蛋白质
酪氨酸磷酸酶在涉及人类疾病的许多信号级联反应中发挥重要作用。鉴定这些靶标的类药物
抑制剂是一项重大挑战,而发现合适的
磷酸酪氨酸 (pY) 模拟物仍然是主要困难之一。在这里,我们描述了网络共享技术的扩展,“分离网络共享”,它非常适合发现这种新的
化学实体。该方法首先涉及使用包含掩蔽
硫醇和已知 pY 模拟物的扩展剂不可逆地修饰蛋白质。然后将扩展剂裂解以释放 pY 模拟物,暴露
硫醇。得到的蛋白质针对含有二
硫键的小分子片段文库进行筛选;任何对 pY 结合位点具有内在亲和力的分子将优先与扩展剂形成二
硫化物,从而可以通过质谱法对其进行鉴定。从已知底物开始的能力最大限度地减少了蛋白质结构的扰动,并增加了使用束缚探测活性位点的机会。我们将这种方法应用于抗糖尿病蛋白
PTP1B,以发现一种 pY 模拟物,它属于一个新的分子类别并以一种新的方式结合。