1-[2-O,2-C-ethano-3,5-di-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil | 664333-58-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-[2-O,2-C-ethano-3,5-di-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil
• 英文别名: 1-[(6aR,8R,9S,9aR)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)spiro[6,6a,8,9a-tetrahydrofuro[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocine-9,2'-oxetane]-8-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 664333-58-8
• 化学式: C₂₃H₄₀N₂O₇Si₂
• 分子量: 512.751
• InChiKey: UDZDZWOBLFRPMJ-LPOZWGFCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.55
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  95.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[2-O,2-C-ethano-3,5-di-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil 在 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 以82%的产率得到1-(2-O,2-C-ethano-β-D-arabinofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  2'-螺核糖核糖和阿拉伯核糖核苷：合成，分子建模和并入寡聚脱氧核苷酸。

  摘要：

  我们已经合成了通过2'-C-烯丙基核苷作为关键中间体的四个构象受限的双环2'-螺核苷。核糖构型的2'-螺旋核苷9b和14b是通过2-酮呋喃糖1的聚合策略获得的，而阿拉伯糖构型的2'-螺旋核苷21和27是通过以2'-酮尿苷衍生物为起始的线性策略获得的。材料。9b / 14b的呋喃糖环采用N-型构象，而21/27的呋喃糖环以N ＝ S平衡存在。这些化合物没有抗HIV-1活性或细胞毒性。使用亚磷酰胺方法在自动化DNA合成仪上将四个2'-螺核苷（作为单体X4和X5）掺入寡脱氧核苷酸中。不论单体结构如何，杂交研究表明，与相应的DNA：DNA和DNA：RNA双链体相比，这些2'-螺核苷酸单体（X4和X5）诱导的双链体热稳定性降低。分子建模表明，空间限制是修饰寡聚脱氧核苷酸对互补单链DNA和单链RNA互补物结合亲和力降低的可能原因。

  DOI：

  10.1039/b306354b
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-四异丙基-1,3-二硅氧烷)尿苷 在 吡啶 、 chromium(VI) oxide 、 乙酸酐 、 sodium hydride 、 臭氧 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 1-[2-O,2-C-ethano-3,5-di-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-D-arabinofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOUNDS
  [FR] COMPOSÉS

  摘要：

  本文披露了公式I的2'-螺环核苷及其衍生物，用于治疗感染丙型肝炎病毒或登革病毒的受试者。公式(I)中，z是从以下结构(II)所代表的基团a-o中选择的四元或五元环。其中*表示连接到2'-碳的位置。

  公开号：

  WO2012075140A1

文献信息

• 2′-Spiro ribo- and arabinonucleosides: synthesis, molecular modelling and incorporation into oligodeoxynucleotides
  作者：B. Ravindra Babu、Lise Keinicke、Michael Petersen、Claus Nielsen、Jesper Wengel

  DOI：10.1039/b306354b

  日期：——

  We have synthesized four conformationally restricted bicyclic 2'-spiro nucleosides via 2'-C-allyl nucleosides as key intermediates. The ribo-configured 2'-spironucleosides 9b and 14b were obtained by a convergent strategy starting from 2-ketofuranose 1 whereas the arabino-configured 2'-spironucleosides 21 and 27 were obtained by a linear strategy with a 2'-ketouridine derivative as starting material

  我们已经合成了通过2'-C-烯丙基核苷作为关键中间体的四个构象受限的双环2'-螺核苷。核糖构型的2'-螺旋核苷9b和14b是通过2-酮呋喃糖1的聚合策略获得的，而阿拉伯糖构型的2'-螺旋核苷21和27是通过以2'-酮尿苷衍生物为起始的线性策略获得的。材料。9b / 14b的呋喃糖环采用N-型构象，而21/27的呋喃糖环以N ＝ S平衡存在。这些化合物没有抗HIV-1活性或细胞毒性。使用亚磷酰胺方法在自动化DNA合成仪上将四个2'-螺核苷（作为单体X4和X5）掺入寡脱氧核苷酸中。不论单体结构如何，杂交研究表明，与相应的DNA：DNA和DNA：RNA双链体相比，这些2'-螺核苷酸单体（X4和X5）诱导的双链体热稳定性降低。分子建模表明，空间限制是修饰寡聚脱氧核苷酸对互补单链DNA和单链RNA互补物结合亲和力降低的可能原因。
• [EN] COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS
  申请人：PHARMASSET INC

  公开号：WO2012075140A1

  公开（公告）日：2012-06-07

  Disclosed herein are 2'-spiro-nucleosides of formula I and derivatives thereof useful for treating a subject infected by hepatitis C virus or dengue virus. Formula (I), where z is a four-or five-membered ring selected from among radicals a-o represented by de following structures (II) where * represents the point of attachment to the 2'-carbon.

  本文披露了公式I的2'-螺环核苷及其衍生物，用于治疗感染丙型肝炎病毒或登革病毒的受试者。公式(I)中，z是从以下结构(II)所代表的基团a-o中选择的四元或五元环。其中*表示连接到2'-碳的位置。
• Use of 2′-Spirocyclic Ethers in HCV Nucleoside Design
  作者：Jinfa Du、Byoung-Kwon Chun、Ralph T. Mosley、Shalini Bansal、Haiying Bao、Christine Espiritu、Angela M. Lam、Eisuke Murakami、Congrong Niu、Holly M. Micolochick Steuer、Phillip A. Furman、Michael J. Sofia

  DOI：10.1021/jm401224y

  日期：2014.3.13

  Conformationally restricted 2'-spironucleosides and their prodrugs were synthesized as potential anti-HCV agents. Although the replicon activity of the new agents containing pyrimidine bases was modest, the triphosphate of a 2'-oxetane cytidine analogue demonstrated potent intrinsic biochemical activity against the NS5B polymerase, with IC50 = 8.48 mu M. Activity against NS5B bearing the S282T mutation was reduced. Phosphoramidate prodrugs of a 2'-oxetane 2-amino-6-O-methylpurine nucleoside demonstrated potent anti-HCV activity in vitro, and the corresponding triphosphate retained similar potent activity against both wild-type and S282T HCV NS5B polymerase.