Ligand-based design and synthesis of novel sodium channel blockers from a combined phenytoin–lidocaine pharmacophore
作者:Yuesheng Wang、Paulianda J. Jones、Timothy W. Batts、Victoria Landry、Manoj K. Patel、Milton L. Brown
DOI:10.1016/j.bmc.2008.10.031
日期:2009.10
maps described a binding site predominately hydrophobic in nature. This model was then used to design and predict a series of novel sodium channel blockers that utilized overlapping structural features of phenytoin, hydroxy amides, and the local anesthetic lidocaine. Synthesis and evaluation of these compounds for their ability to inhibit [(3)H]-batrachotoxin revealed that these compounds have potent sodium
电压门控钠通道仍然是开发新型阻滞剂的丰富领域。在这项研究中,我们使用比较分子场分析 (CoMFA),一种基于配体的设计策略,生成基于局部麻醉剂、乙内酰脲和 α-羟基苯酰胺的 3D 模型,以阐明其在神经元钠通道中的结合位点的 SAR。通过偏最小二乘法 (PLS) 分析体外钠通道结合活性(表示为 pIC(50))和 CoMFA 描述符列的相关性生成最终非交叉验证模型,训练集 q(2)=0.926。CoMFA 立体和静电图描述了本质上主要是疏水性的结合位点。然后使用该模型来设计和预测一系列新型钠通道阻滞剂,这些阻滞剂利用苯妥英、羟基酰胺、和局部麻醉剂利多卡因。合成和评价这些化合物抑制 [(3) H]-batrachotoxin 的能力表明这些化合物具有有效的钠通道阻滞作用。此外,CoMFA 模型能够准确预测这些化合物与神经元钠通道的结合。化合物 37 的合成和随后的钠通道评估(预测 IC(50)=7