tert-butyl N-[(1S)-1-benzyl-2-[[(3S,6S)-6-[(1S)-1-methylpropyl]-4,7-dioxo-12-oxa-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),13(17),14-trien-3-yl]amino]ethyl]carbamate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl N-[(1S)-1-benzyl-2-[[(3S,6S)-6-[(1S)-1-methylpropyl]-4,7-dioxo-12-oxa-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),13(17),14-trien-3-yl]amino]ethyl]carbamate
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S)-1-[[(8S,11S)-8-[(2S)-butan-2-yl]-7,10-dioxo-2-oxa-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),13,16-trien-11-yl]amino]-3-phenylpropan-2-yl]carbamate
• 化学式: C₃₂H₄₆N₄O₅
• 分子量: 566.741
• InChiKey: IPMMRFCBYFNVNO-DVHLBBAASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  BOC-L-异亮氨酸 在 sodium cyanoborohydride 、 magnesium sulfate 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 溶剂黄146 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.25h， 生成 tert-butyl N-[(1S)-1-benzyl-2-[[(3S,6S)-6-[(1S)-1-methylpropyl]-4,7-dioxo-12-oxa-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),13(17),14-trien-3-yl]amino]ethyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  使用新型酶结合模式抑制 HIV-1 蛋白酶的 Phe-Ile-Val 的基于底物的环状肽模拟物

  摘要：

  HIV-1 蛋白酶抑制剂的结果展示了开发肽模拟物的新策略，包括用构象受限的水解稳定大环结构模拟物替换肽底物的柔性片段。设计了一个模仿三肽 Phe-IIe-Val 的 15 元大环并将其整合到 Ac-Leu-Val-Phe-CHOHCH2-{Phe-Ile-Val}-NH2 的 C 端，一种 HIV-I 蛋白酶抑制剂源自底物序列。大环相对于无环肽的优点包括将其组分限制在其生物活性构象中并保护酰胺键免于酶促降解，该循环对酸、胃蛋白酶和血浆稳定。分子建模和 X 射线结构研究表明，环状抑制剂具有独特的酶结合模式，空间上不受限制的羟乙胺等排体通过其羟基和质子化氮与阴离子 Asp25 催化残基结合。新的大环化合物很好地叠加在线性肽抑制剂上，它被设计为结构模拟物。结构模拟导致功能模拟，如环状和非环状分子对蛋白酶的可比抑制所示。对无环 N 末端 (Leu-Val-Phe) 的进一步修饰产生了稳定的、水溶性的、有效的

  DOI：

  10.1021/ja953790z

文献信息

• Substrate-Based Cyclic Peptidomimetics of Phe-Ile-Val That Inhibit HIV-1 Protease Using a Novel Enzyme-Binding Mode
  作者：Darren R. March、Giovanni Abbenante、Douglas A. Bergman、Ross I. Brinkworth、Wasantha Wickramasinghe、Jake Begun、Jennifer L. Martin、David P. Fairlie

  DOI：10.1021/ja953790z

  日期：1996.1.1

  catalytic residues. The novel macrocycle superimposes well on the linear peptidic inhibitor for which it was designed as a structural mimic. Structural mimicry led to functional mimicry as shown by comparable inhibition of the protease by cyclic and acyclic molecules. Further modification of the acyclic N-terminus (Leu-Val-Phe) gave stable, water-soluble, potent inhibitors of HIV-1 protease. This approach

  HIV-1 蛋白酶抑制剂的结果展示了开发肽模拟物的新策略，包括用构象受限的水解稳定大环结构模拟物替换肽底物的柔性片段。设计了一个模仿三肽 Phe-IIe-Val 的 15 元大环并将其整合到 Ac-Leu-Val-Phe-CHOHCH2-Phe-Ile-Val}-NH2 的 C 端，一种 HIV-I 蛋白酶抑制剂源自底物序列。大环相对于无环肽的优点包括将其组分限制在其生物活性构象中并保护酰胺键免于酶促降解，该循环对酸、胃蛋白酶和血浆稳定。分子建模和 X 射线结构研究表明，环状抑制剂具有独特的酶结合模式，空间上不受限制的羟乙胺等排体通过其羟基和质子化氮与阴离子 Asp25 催化残基结合。新的大环化合物很好地叠加在线性肽抑制剂上，它被设计为结构模拟物。结构模拟导致功能模拟，如环状和非环状分子对蛋白酶的可比抑制所示。对无环 N 末端 (Leu-Val-Phe) 的进一步修饰产生了稳定的、水溶性的、有效的