Conformational ensembles of flexible β-turn mimetics in DMSO-d6
作者:Jari J. Koivisto、Esa T. T. Kumpulainen、Ari M. P. Koskinen
DOI:10.1039/b921794k
日期:——
and (4S)-methylproline, respectively, at the Xaa position. To determine the influence of the 4-methyl substituted prolines on the β-turn populations, the NAMFIS (NMR analysis of molecular flexibility in solution) deconvolution analysis for these three peptides were performed in DMSO-d6 solution. The NBO (natural bond orbital) method was employed to gain further insight into the results obtained from the
β-转角在肽和蛋白质化学,生物物理学和生物信息学中起着重要作用。这项研究的目的是研究具有在溶液中形成β-转角结构的高倾向的短线性肽。特别是,我们研究了具有一般序列的β-turn形成肽的构象集成体CBz-L-Ala-L-Xaa-Gly-L-Ala-O t Bu。这些四肽亚太高尔夫协会, A(4 R)MePGA, 和 A(4 S)MePGA, 包含 脯氨酸, (4 R)-甲基脯氨酸, 和 (4 S)-甲基脯氨酸分别位于Xaa位置。为了确定4-甲基取代的脯氨酸对β-turn种群的影响,在2007年对这三种肽进行了NAMFIS(溶液中分子柔性的NMR分析)反褶积分析。DMSO- d 6解决方案。NBO(自然键轨道)方法用于进一步了解从NAMFIS分析获得的结果。NBO分析中的重点是表征可能影响有助于β-转弯稳定性的主链-骨干相互作用的远程分子内相互作用。NAMFIS结果表明,在C的甲基取代的对映体