N^ε-thioacetyl-lysinyl-alaninyl-alanine methyl ester | 1278592-54-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N^ε-thioacetyl-lysinyl-alaninyl-alanine methyl ester
• 英文别名: Nepsilon-thioacetyl-lysinyl-alaninyl-alanine methyl ester；methyl (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-6-(ethanethioylamino)hexanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoate
• CAS: 1278592-54-3
• 化学式: C₁₅H₂₈N₄O₄S
• 分子量: 360.478
• InChiKey: LIKOBGGZLNXEHX-NHCYSSNCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N^ε-thioacetyl-lysinyl-alaninyl-alanine methyl ester 在 sirtuin 1 、 ammonium acetate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Mechanism-based affinity capture of sirtuins

  摘要：

  探测酶的催化活性以及在复杂生化环境中检测其丰度的能力，传统上依赖于动力学测定和诸如使用昂贵试剂（如抗体）的西方印迹等技术。能够同时检测活性并从混合物中分离蛋白催化剂更为困难，在大多数情况下几乎不可能。在本手稿中，我们描述了一种化学方法，利用新型化学工具实现这一目标，针对一种独特的酶家族——去乙酰化酶（sirtuins），从而使得能够快速检测其活性并分离这些蛋白催化剂。去乙酰化酶与许多生理功能的调节相关，包括能量代谢、DNA损伤应答和细胞应激抵抗。我们合成了一种氨氧基衍生的NAD+和一种泛去乙酰化酶抑制剂，该抑制剂会在去乙酰化酶的活性位点反应，形成一种化学稳定的复合物，随后可以与醛基取代的生物素交联。通过链霉亲和素珠子回收生物素化的去乙酰化酶复合物，再通过胶体电泳，我们实现了对活性去乙酰化酶的同时检测、分离和分子量测定。我们展示了这些工具能与多种人类去乙酰化酶亚型（包括SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6）交叉反应，并且也能与微生物来源的去乙酰化酶反应。最后，我们展示了能够在反应混合物中同时检测多个去乙酰化酶亚型，确立了在复杂生物样品中进行去乙酰化酶化学研究的概念验证工具。

  DOI：

  10.1039/c0ob00774a
• 作为产物：
  描述：

  FMOC-赖氨酸 在 哌啶 、 sodium hydride 、 sodium carbonate 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.51h， 生成 N^ε-thioacetyl-lysinyl-alaninyl-alanine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Mechanism-based affinity capture of sirtuins

  摘要：

  探测酶的催化活性以及在复杂生化环境中检测其丰度的能力，传统上依赖于动力学测定和诸如使用昂贵试剂（如抗体）的西方印迹等技术。能够同时检测活性并从混合物中分离蛋白催化剂更为困难，在大多数情况下几乎不可能。在本手稿中，我们描述了一种化学方法，利用新型化学工具实现这一目标，针对一种独特的酶家族——去乙酰化酶（sirtuins），从而使得能够快速检测其活性并分离这些蛋白催化剂。去乙酰化酶与许多生理功能的调节相关，包括能量代谢、DNA损伤应答和细胞应激抵抗。我们合成了一种氨氧基衍生的NAD+和一种泛去乙酰化酶抑制剂，该抑制剂会在去乙酰化酶的活性位点反应，形成一种化学稳定的复合物，随后可以与醛基取代的生物素交联。通过链霉亲和素珠子回收生物素化的去乙酰化酶复合物，再通过胶体电泳，我们实现了对活性去乙酰化酶的同时检测、分离和分子量测定。我们展示了这些工具能与多种人类去乙酰化酶亚型（包括SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT5、SIRT6）交叉反应，并且也能与微生物来源的去乙酰化酶反应。最后，我们展示了能够在反应混合物中同时检测多个去乙酰化酶亚型，确立了在复杂生物样品中进行去乙酰化酶化学研究的概念验证工具。

  DOI：

  10.1039/c0ob00774a

文献信息

• REAGENTS AND METHODS FOR SIRTUIN CAPTURE
  申请人：SAUVE Anthony A.

  公开号：US20130065248A1

  公开（公告）日：2013-03-14

  The invention provides a method of preparing a sirtuin complex. The invention also provides a method of detecting a sirtuin in a sample comprising use of the aforesaid sirtuin complex.

  这项发明提供了一种制备sirtuin复合物的方法。该发明还提供了一种检测样品中sirtuin的方法，包括使用上述sirtuin复合物。
• Reagents and methods for sirtuin capture
  申请人：Sauve Anthony A.

  公开号：US09290791B2

  公开（公告）日：2016-03-22

  The invention provides a method of preparing a sirtuin complex, a method for detecting a sirtuin in a sample, and a method of screening for compounds which inhibit the deacetylase activity of a sirtuin. The method includes (a) providing a sirtuin substrate having the formula: (b) providing NAD+ or an NAD+ analog having the formula: and (c) providing a sirtuin, wherein R1-R4, A1, A2, and n are as defined herein.

  这项发明提供了一种制备sirtuin复合物的方法，一种检测样品中sirtuin的方法，以及一种筛选抑制sirtuin去乙酰化酶活性的化合物的方法。该方法包括(a)提供具有以下公式的sirtuin底物： (b)提供具有以下公式的NAD+或NAD+类似物： 以及(c)提供sirtuin，其中R1-R4，A1，A2和n如本文所定义。
• Profiling sirtuin activity using Copper-free click chemistry
  作者：Alyson M. Curry、Ian Cohen、Song Zheng、Jessica Wohlfahrt、Dawanna S. White、Dickson Donu、Yana Cen

  DOI：10.1016/j.bioorg.2021.105413

  日期：2021.12

  activity-based chemical probes (ABPs) for the profiling of sirtuin activity in biological samples. Cyclooctyne-containing and azido-containing probes were synthesized to enable the subsequent copper-free “click” conjugation to either a fluorophore or biotin. The two groups of structurally related ABPs demonstrated different labeling efficiency and selectivity: the cyclooctyne-containing probes failed

  哺乳动物 sirtuins 是一组翻译后修饰酶，可去除 NAD +中赖氨酸残基的酰基修饰-依赖的方式。尽管最初被提议作为组蛋白去乙酰化酶 (HDAC)，但现在已知它们也可以靶向其他细胞酶和蛋白质。Sirtuin 催化的简单酰胺水解具有深远的生物学意义，包括抑制基因表达、促进 DNA 损伤修复以及调节葡萄糖和脂质代谢。人类 sirtuins 一直受到学术界和工业界的广泛关注，将其作为治疗癌症和神经退行性疾病等疾病的潜在治疗靶点。为了更好地了解它们在各种细胞事件中的作用，创新的化学探针备受追捧。目前的研究重点是开发基于活性的化学探针 (ABP)，用于分析生物样品中的 sirtuin 活性。合成了含环辛炔和含叠氮基的探针，以实现随后与荧光团或生物素的无铜“点击”结合。两组结构相关的 ABP 表现出不同的标记效率和选择性：含环辛炔的探针未能将重组 sirtuins 标记到任何可感知的水平，而含叠氮基的
• Development of Second Generation Activity-Based Chemical Probes for Sirtuins
  作者：Alyson M. Curry、Elizabeth Barton、Wenjia Kang、Daniel V. Mongeluzi、Yana Cen

  DOI：10.3390/molecules26010011

  日期：——

  shortened irradiation time, and reduced background signal. They were applied to the labeling of individual recombinant proteins, protein mixtures, and whole cell lysate. These cell permeable small molecule probes also enabled the cellular imaging of sirtuin activity change. Taken together, our study provides new chemical biology tools and future drug discovery strategies for perturbing the activity of different

  NAD+（烟酰胺腺嘌呤二核苷酸）依赖性蛋白质脱酰酶，即沉默调节蛋白，是重要的细胞衔接蛋白，可响应低热量条件改变细胞生理学。它们被认为可以调节卡路里限制的有益效果，以延长寿命和改善健康状况。非常需要新型化学探针，以更好地了解 Sirtuin 在各种生物过程中的作用。我们开发了一组非常简单的基于活性的化学探针，用于研究复杂天然蛋白质组中的活性 Sirtuin 含量。这些探针带有一个硫代酰基赖氨酸弹头、一个二氮嗪光亲和标签，以及一个末端炔烃生物正交官能团。与含有二苯甲酮的对应物相比，这些新探针显示出更高的标记效率和灵敏度，缩短照射时间，减少背景信号。它们被用于标记单个重组蛋白、蛋白质混合物和全细胞裂解物。这些可渗透细胞的小分子探针还能够对 Sirtuin 活性变化进行细胞成像。综上所述，我们的研究提供了新的化学生物学工具和未来的药物发现策略，以扰乱不同 Sirtuin 亚型的活性。
• US9290791B2
  申请人：——

  公开号：US9290791B2

  公开（公告）日：2016-03-22