N-benzyl-N-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl 4,6-benzylidene-2-azido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside | 1139694-44-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: N-benzyl-N-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl 4,6-benzylidene-2-azido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl O-2-azido-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-α-D-glycopyranoside；benzyl (5-(((2R,4aR,6S,7R,8R,8aS)-7-azido-8-hydroxy-2-phenylhexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-6-yl)oxy)pentyl)(benzyl)carbamate；benzyl N-[5-[[(2R,4aR,6S,7R,8R,8aS)-7-azido-8-hydroxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-6-yl]oxy]pentyl]-N-benzylcarbamate
• CAS: 1139694-44-2
• 化学式: C₃₃H₃₈N₄O₇
• 分子量: 602.687
• InChiKey: NCDXUGKVTNRQJT-ZTSFOAJHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-benzyl-N-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl 4,6-benzylidene-2-azido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside 在 三乙基硅烷 、 三氟甲磺酸 、 sodium hydride 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.83h， 生成 N-benzyl-N-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl 2-azido-6-O-benzyl-2-deoxy-3-O-(2-napthyl-methyl)-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Anthrax carbohydrates, synthesis and uses thereof

  摘要：

  本发明提供了炭疽芽孢杆菌寡糖的分离、表征和合成。还提供了结合到这种糖基团的抗体，以及针对这种糖基团和抗体的各种使用方法。

  公开号：

  US09310366B2
• 作为产物：
  描述：

  benzyl-(5-hydroxy-pentyl)-carbamic acid benzyl ester 在 sodium 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 13.5h， 生成 N-benzyl-N-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl 4,6-benzylidene-2-azido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Anthrax carbohydrates, synthesis and uses thereof

  摘要：

  本发明提供了炭疽芽孢杆菌寡糖的分离、表征和合成。还提供了结合到这种糖基团的抗体，以及针对这种糖基团和抗体的各种使用方法。

  公开号：

  US09310366B2

文献信息

• Modular Synthesis of Heparan Sulfate Oligosaccharides for Structure−Activity Relationship Studies
  作者：Sailaja Arungundram、Kanar Al-Mafraji、Jinkeng Asong、Franklin E. Leach、I. Jonathan Amster、Andre Venot、Jeremy E. Turnbull、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1021/ja907358k

  日期：2009.12.2

  to the structural complexity of natural heparan sulfate (HS) and difficulties of preparing well-defined HS oligosaccharides. To address this deficiency, we developed a modular approach for the parallel combinatorial synthesis of HS oligosaccharides that utilizes a relatively small number of selectively protected disaccharide building blocks, which can easily be converted into glycosyl donors and acceptors

  尽管已经鉴定了数百种硫酸乙酰肝素结合蛋白并与无数生理和病理过程有关，但关于这些蛋白结合和介导生物活性的配体要求的信息知之甚少。这种困难是由于缺乏建立构效关系的技术，而这又是由于天然硫酸乙酰肝素 (HS) 的结构复杂性和制备明确定义的 HS 寡糖的困难。为了解决这一缺陷，我们开发了一种模块化方法，用于 HS 寡糖的平行组合合成，该方法利用相对少量的选择性保护的二糖结构单元，这些结构单元可以很容易地转化为糖基供体和受体。模块化构建块的实用性已通过 12 种寡糖文库的制备得到证明，该文库已被用于探测 HS 抑制蛋白酶 BACE-1 的结构特征。具有结构变化的活动的复杂变化支持重要功能信息嵌入在 HS 序列中的观点。此外，最活跃的衍生物为制备更有效的化合物提供了一种有吸引力的先导化合物，这些化合物可用作阿尔茨海默病的治疗剂。具有结构变化的活动的复杂变化支持重要功能信息嵌入在 HS 序列中的观点。此