N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester | 790244-47-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester
• 英文别名: (5S)-6-[(4-methoxyphenyl)methoxy]-5-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-6-oxohexanoic acid
• CAS: 790244-47-2
• 化学式: C₁₉H₂₇NO₇
• 分子量: 381.426
• InChiKey: OUUTWLNAIBCOAK-HNNXBMFYSA-N

物化性质

• 沸点：
  559.7±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.183±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester 在 水 、 sodium sulfate 、 2-乙氧基-1-乙氧碳酰基-1,2-二氢喹啉 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 22.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  晶体学研究异青霉素N合酶与不饱和底物类似物的反应。

  摘要：

  异青霉素N合酶（IPNS）催化将线性三肽δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-半胱氨酰-D-缬氨酸（ACV）转化为异青霉素N（IPN），这是生物合成β-内酰胺抗生素的关键步骤。先前已将不饱和底物类似物δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-半胱氨酰-D-乙烯基甘氨酸（ACvG）与IPNS一起温育，并分离出单一产物，形成了2-α-羟甲基异青霉素N（HMPen），通过单加氧酶反应模式。ACvG现在已经用IPNS结晶，厌氧IPNS：Fe（II）：ACvG络合物的结构确定为1.15 A分辨率。此外，通过将厌氧生长的晶体暴露于高压氧气中，以1.60A的分辨率获得了对应于双环产物HMPen的结构。根据这些以及其他IPNS结构，以及相关双加氧酶的最新发展，对由ACvG形成HMPen的[2 + 2]环加成机理进行了修订，并提出了逐步的自由基机理。修订后的机制与观察到的转化立体定向保持一致，但更适合于活性位铁原子周围配位几何的明显约束。

  DOI：

  10.1039/b212270g
• 作为产物：
  描述：

  L-2-氨基己二酸 在 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester
  参考文献：
  名称：

  异青霉素N合酶与同源底物类似物δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-高半胱氨酸基-D-Xaa的相互作用（通过蛋白质晶体学表征）

  摘要：

  宽松：IPNS催化青霉素生物合成的关键步骤。包含L-高半胱氨酸代替天然底物L-半胱氨酸残基的底物类似物不会转化为双环产物。具有两个这样的类似物的IPNS配合物的晶体结构表明，当这些类似物与IPNS结合时，额外的CH 2单元可提供相当的构象自由度。

  DOI：

  10.1002/cbic.201200728

文献信息

• Isopenicillin N Synthase Mediates Thiolate Oxidation to Sulfenate in a Depsipeptide Substrate Analogue: Implications for Oxygen Binding and a Link to Nitrile Hydratase?
  作者：Wei Ge、Ian J. Clifton、Jeanette E. Stok、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1021/ja8005397

  日期：2008.8.1

  Isopenicillin N synthase (IPNS) is a nonheme iron oxidase that catalyzes the central step in the biosynthesis of beta-lactam antibiotics: oxidative cyclization of the linear tripeptide delta-L-alpha-aminoadipoyl-L-cysteinyl-D-valine (ACV) to isopenicillin N (IPN). The ACV analogue delta-L-alpha-aminoadipoyl-L-cysteine (1-(S)-carboxy-2-thiomethyl)ethyl ester (ACOmC) has been synthesized as a mechanistic

  异青霉素 N 合酶 (IPNS) 是一种非血红素铁氧化酶，可催化 β-内酰胺抗生素生物合成的核心步骤：线性三肽 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酰-D-缬氨酸 (ACV) 的氧化环化异青霉素 N (IPN)。ACV 类似物 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酸（1-（S）-羧基-2-硫甲基）乙酯（ACOmC）已合成为 IPNS 催化的机械探针，并用酶结晶。厌氧 IPNS/Fe(II)/ACOmC 复合物的晶体结构确定为 1.80 A 分辨率，揭示了高度拥挤的活性位点区域。通过将这些厌氧生长的晶体暴露在高压氧气中，观察到了意想不到的次磺酸盐产物，在 IPNS 活性位点内与铁络合。提出了形成次磺酸盐-铁络合物的机制，并且似乎 ACOmC 在其与 IPNS 反应的最早阶段遵循不同的反应途径。因此，似乎氧（共底物）在与之前 IPNS 研究中观察到的不同的位点结合，在此过程中从铁中置换了水配体。以前在
• The crystal structure of an<scp>lll</scp>-configured depsipeptide substrate analogue bound to isopenicillin N synthase
  作者：Wei Ge、Ian J. Clifton、Jeanette E. Stok、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1039/b910170e

  日期：——

  Isopenicillin N synthase (IPNS) is a non-heme iron(II) oxidase, which catalyses the biosynthesis of isopenicillin N (IPN) from the tripeptide δ-L-α-aminoadipoyl-L-cysteinyl-D-valine (LLD-ACV) in a remarkable oxidative bicyclisation reaction. The natural substrate for IPNS is the LLD-configured tripeptide. LLL-ACV is not turned over by the enzyme, but inhibits turnover of the LLD-tripeptide. The mechanism by which this inhibition takes place is not fully understood. Recent studies have employed a range of LLD-configured depsipeptide substrate analogues in crystallographic studies to probe events preceding β-lactam closure in the IPNS reaction cycle. Herein, we report the first crystal structure of IPNS in complex with an LLL-configured depsipeptide analogue, δ-L-α-aminoadipoyl-L-cysteine (1-(R)-carboxy-2-thiomethyl)ethyl ester (LLL-ACOmC). This report describes the crystal structure of the IPNS:Fe(II):LLL-ACOmC complex to 2.0 Å resolution, and discusses attempts to oxygenate this complex at high pressure in order to probe the mechanism by which LLL-configured substrates inhibit IPNS catalysis.

  异青霉素 N 合酶 (IPNS) 是一种非血红素铁 (II) 氧化酶，可催化三肽 δ-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酰-D-缬氨酸 (LLD-ACV) 生物合成异青霉素 N (IPN)发生显着的氧化双环化反应。 IPNS 的天然底物是 LLD 配置的三肽。 LLL-ACV 不会被酶转化，但会抑制 LLD-三肽的转化。这种抑制发生的机制尚不完全清楚。最近的研究在晶体学研究中采用了一系列 LLD 配置的缩酚肽底物类似物来探测 IPNS 反应循环中 β-内酰胺闭合之前的事件。在此，我们报道了IPNS与LLL配置的缩酚肽类似物δ-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酸(1-(R)-羧基-2-硫甲基)乙酯(LLL-ACOmC)复合物的第一个晶体结构）。该报告以 2.0 Å 分辨率描述了 IPNS:Fe(II):LLL-ACOmC 复合物的晶体结构，并讨论了在高压下对该复合物进行氧化的尝试，以探讨 LLL 配置底物抑制 IPNS 催化的机制。