Trimethyldeoxyuridine | 60951-08-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Trimethyldeoxyuridine
• 英文别名: 3',5'-di-O-methyl-N-methyl-2'-desoxyuridine；1-[(2R,4S,5R)-4-methoxy-5-(methoxymethyl)oxolan-2-yl]-3-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 60951-08-8
• 化学式: C₁₂H₁₈N₂O₅
• 分子量: 270.285
• InChiKey: DRVULBWIVCAWLC-IQJOONFLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  68.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N³-methyl-3′,5′-di-O-methyl-thymidine 、 乙腈 在 ammonium cerium (IV) nitrate 、 水 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.5h， 以23%的产率得到5-nitratomethylene-3',5'-di-O-methyl-N-methyl-2'-desoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Oxidative Damage of Thymidines by the Atmospheric Free-Radical Oxidant NO3•

  摘要：

  对硝酸根（NO3 -与 N-、O-甲基化和乙酰化胸腺嘧啶 1a 和 1b 反应形成的产物进行分析，首次揭示了这种重要的大气自由基氧化剂是如何对 DNA 构建模块造成不可逆损伤的。机理研究表明，最初的反应步骤可能是通过 NO3 - 诱导嘧啶环上的电子转移，然后 C5 上的甲基发生去质子化反应。氧化作用最终会形成硝酸盐 2 和醛类 4，在[NO3-]含量较高的情况下，还会形成羧基。 -]的情况下，还会产生羧酸 5。除此以外，通过一个非常次要的途径，C5 上的甲基也会发生脱失，从而生成相应的 2′-脱氧尿苷 6。硝酸盐 2 是高度易变的化合物，在反应混合物的加工和纯化过程中会发生快速水解，这可能导致对实验结果和反应机理的严重误解。NO3 - 加到嘧啶环的 C5=C6 双键上所产生的产物未被观察到。此外，也没有观察到 NO3 - 与 2′-脱氧核糖分子的反应。

  DOI：

  10.1071/ch11102

文献信息

• Oxidative Damage of Thymidines by the Atmospheric Free-Radical Oxidant NO3•
  作者：Uta Wille、Catrin Goeschen

  DOI：10.1071/ch11102

  日期：——

  Analysis of the products formed in the reaction of nitrate radicals, NO3 •, with the N- and O-methylated and acetylated thymidines 1a and 1b revealed, for the first time, insight regarding how this important atmospheric free-radical oxidant can cause irreversible damage to DNA building blocks. Mechanistic studies indicated that the initial reaction step likely proceeds via NO3 • induced electron transfer at the pyrimidine ring, followed by deprotonation of the methyl group at C5. The oxidation ultimately leads to formation of nitrates 2, aldehydes 4 and, in the case of high [NO3 •], also to carboxylic acids 5. In addition to this, through a very minor pathway, loss of the methyl group at C5 also occurred to give the respective 2′-deoxyuridines 6. The nitrates 2 are highly labile compounds that undergo rapid hydrolysis during work-up and purification of the reaction mixtures, which could lead to serious misinterpretation of the experimental findings and reaction mechanism. Products resulting from NO3 • addition to the C5=C6 double bond in the pyrimidine ring were not observed. Also, no reaction of NO3 • with the 2′-deoxyribose moiety was detected.

  对硝酸根（NO3 -与 N-、O-甲基化和乙酰化胸腺嘧啶 1a 和 1b 反应形成的产物进行分析，首次揭示了这种重要的大气自由基氧化剂是如何对 DNA 构建模块造成不可逆损伤的。机理研究表明，最初的反应步骤可能是通过 NO3 - 诱导嘧啶环上的电子转移，然后 C5 上的甲基发生去质子化反应。氧化作用最终会形成硝酸盐 2 和醛类 4，在[NO3-]含量较高的情况下，还会形成羧基。 -]的情况下，还会产生羧酸 5。除此以外，通过一个非常次要的途径，C5 上的甲基也会发生脱失，从而生成相应的 2′-脱氧尿苷 6。硝酸盐 2 是高度易变的化合物，在反应混合物的加工和纯化过程中会发生快速水解，这可能导致对实验结果和反应机理的严重误解。NO3 - 加到嘧啶环的 C5=C6 双键上所产生的产物未被观察到。此外，也没有观察到 NO3 - 与 2′-脱氧核糖分子的反应。