3-methyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)pseudouridine | 81691-07-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 3-methyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)pseudouridine
• 英文别名: 3-methyl-3',5'-O-tetraisopropyldisiloxanyl-ψ-uridine；5-[(6aR,8S,9S,9aS)-9-hydroxy-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-3-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 81691-07-8
• 化学式: C₂₂H₄₀N₂O₇Si₂
• 分子量: 500.74
• InChiKey: AVLYRJTVNNKABE-FUMNGEBKSA-N

物化性质

• 密度：
  1.16±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.83
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-methyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)pseudouridine 在 四甲基乙二胺 、 氢氟酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 以85%的产率得到3-甲基-5-beta-D-呋喃核糖基-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮
  参考文献：
  名称：

  大肠杆菌23S rRNA螺旋69的合成，该螺旋包含其天然修饰的核苷m（3）Psi和Psi。

  摘要：

  3-甲基伪氨吡啶（m（3）Psi）亚磷酰胺，5'-O- [苯甲氧基双（三甲基甲硅烷氧基）甲硅烷基] -2'-O- [双（2-乙酰氧基乙氧基）甲基] -3-甲基伪氨吡啶-3'-的合成据报道有（甲基-N，N-二异丙基）亚磷酰胺。对Psi N1进行选择性的新戊酰氧基甲基保护，然后在N3处进行甲基化，以生成天然存在的伪尿苷类似物。m（3）Psi亚磷酰胺与假尿苷（Psi）和标准碱基亚磷酰胺结合使用可合成代表大肠杆菌23S核糖体RNA（rRNA）（残基1906-1924）的螺旋69的19个核苷酸的RNA。 （3）位置1915处的Psi和位置1911和1917处的两个Psi。我们对完全修饰的螺旋69 RNA的合成证明了制造毫克量RNA的能力，可用于进一步的高分辨率结构研究。于位置1915处假尿苷N3位置的甲基的位点选择性引入导致RNA发夹相对于假尿苷的热力学稳定性略有增加；在1915位含有尿苷或3-甲基

  DOI：

  10.1021/jo026364m
• 作为产物：
  描述：

  假尿苷 在 吡啶 、 氨 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 苯 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 3-methyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyl-1,3-disiloxanediyl)pseudouridine
  参考文献：
  名称：

  大肠杆菌23S rRNA螺旋69的合成，该螺旋包含其天然修饰的核苷m（3）Psi和Psi。

  摘要：

  3-甲基伪氨吡啶（m（3）Psi）亚磷酰胺，5'-O- [苯甲氧基双（三甲基甲硅烷氧基）甲硅烷基] -2'-O- [双（2-乙酰氧基乙氧基）甲基] -3-甲基伪氨吡啶-3'-的合成据报道有（甲基-N，N-二异丙基）亚磷酰胺。对Psi N1进行选择性的新戊酰氧基甲基保护，然后在N3处进行甲基化，以生成天然存在的伪尿苷类似物。m（3）Psi亚磷酰胺与假尿苷（Psi）和标准碱基亚磷酰胺结合使用可合成代表大肠杆菌23S核糖体RNA（rRNA）（残基1906-1924）的螺旋69的19个核苷酸的RNA。 （3）位置1915处的Psi和位置1911和1917处的两个Psi。我们对完全修饰的螺旋69 RNA的合成证明了制造毫克量RNA的能力，可用于进一步的高分辨率结构研究。于位置1915处假尿苷N3位置的甲基的位点选择性引入导致RNA发夹相对于假尿苷的热力学稳定性略有增加；在1915位含有尿苷或3-甲基

  DOI：

  10.1021/jo026364m

文献信息

• Synthesis of 3-methylpseudouridine and 2′-deoxy-3-methyl-pseudouridine
  作者：Akira Matsuda、Krzysztof Pankiewicz、Bonita K. Marcus、Kyoichi.A. Watanabe、Jack J. Fox

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)81043-5

  日期：——

  The first chemical synthesis of 3-methyl-psi-uridine (5) and its 2'-deoxy analogue (9) has been achieved. psi-Uridine was trimethylsilylated and the crude product was treated with acetyl chloride, to give the 1-acetyl derivative (3). Crude 3 was methylated with dimethoxymethyldimethylamine and then saponified, to give crystalline 5 in 82% overall yield. Treatment of 5 with 1,3-dichloro-1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane afforded the 3'5'-protected product, which was converted into the 2'O-[(imidazol-1-yl) thiocarbonyl] derivative 7. Reduction of 7 with tributyltin hydride followed by deblocking of the product gave crystalline 2'-deoxy-3-methyl-psi-uridine (9) in 35% yield form 5.