[(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester | 916525-92-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 2-[[(2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutanoyl]amino]acetate
• CAS: 916525-92-3
• 化学式: C₂₃H₂₆N₂O₅
• 分子量: 410.47
• InChiKey: DGTIJZFYBYMGGQ-OAQYLSRUSA-N

物化性质

• 熔点：
  148-150 °C(Solv: acetonitrile (75-05-8))
• 沸点：
  614.9±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.205±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester 在 二乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 H-Val-Gly-OMe
  参考文献：
  名称：

  FK228的首个具有生物活性的合成类似物，即脱肽组蛋白组蛋白脱乙酰基酶抑制剂。

  摘要：

  FK228和螺旋藻抑素双环二肽天然产物是已知最有效的组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。尽管FK228处于高级临床试验中，但是天然产物的复杂性阻碍了机理研究和结构-活性关系的发现。通过全合成，我们制备了第一种二肽肽类似物。我们的结果证明FK228中的脱氢丁酸残基不是必需的，并且其他残基可以被取代而不会丧失HDAC抑制活性。大环支架的构象限制很重要，因为线性肽是无活性的。只要保护锌结合的硫醇以确保良好的细胞利用率，就可以除去由半胱氨酸侧链形成的分子内二硫键。像天然产品一样

  DOI：

  10.1021/jm0703800
• 作为产物：
  描述：

  甘胺酸甲酯 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.25h， 以86%的产率得到[(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  WO2006/129105

  摘要：

  公开号：

文献信息

• The First Biologically Active Synthetic Analogues of FK228, the Depsipeptide Histone Deacetylase Inhibitor
  作者：Alexander Yurek-George、Alexander Richard Liam Cecil、Alex Hon Kit Mo、Shijun Wen、Helen Rogers、Fay Habens、Satoko Maeda、Minoru Yoshida、Graham Packham、A. Ganesan

  DOI：10.1021/jm0703800

  日期：2007.11.1

  spiruchostatin bicyclic depsipeptide natural products are among the most potent histone deacetylase (HDAC) inhibitors known. Although FK228 is in advanced clinical trials, the complexity of the natural products has precluded mechanistic studies and the discovery of structure-activity relationships. By total synthesis, we have prepared the first depsipeptide analogues. Our results prove that the dehydrobutyrine

  FK228和螺旋藻抑素双环二肽天然产物是已知最有效的组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。尽管FK228处于高级临床试验中，但是天然产物的复杂性阻碍了机理研究和结构-活性关系的发现。通过全合成，我们制备了第一种二肽肽类似物。我们的结果证明FK228中的脱氢丁酸残基不是必需的，并且其他残基可以被取代而不会丧失HDAC抑制活性。大环支架的构象限制很重要，因为线性肽是无活性的。只要保护锌结合的硫醇以确保良好的细胞利用率，就可以除去由半胱氨酸侧链形成的分子内二硫键。像天然产品一样
• FK 228 derivates as HDAC inhibitors
  申请人：Ganesan Arasu

  公开号：US20090131390A1

  公开（公告）日：2009-05-21

  Compounds which are FK228 analogues of the general formula (I) or (I′), isosteres thereof and pharmaceutically acceptable salts thereof are found to inhibit HDAC wherein R 1 , R 2 , R 3 and R 4 are the same or different and represent an amino acid side chain moiety and each R 6 is the same or different and represents hydrogen or C 1 -C 4 alkyl.

  具有一般式(I)或(I′)的FK228类似物、其同分异构体和药学上可接受的盐被发现可以抑制HDAC，其中R1、R2、R3和R4相同或不同，代表氨基酸侧链基团，每个R6相同或不同，代表氢或C1-C4烷基。
• FK 228 DERIVATES AS HDAC INHIBITORS
  申请人：UNIVERSITY OF SOUTHAMPTON

  公开号：EP1888097A1

  公开（公告）日：2008-02-20
• US7977304B2
  申请人：——

  公开号：US7977304B2

  公开（公告）日：2011-07-12
• [EN] FK 228 DERIVATES AS HDAC INHIBITORS<br/>[FR] DERIVES DE FK 228 UTILISES EN TANT QU'INHIBITEURS D'HDAC
  申请人：UNIV SOUTHAMPTON

  公开号：WO2006129105A1

  公开（公告）日：2006-12-07

  [EN] Compounds which are FK228 analogues of the general formula (I) or (I^/), isosteres thereof and pharmaceutically acceptable salts thereof are found to inhibit HDAC wherein R₁, R₂, R₃ and R₄ are the same or different and represent an amino acid side chain moiety and each R₆ is the same or different and represents hydrogen or C₁-C₄ alkyl.
  [FR] L'invention concerne des composés qui sont des analogues de FK228 représentés par la formule générale (I) ou (I^/), des isostères de ces derniers et des sels pharmaceutiquement acceptables de ces derniers qui se sont avérés inhiber l'HDAC. Dans ladite formule, R₁, R₂, R₃ et R₄ sont identiques ou différents et représentent un fragment de chaîne latérale d'un acide aminé et chaque R₆ est identique ou différent et représente hydrogène ou alkyle C₁-C₄.