(2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (3-oxobutan-2-yl) phosphate | 87471-38-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (3-oxobutan-2-yl) phosphate
• CAS: 87471-38-3
• 化学式: C₅₀H₅₂N₅O₁₄P
• 分子量: 977.962
• InChiKey: AEMWTZCTQXPTQI-SXKKJZEASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.81
• 重原子数：
  70.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  237.83
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (3-oxobutan-2-yl) phosphate 在 ammonium hydroxide 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.33h， 生成 Phosphoric acid (2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxo-2H-pyrimidin-1-yl)-2-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-3-yl ester (2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester; compound with triethyl-amine
  参考文献：
  名称：

  环状烯二醇磷酸化法合成脱氧核糖四核苷酸

  摘要：

  给出了磷酸二酯合成的二（1,2-二甲基亚乙基亚乙基）焦磷酸盐方法在dG，dA，dC和dT家族中将脱氧核糖核苷转化为脱氧核糖二核苷酸的完整实验细节。作为用于将脱氧核糖二核苷酸转化为脱氧核糖四核苷酸的试剂，N-（1,2-二甲基亚乙二基二氧基磷酰基）咪唑优于相应的焦磷酸盐。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)91932-5
• 作为产物：
  描述：

  二(二甲基乙烯亚基)焦磷酸酯 、 N-Benzoyl-5'-O-monomethoxytrityl-desoxycytidin 、 beta-胸苷 在 三乙胺 作用下， 生成 (2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (3-oxobutan-2-yl) phosphate
  参考文献：
  名称：

  环状烯二醇磷酸化法合成脱氧核糖四核苷酸

  摘要：

  给出了磷酸二酯合成的二（1,2-二甲基亚乙基亚乙基）焦磷酸盐方法在dG，dA，dC和dT家族中将脱氧核糖核苷转化为脱氧核糖二核苷酸的完整实验细节。作为用于将脱氧核糖二核苷酸转化为脱氧核糖四核苷酸的试剂，N-（1,2-二甲基亚乙二基二氧基磷酰基）咪唑优于相应的焦磷酸盐。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)91932-5