(2R,4S,5R)-N-(benzyloxy)carbonyl-2-[2-(N-benzoylamino)-4-oxo-3,4-dihydropyrimidin-5-yl]-4-hydroxy-5-hydroxymethyl pyrrolidine | 855519-63-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (2R,4S,5R)-N-(benzyloxy)carbonyl-2-[2-(N-benzoylamino)-4-oxo-3,4-dihydropyrimidin-5-yl]-4-hydroxy-5-hydroxymethyl pyrrolidine
• 英文别名: benzyl (2R,3S,5R)-5-(2-benzamido-6-oxo-1H-pyrimidin-5-yl)-3-hydroxy-2-(hydroxymethyl)pyrrolidine-1-carboxylate
• CAS: 855519-63-0
• 化学式: C₂₄H₂₄N₄O₆
• 分子量: 464.478
• InChiKey: MZCQEWABEXOKHP-AQNXPRMDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,4S,5R)-N-(benzyloxy)carbonyl-2-[2-(N-benzoylamino)-4-oxo-3,4-dihydropyrimidin-5-yl]-4-hydroxy-5-hydroxymethyl pyrrolidine 在 palladium on activated charcoal ammonium hydroxide 、 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 (2R,4S,5R)-2-(2-amino-4-oxo-3,4-dihydropyrimidin-5-yl)-4-hydroxy-5-hydroxymethyl pyrrolidine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and triplex forming properties of pyrrolidino pseudoisocytidine containing oligodeoxynucleotides

  摘要：

  吡咯烷假C-核苷是天然脱氧核苷的电子等排体，其在生理条件下在吡咯烷环氮处质子化。作为形成三链体的寡脱氧核苷酸 (TFO) 的组成部分，正电荷有望通过与目标 DNA 的磷酸二酯主链的静电相互作用来稳定 DNA 三螺旋。我们描述了吡咯烷异胞苷假核苷和相应的亚磷酰胺结构单元的合成以及将其掺入 TFO 中。与未修饰的寡脱氧核苷酸相比，此类 TFO 显示出显着增加的 DNA 亲和力。亲和力的增加被证明是由于吡咯烷亚基上的正电荷。

  DOI：

  10.1039/b502799c
• 作为产物：
  描述：

  (2R,5R)-N-(benzyloxy)carbonyl-2-[2-(N-benzoylamino)-4-oxo-3,4-dihydropyrimidin-5-yl]-4-[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxy-5-[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxymethyl-aza-cyclopent-3-ene 在 三乙酰氧基硼氢化钠 、 氟化氢吡啶 、 溶剂黄146 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 (2R,4S,5R)-N-(benzyloxy)carbonyl-2-[2-(N-benzoylamino)-4-oxo-3,4-dihydropyrimidin-5-yl]-4-hydroxy-5-hydroxymethyl pyrrolidine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and triplex forming properties of pyrrolidino pseudoisocytidine containing oligodeoxynucleotides

  摘要：

  吡咯烷假C-核苷是天然脱氧核苷的电子等排体，其在生理条件下在吡咯烷环氮处质子化。作为形成三链体的寡脱氧核苷酸 (TFO) 的组成部分，正电荷有望通过与目标 DNA 的磷酸二酯主链的静电相互作用来稳定 DNA 三螺旋。我们描述了吡咯烷异胞苷假核苷和相应的亚磷酰胺结构单元的合成以及将其掺入 TFO 中。与未修饰的寡脱氧核苷酸相比，此类 TFO 显示出显着增加的 DNA 亲和力。亲和力的增加被证明是由于吡咯烷亚基上的正电荷。

  DOI：

  10.1039/b502799c