N³-methyl-3′,5′-di-O-methyl-thymidine | 65150-68-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N³-methyl-3′,5′-di-O-methyl-thymidine
• 英文别名: 3',5'-di-O-methyl-N-methyl-2'-desoxythymidine；3,O^3'_,O5'-trimethyl-thymidine；1-[(2R,4S,5R)-4-methoxy-5-(methoxymethyl)oxolan-2-yl]-3,5-dimethylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 65150-68-7
• 化学式: C₁₃H₂₀N₂O₅
• 分子量: 284.312
• InChiKey: XUYFDMFCAKVUOO-HBNTYKKESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  68.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N³-methyl-3′,5′-di-O-methyl-thymidine 在 18-冠醚-6 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 2.0h， 以53.6%的产率得到1-((2R,4S,5R)-4-Methoxy-5-methoxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-3,4-dimethyl-1,3-dihydro-imidazol-2-one
  参考文献：
  名称：

  胸腺嘧啶衍生物被超氧化物氧化

  摘要：

  烷基化的胸腺嘧啶和胸腺嘧啶核苷衍生物被超氧化钾转化为相应的环收缩的咪唑啉酮衍生物；提出了一个合理的机制。

  DOI：

  10.1039/c39880001171
• 作为产物：
  描述：

  3-甲基胸苷 、 碘甲烷 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.08h， 生成 N³-methyl-3′,5′-di-O-methyl-thymidine
  参考文献：
  名称：

  寻找黄病毒抑制剂的第2部分：三甲基化，二苯基甲基化和其他烷基化的核苷类似物

  摘要：

  几种黄病毒，例如黄热病病毒和登革热病毒，会在人体内引起严重的致命感染。继我们最初的命中3'，5'-双歧化尿苷1之后，合成了一系列烷基化核苷类似物，并评估了它们对登革热病毒和黄热病病毒的体外抗病毒活性。迄今为止，烷基和芳基连接在糖环的各个位置，并带有杂环碱基的细微变化。在新的衍生物系列中，3'，5'- di- O-三苯甲基-5-氟-2'-脱氧尿苷（39）是该系列中最有效的衍生物，可抑制黄热病病毒和登革热病毒的复制，其50有效浓度百分比（EC 50）〜1μg/ mL，无明显细胞毒性。其他氟化衍生物被证明更具毒性。几乎所有具有3'，5'-二-O-苯甲酰基-2'-脱氧尿苷（50）的二苯基甲基化嘧啶核苷都具有很强的低至1μg/ mL的细胞毒性作用。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2014.02.011

文献信息

• Oxidative Damage of Pyrimidine Nucleosides by the Environmental Free Radical Oxidant NO3• in the Absence and Presence of NO2• and Other Radical and Non-Radical Oxidants
  作者：Catrin Goeschen、Jonathan M. White、Robert W. Gable、Uta Wille

  DOI：10.1071/ch11446

  日期：——

  promotes conversion of the initially formed radical cation 7 to 4 in an autocatalytic fashion. When the reaction of NO2• with O3 was used to generate NO3•, the initially formed radical cation 7 in the reaction with permethylated uridine 1 is rapidly trapped by NO2• to give 5-nitrouridine 18 in a radical mediated vinylic substitution reaction. In contrast to this, under similar conditions in the reaction involving

  分析在溶液中环境自由基氧化剂NO 3 •与全甲基化尿苷1和胸苷2的反应中形成的产物，发现在最初的NO 3 •在嘧啶环上引起氧化电子转移后，反应路径非常复杂。发现产物的形成不仅取决于核碱基的性质，而且取决于其他自由基氧化剂，即NO 2 •的存在。在1与NO 3 •的反应中，这是通过CAN光解产生的，除了形成高度氧化的核苷衍生物4作为主要产物，C–N糖苷键也确实发生了断裂，导致核糖内酯5和游离核碱基6的形成。建议的机理涉及在反应过程中原位生成NO 2 •，这会以自催化方式促进最初形成的自由基阳离子7转化为4。 当使用NO 2 •与O 3的反应生成NO 3 •时，与过甲基化尿苷1反应的最初形成的自由基阳离子7被NO 2 •迅速捕获，从而在自由基介导的乙烯基取代中生成5-硝基尿苷18反应。与此相反，在涉及胸腺嘧啶核苷2的反应中，在相似的条件下，获得了高度氧化的产物20和21作为主要化合物，这是由于加至C5-C6双键而产生的。NO
• Oxidative Damage of Thymidines by the Atmospheric Free-Radical Oxidant NO3•
  作者：Uta Wille、Catrin Goeschen

  DOI：10.1071/ch11102

  日期：——

  Analysis of the products formed in the reaction of nitrate radicals, NO3 •, with the N- and O-methylated and acetylated thymidines 1a and 1b revealed, for the first time, insight regarding how this important atmospheric free-radical oxidant can cause irreversible damage to DNA building blocks. Mechanistic studies indicated that the initial reaction step likely proceeds via NO3 • induced electron transfer at the pyrimidine ring, followed by deprotonation of the methyl group at C5. The oxidation ultimately leads to formation of nitrates 2, aldehydes 4 and, in the case of high [NO3 •], also to carboxylic acids 5. In addition to this, through a very minor pathway, loss of the methyl group at C5 also occurred to give the respective 2′-deoxyuridines 6. The nitrates 2 are highly labile compounds that undergo rapid hydrolysis during work-up and purification of the reaction mixtures, which could lead to serious misinterpretation of the experimental findings and reaction mechanism. Products resulting from NO3 • addition to the C5=C6 double bond in the pyrimidine ring were not observed. Also, no reaction of NO3 • with the 2′-deoxyribose moiety was detected.

  对硝酸根（NO3 -与 N-、O-甲基化和乙酰化胸腺嘧啶 1a 和 1b 反应形成的产物进行分析，首次揭示了这种重要的大气自由基氧化剂是如何对 DNA 构建模块造成不可逆损伤的。机理研究表明，最初的反应步骤可能是通过 NO3 - 诱导嘧啶环上的电子转移，然后 C5 上的甲基发生去质子化反应。氧化作用最终会形成硝酸盐 2 和醛类 4，在[NO3-]含量较高的情况下，还会形成羧基。 -]的情况下，还会产生羧酸 5。除此以外，通过一个非常次要的途径，C5 上的甲基也会发生脱失，从而生成相应的 2′-脱氧尿苷 6。硝酸盐 2 是高度易变的化合物，在反应混合物的加工和纯化过程中会发生快速水解，这可能导致对实验结果和反应机理的严重误解。NO3 - 加到嘧啶环的 C5=C6 双键上所产生的产物未被观察到。此外，也没有观察到 NO3 - 与 2′-脱氧核糖分子的反应。
• Regio-and Stereoselective Functionalization of Pyrimidinediones by Cohalogenation with Oxygen Nucleophiles
  作者：Nathalie Baret、Jean-Pierre Dulcere、Jean Rodriguez

  DOI：10.1080/07328319808004225

  日期：1998.6

  A detailed study of the regio-and stereoselective electrophilic functionalization of the C5-C6 double bond in the uracil and thymine series using the cohalogenation with various oxygen nucleophiles is described.
• HARAYAME, TAKASHI;MORI, KENYA;YANADA, REIKO;IIO, KUMIKO;FUJITA, YUKI;YONE+, J. CHEM. SOC. CHEM. COMMUN.,(1988) N 17, C. 1171-1172
  作者：HARAYAME, TAKASHI、MORI, KENYA、YANADA, REIKO、IIO, KUMIKO、FUJITA, YUKI、YONE+

  DOI：——

  日期：——
• In search of Flavivirus inhibitors part 2: Tritylated, diphenylmethylated and other alkylated nucleoside analogues
  作者：Milind Saudi、Joanna Zmurko、Suzanne Kaptein、Jef Rozenski、Johan Neyts、Arthur Van Aerschot

  DOI：10.1016/j.ejmech.2014.02.011

  日期：2014.4

  hit 3′,5′-bistritylated uridine 1, a series of alkylated nucleoside analogues were synthesized and evaluated for their in vitro antiviral activities against dengue fever virus and yellow fever virus. Hereto, alkyl and aryl groups were attached at various positions of the sugar ring combined with subtle variation of the heterocyclic base. Among the new series of derivatives, 3′,5′-di-O-trityl-5-fluoro-2′-deoxyuridine

  几种黄病毒，例如黄热病病毒和登革热病毒，会在人体内引起严重的致命感染。继我们最初的命中3'，5'-双歧化尿苷1之后，合成了一系列烷基化核苷类似物，并评估了它们对登革热病毒和黄热病病毒的体外抗病毒活性。迄今为止，烷基和芳基连接在糖环的各个位置，并带有杂环碱基的细微变化。在新的衍生物系列中，3'，5'- di- O-三苯甲基-5-氟-2'-脱氧尿苷（39）是该系列中最有效的衍生物，可抑制黄热病病毒和登革热病毒的复制，其50有效浓度百分比（EC 50）〜1μg/ mL，无明显细胞毒性。其他氟化衍生物被证明更具毒性。几乎所有具有3'，5'-二-O-苯甲酰基-2'-脱氧尿苷（50）的二苯基甲基化嘧啶核苷都具有很强的低至1μg/ mL的细胞毒性作用。