2'-deoxy-2'-C-methylcytidine | 115494-59-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-deoxy-2'-C-methylcytidine
• 英文别名: 2'-deoxy-2'-C-α-methylcytidine；(2'R)-2'-deoxy-2'-C-methylcytidine；2'-deoxy-2'-α-methylcytidine；2'-Methylcytidin；2'-methyl-2'-deoxy-cytidine；2'-Methyl-2'-deoxycytidine；4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-methyloxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 115494-59-2
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₄
• 分子量: 241.247
• InChiKey: DYPDKNUWDNOWPU-MTSNSDSCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2′,3′,5′-tri-O-benzoyl-2′-C-methyluridine 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 偶氮二异丁腈 、 四丁基氟化铵 、 氨 、 三正丁基氢锡 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 110.0h， 生成 2'-deoxy-2'-C-methylcytidine
  参考文献：
  名称：

  2′-脱氧-2′-C-β-甲基胞苷的亚磷酰胺衍生物的合成。

  摘要：

  2'-脱氧-2'-C-β-甲基核苷引起了人们对作为潜在治疗剂和类似物分析核酸结构和功能的兴趣。合成2'-脱氧-2'-C-甲基尿苷（11），2'-脱氧-2'-C-甲基胞苷（12）和2'-脱氧-2'-亚磷酰胺衍生物的有效途径描述了来自1,2,3,5-四-O-苯甲酰基-2-C-β-甲基核呋喃糖（1）的C-β-甲基胞苷（10，总产率46％）。

  DOI：

  10.1021/jo034263y

文献信息

• Process for the preparation of cytidine derivatives
  申请人：——

  公开号：US20030032797A1

  公开（公告）日：2003-02-13

  An efficient method for producing cytidine derivatives that took away the previous drawbacks by efficiently synthesizing cytidine derivatives by utilizing a tertiary amine can be provided.

  一种高效生产胞嘧啶衍生物的方法，通过利用三级胺有效地合成胞嘧啶衍生物，从而消除了先前的缺点。
• UTRS INCREASING THE TRANSLATION EFFICIENCY OF RNA MOLECULES
  申请人：ethris GmbH

  公开号：EP3112469A1

  公开（公告）日：2017-01-04

  Described is an RNA molecule comprising (a) a coding region coding for a polypeptide; and (b) upstream of said coding region one or more UTR(s) comprising the sequence as shown in SEQ ID NO:1 or a sequence which shows 1 to 4 substitutions in comparison to SEQ ID NO:1 and which results in an RNA molecule having the same or a higher translation efficiency as an RNA molecule comprising an UTR comprising SEQ ID NO:1; and/or (c) downstream of said coding region one or more UTR(s) comprising the sequence as shown in SEQ ID NO:2 or a sequence which shows 1 to 7 substitutions in comparison to SEQ ID NO:2 and which results in an RNA molecule having the same or a higher translation efficiency as an RNA molecule comprising an UTR comprising SEQ ID NO:2; wherein said polypeptide encoded by said coding region is not a cytochrome b-245 alpha polypeptide (CYBA). Moreover, described is a nucleic acid molecule encoding the RNA molecule according to the present invention. Further, described is a vector comprising the nucleic acid molecule according to the present invention and to a host cell comprising the vector according to the present invention. Further, described is a pharmaceutical composition comprising the RNA molecule according to the present invention and optionally a pharmaceutically acceptable carrier. Moreover, described is a kit comprising the RNA molecule according to the present invention. Finally, described is the use of one or more UTR(s) as defined in (b) and/or one or more UTR(s) as defined in (c) for increasing the efficiency of translating a coding region of an RNA molecule into a polypeptide or a protein encoded by said coding region.

  所述 RNA 分子包括(a)编码多肽的编码区；和(b)所述编码区上游的一个或多个 UTR，该 UTR 包括 SEQ ID NO:1 所示序列或与 SEQ ID NO:1 相比显示 1 至 4 个取代的序列，其产生的 RNA 分子与包括 SEQ ID NO.1 所示 UTR 的 RNA 分子具有相同或更高的翻译效率；和/或(c)所述编码区下游的一个或多个 UTR，该 UTR 包括 SEQ ID NO:2 所示序列或与 SEQ ID NO:1 相比显示 1 至 7 个取代的序列：1；和/或(c) 在所述编码区下游的一个或多个 UTR，其包含 SEQ ID NO:2 中所示的序列或与 SEQ ID NO:2 相比显示 1 至 7 个取代的序列，其导致的 RNA 分子与包含 SEQ ID NO:2 的 UTR 的 RNA 分子具有相同或更高的翻译效率；其中所述编码区编码的所述多肽不是细胞色素 b-245 alpha 多肽（CYBA）。此外，所述的是编码根据本发明的 RNA 分子的核酸分子。此外，还描述了一种包含根据本发明的核酸分子的载体和包含根据本发明的载体的宿主细胞。此外，还描述了一种药物组合物，该组合物包含根据本发明的 RNA 分子和可选的药学上可接受的载体。此外，还描述了一种包含根据本发明的 RNA 分子的试剂盒。最后，描述了(b)中定义的一个或多个 UTR 和/或(c)中定义的一个或多个 UTR 的用途，以提高将 RNA 分子的编码区翻译成由所述编码区编码的多肽或蛋白质的效率。
• RNA MIT EINER KOMBINATION AUS UNMODIFIZIERTEN UND MODIFIZIERTEN NUCLEOTIDEN ZUR PROTEINEXPRESSION
  申请人：ethris GmbH

  公开号：EP3165234A1

  公开（公告）日：2017-05-10

  Beschrieben wird ein Polyribonucleotid mit einer Sequenz, die ein Protein oder Proteinfragment codiert, wobei das Polyribonucleotid eine Kombination aus unmodifizierten und modifizierten Nucleotide enthält, wobei 5 bis 50% der Uridinnucleotide und 5 bis 50% der Cytidinnucleotide modifizierte Uridinnucleotide bzw. modifizierte Cytidinnucleotide sind.

  所述多核苷酸具有编码蛋白质或蛋白质片段的序列，其中多核苷酸包括未修饰核苷酸和修饰核苷酸的组合，其中5%至50%的尿苷核苷酸和5%至50%的胞苷核苷酸分别是修饰尿苷核苷酸和修饰胞苷核苷酸。
• RNA based biomaterial for tissue engineering applications
  申请人：University of Iowa Research Foundation

  公开号：US10335498B2

  公开（公告）日：2019-07-02

  The present disclosure provides compositions and methods useful for tissue engineering including a composition having chemically modified RNA (cmRNA) encapsulated in or complexed with a non-viral delivery vehicle and a biocompatible, bioresorbable scaffold and methods of using the composition to regenerate, for example, bone tissue.

  本公开提供了用于组织工程的组合物和方法，包括一种具有封装在非病毒递送载体中或与非病毒递送载体复合的化学修饰RNA（cmRNA）的组合物和一种生物相容性、生物可吸收支架，以及使用该组合物再生骨组织等的方法。
• Cas9 mRNAs
  申请人：ethris GmbH

  公开号：US10927383B2

  公开（公告）日：2021-02-23

  In certain aspects, the disclosure relates to compositions comprising modified Cas9 polyribonucleotides and methods of use, as well as Cas9 polynucleotides and polyribonucleotides.

  在某些方面，本公开涉及包含修饰的 Cas9 多核苷酸的组合物和使用方法，以及 Cas9 多核苷酸和多核苷酸。