(R)-4-((4-(2,2-diphenylacetamido)-1-(4-hydroxyphenyl)-9-imino-3,11,22-trioxo-15,18-dioxa-2,8,10,12,21-pentaazatetracosan-24-yl)(methyl)amino)pyridinium 2,2,2-trifluoroacetate | 1365543-80-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (R)-4-((4-(2,2-diphenylacetamido)-1-(4-hydroxyphenyl)-9-imino-3,11,22-trioxo-15,18-dioxa-2,8,10,12,21-pentaazatetracosan-24-yl)(methyl)amino)pyridinium 2,2,2-trifluoroacetate
• 英文别名: (2R)-5-[[amino-[2-[2-[2-[3-[methyl(pyridin-4-yl)amino]propanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoylamino]methylidene]amino]-2-[(2,2-diphenylacetyl)amino]-N-[(4-hydroxyphenyl)methyl]pentanamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
• CAS: 1365543-80-1
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₄₃H₅₅N₉O₇
• 分子量: 923.99
• InChiKey: FOFZVHFQPWYLNH-GKEJWYBXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.42
• 重原子数：
  66
• 可旋转键数：
  25
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  259
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-甲氨基吡啶 在 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 (R)-4-((4-(2,2-diphenylacetamido)-1-(4-hydroxyphenyl)-9-imino-3,11,22-trioxo-15,18-dioxa-2,8,10,12,21-pentaazatetracosan-24-yl)(methyl)amino)pyridinium 2,2,2-trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and characterization of DMAP-modified NPY Y1 receptor antagonists as acyl-transfer catalysts

  摘要：

  从工作假设出发，我们认为特定的化学标记可能是一种吸引人的方法来检测和研究G蛋白偶联受体（GPCRs），我们合成了神经肽Y1受体（Y1R）的具有催化活性的拮抗剂。将一种精氨酸酰胺型的Y1R拮抗剂支架与DMAP基团通过不同长度和化学性质的间隔物结合。这些杂化化合物对Y1R的亲和力在两位数的纳摩尔范围内，并且能够催化酰基转移反应到生物亲核素的替代物上，这一点在没有细胞的情况下使用荧光染料的酯作为缓冲液中的底物时得到了证明。相比之下，由于与生物分子发生的显著非催化（与Y1R配体无关）反应，以及细胞表面Y1R密度的限制，未能实现对活MCF-7细胞上Y1R的选择性染色。尽管这也可能取决于染色试剂的选择性不足，但本研究的结果表明，催化染色的普遍适用性需要重新考虑，因为这种方法受到与膜蛋白总量相比，感兴趣的受体的比例非常低的阻碍。

  DOI：

  10.1135/cccc2011036

文献信息

• Synthesis and characterization of DMAP-modified NPY Y1 receptor antagonists as acyl-transfer catalysts
  作者：Stefan Weiss、Günther Bernhardt、Armin Buschauer、Burkhard König

  DOI：10.1135/cccc2011036

  日期：——

  Starting from the working hypothesis that specific chemical labelling may be an attractive approach to detect and study G protein-coupled receptors (GPCRs) we synthesized catalytically active antagonists of the neuropeptide Y₁ receptor (Y₁R). An argininamide-type Y₁R antagonist scaffold was combined with a DMAP moiety via spacers of different length and chemical nature. These hybrid compounds have Y₁R affinities in the two-digit nanomolar range and are capable of catalysing acyl-transfer reaction to surrogates of bionucleophiles, as demonstrated in the absence of cells by using esters of fluorescent dyes as substrates in buffer. By contrast, selective staining of Y₁Rs on living MCF-7 cells was not achieved due to significant non-catalysed (Y₁R ligand independent) reaction with biomolecules and the limited density of Y₁R on the cell surface. Although this may also depend on insufficient selectivity of the staining reagents, the results of this study suggest that the general applicability of catalytic staining to GPCRs has to be reconsidered, as this approach is hampered by a very low portion of receptor of interest compared to the total amount of membrane proteins.

  从工作假设出发，我们认为特定的化学标记可能是一种吸引人的方法来检测和研究G蛋白偶联受体（GPCRs），我们合成了神经肽Y1受体（Y1R）的具有催化活性的拮抗剂。将一种精氨酸酰胺型的Y1R拮抗剂支架与DMAP基团通过不同长度和化学性质的间隔物结合。这些杂化化合物对Y1R的亲和力在两位数的纳摩尔范围内，并且能够催化酰基转移反应到生物亲核素的替代物上，这一点在没有细胞的情况下使用荧光染料的酯作为缓冲液中的底物时得到了证明。相比之下，由于与生物分子发生的显著非催化（与Y1R配体无关）反应，以及细胞表面Y1R密度的限制，未能实现对活MCF-7细胞上Y1R的选择性染色。尽管这也可能取决于染色试剂的选择性不足，但本研究的结果表明，催化染色的普遍适用性需要重新考虑，因为这种方法受到与膜蛋白总量相比，感兴趣的受体的比例非常低的阻碍。