N-benzyloxycarbonyl-4R-[2,3,5-tri-O-acetyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester | 1451369-78-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-benzyloxycarbonyl-4R-[2,3,5-tri-O-acetyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester
• 英文别名: dibenzyl (2S,4R)-4-[(2S,3R,4S,5S)-3,4-diacetyloxy-5-(acetyloxymethyl)oxolan-2-yl]oxypyrrolidine-1,2-dicarboxylate
• CAS: 1451369-78-0
• 化学式: C₃₁H₃₅NO₁₂
• 分子量: 613.618
• InChiKey: NBWMLFFZFRLLFO-XHCAZJNNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-benzyloxycarbonyl-4R-[2,3,5-tri-O-acetyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester 在 氢气 、 palladium(II) hydroxide 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 N-9-fluorenylmethyloxycarbonyl-4R-[2,3,5-tri-O-acetyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline
  参考文献：
  名称：

  Stereoselective synthesis of Arabidopsis CLAVATA3 (CLV3) glycopeptide, unique protein post-translational modifications of secreted peptide hormone in plant

  摘要：

  独特的羟脯氨酸(Hyp)连接的O-糖基化修饰是羟脯氨酸富集糖蛋白(HRGPs)中的常见过程。这种修饰通过在脯氨酸残基的4位进行翻译后羟基化发生，其中一些随后在生成的Hyp上发生O-糖基化，这在一些分泌的肽类激素中也存在，例如拟南芥植物中的CLAVATA3 (CLV3)。成熟的活性CLV3是一个十三肽，与β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf在肽序列中心的Hyp残基连接，例如Arg-Thr-Val-Hyp-Ser-Gly-Hyp(L-Arafn)-Asp-Pro-Leu-His-His-His (n = 3)。我们在这里报告了合成所有糖型(Araf0–3CLV3)的拟南芥植物分泌和修饰的CLV3糖肽。通过NAP醚介导的IAD实现了对Hyp衍生物的高度立体选择性β-阿拉伯呋喃糖基化，这是合成CLV3糖肽的关键步骤，并有效地应用于合成寡阿拉伯糖基化羟脯氨酸[Hyp(L-Araf1–3)]衍生物。使用COMU作为偶联试剂，通过Fmoc固相肽合成引入了[Hyp(L-Araf0–3)]衍生物，并进一步延伸至CLV3糖肽。

  DOI：

  10.1039/c3ob41212a
• 作为产物：
  描述：

  4-methylphenyl 2-O-(2-naphthyl)methyl-3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-thio-α-L-arabinofuranoside 在 吡啶 、 2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶 、 pyridine*THF 、 四丁基氟化铵 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 67.0h， 生成 N-benzyloxycarbonyl-4R-[2,3,5-tri-O-acetyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  Stereoselective synthesis of Arabidopsis CLAVATA3 (CLV3) glycopeptide, unique protein post-translational modifications of secreted peptide hormone in plant

  摘要：

  独特的羟脯氨酸(Hyp)连接的O-糖基化修饰是羟脯氨酸富集糖蛋白(HRGPs)中的常见过程。这种修饰通过在脯氨酸残基的4位进行翻译后羟基化发生，其中一些随后在生成的Hyp上发生O-糖基化，这在一些分泌的肽类激素中也存在，例如拟南芥植物中的CLAVATA3 (CLV3)。成熟的活性CLV3是一个十三肽，与β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf在肽序列中心的Hyp残基连接，例如Arg-Thr-Val-Hyp-Ser-Gly-Hyp(L-Arafn)-Asp-Pro-Leu-His-His-His (n = 3)。我们在这里报告了合成所有糖型(Araf0–3CLV3)的拟南芥植物分泌和修饰的CLV3糖肽。通过NAP醚介导的IAD实现了对Hyp衍生物的高度立体选择性β-阿拉伯呋喃糖基化，这是合成CLV3糖肽的关键步骤，并有效地应用于合成寡阿拉伯糖基化羟脯氨酸[Hyp(L-Araf1–3)]衍生物。使用COMU作为偶联试剂，通过Fmoc固相肽合成引入了[Hyp(L-Araf0–3)]衍生物，并进一步延伸至CLV3糖肽。

  DOI：

  10.1039/c3ob41212a

文献信息

• Synthesis of the Highly Glycosylated Hydrophilic Motif of Extensins
  作者：Akihiro Ishiwata、Sophon Kaeothip、Yoichi Takeda、Yukishige Ito

  DOI：10.1002/anie.201404904

  日期：2014.9.8

  stereoselective synthesis of one of the highly glycosylated motifs, Ser(Galp1)‐Hyp(Araf4)‐Hyp(Araf4)‐Hyp(Araf3)‐Hyp(Araf1). The synthesis has been completed by the application of 2‐(naphthyl)methylether‐mediated intramolecular aglycon delivery to the stereoselective construction of the Ser(Galp1) and Hyp(Arafn) fragments as the key step, as well as Fmoc solid‐phase peptide synthesis for the backbone

  Extensin是植物细胞外基质蛋白的结构基序，具有独特的高度糖基化，亲水性和重复性Ser 1 Hyp 4五肽单元，已被提议包括脯氨酸残基的翻译后羟基化和随后的寡L-阿拉伯糖基化羟基脯氨酸的合成以及丝氨酸残基的半乳糖基化。本文报道了一种高度糖基化的基序之一Ser（Galp 1）-Hyp（Araf 4）-Hyp（Araf 4）-Hyp（Araf 3）-Hyp（Araf 1）的立体选择性合成）。通过将2-（萘基）甲醚介导的分子内糖苷配基传递应用于Ser（Galp 1）和Hyp（Araf n）片段的立体选择性构建以及Fmoc固相，完成了合成肽合成为主链五肽。