-valeryl)benzoxazol-2-ylidene]methyl}quinoline)-2-amidoethyl)ethylamine
  参考文献：
  名称：

  标记有去甲基噻唑橙的核酸探针：用于活细胞RNA成像的新型杂交敏感荧光寡核苷酸† ‡

  摘要：

  已经开发了具有去甲基噻唑橙染料的新的荧光核苷酸D' 505，以扩展用于活细胞RNA成像的荧光探针的功能。用于DNA自动合成的D' 505的核苷单元可溶于有机溶剂，这使得核苷单元的制备和DNA合成循环中的反应更加有效。含有D' 505的寡脱氧核苷酸的染料在低于pH 7的条件下被质子化，并且通过控制D' 505染料的激子相互作用，该寡脱氧核苷酸表现出杂交敏感的荧光发射。。简化的过程和有效的对杂交敏感的荧光发射产生了多色的对杂交敏感的荧光探针，可用于活细胞RNA成像。受体漂白法为我们提供了许多活细胞中特定细胞中RNA的信息。

  DOI：

  10.1039/c2ob26707a
• 作为产物：
  描述：

  喹啉 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.17h， 生成 4-{[3-(4-carboxybutyl)benzothiazol-2-ylidene]methyl}-1-(2-carboxyethyl)quinolinium bromide
  参考文献：
  名称：

  标记有去甲基噻唑橙的核酸探针：用于活细胞RNA成像的新型杂交敏感荧光寡核苷酸† ‡

  摘要：

  已经开发了具有去甲基噻唑橙染料的新的荧光核苷酸D' 505，以扩展用于活细胞RNA成像的荧光探针的功能。用于DNA自动合成的D' 505的核苷单元可溶于有机溶剂，这使得核苷单元的制备和DNA合成循环中的反应更加有效。含有D' 505的寡脱氧核苷酸的染料在低于pH 7的条件下被质子化，并且通过控制D' 505染料的激子相互作用，该寡脱氧核苷酸表现出杂交敏感的荧光发射。。简化的过程和有效的对杂交敏感的荧光发射产生了多色的对杂交敏感的荧光探针，可用于活细胞RNA成像。受体漂白法为我们提供了许多活细胞中特定细胞中RNA的信息。

  DOI：

  10.1039/c2ob26707a

文献信息

• COMPOUND, NUCLEIC ACID, METHOD FOR PRODUCING NUCLEIC ACID, AND KIT FOR PRODUCING NUCLEIC ACID
  申请人：Okamoto Akimitsu

  公开号：US20130289263A1

  公开（公告）日：2013-10-31

  A compound is represented by the following formula ( 1 ), ( 2 ), or ( 3 ) (where, in the above formulae ( 1 ), ( 2 ), and ( 3 ), Z 11 and Z 12 independently have a fluorescent property and are an uncharged atomic group exhibiting an exciton effect).

  一个化合物由以下公式（1）、（2）或（3）表示（其中，在上述公式（1）、（2）和（3）中，Z11和Z12独立具有荧光性质，并且是表现出激子效应的不带电原子团）。
• US9499576B2
  申请人：——

  公开号：US9499576B2

  公开（公告）日：2016-11-22
• [EN] COMPOUND, NUCLEIC ACID, METHOD FOR PRODUCING NUCLEIC ACID, AND KIT FOR PRODUCING NUCLEIC ACID<br/>[FR] COMPOSÉ, ACIDE NUCLÉIQUE, PROCÉDÉ DE PRODUCTION D'ACIDE NUCLÉIQUE, ET TROUSSE POUR LA PRODUCTION D'ACIDE NUCLÉIQUE
  申请人：RIKEN

  公开号：WO2012091091A1

  公开（公告）日：2012-07-05

  　下記式（１）、（２）または（３）で表されることを特徴とする、化合物。（上記式（１）、（２）および（３）中、Ｚ１１およびＺ１２は、それぞれ独立して蛍光性を有し、かつエキシトン効果を示す原子団であって、電荷を有さない原子団である。）
• A nucleic acid probe labeled with desmethyl thiazole orange: a new type of hybridization-sensitive fluorescent oligonucleotide for live-cell RNA imaging
  作者：Akimitsu Okamoto、Kaori Sugizaki、Mizue Yuki、Hiroyuki Yanagisawa、Shuji Ikeda、Takuma Sueoka、Gosuke Hayashi、Dan Ohtan Wang

  DOI：10.1039/c2ob26707a

  日期：——

  A new fluorescent nucleotide with desmethyl thiazole orange dyes, D′505, has been developed for expansion of the function of fluorescent probes for live-cell RNA imaging. The nucleoside unit of D′505 for DNA autosynthesis was soluble in organic solvents, which made the preparation of nucleoside units and the reactions in the cycles of DNA synthesis more efficient. The dyes of D′505-containing oligodeoxynucleotide

  已经开发了具有去甲基噻唑橙染料的新的荧光核苷酸D' 505，以扩展用于活细胞RNA成像的荧光探针的功能。用于DNA自动合成的D' 505的核苷单元可溶于有机溶剂，这使得核苷单元的制备和DNA合成循环中的反应更加有效。含有D' 505的寡脱氧核苷酸的染料在低于pH 7的条件下被质子化，并且通过控制D' 505染料的激子相互作用，该寡脱氧核苷酸表现出杂交敏感的荧光发射。。简化的过程和有效的对杂交敏感的荧光发射产生了多色的对杂交敏感的荧光探针，可用于活细胞RNA成像。受体漂白法为我们提供了许多活细胞中特定细胞中RNA的信息。