N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester | 141462-11-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester
• 英文别名: N^α-Fmoc-Ser(Ac3-α-D-GalN3)-OPfp；N^α-(9-Fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-desoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serin-pentafluorphenylester；N^α-(9H-fluoren-9-yl)methoxycarbonyl-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester；(2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) (2S)-3-[(2S,3R,4R,5R,6R)-4,5-diacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)-3-azidooxan-2-yl]oxy-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoate
• CAS: 141462-11-5
• 化学式: C₃₆H₃₁F₅N₄O₁₂
• 分子量: 806.654
• InChiKey: UTHQLPIERXGVBG-WYJVBCQFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.5
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  176
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  乙酸酐 、 N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester 在 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 O-(2-acetamido-3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-N^α-(fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-L-serine pentafluorophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  Versatile solid-phase thiolytic reduction of azido and N-Dts groups in the synthesis of haemoglobin (67–76) O-glycopeptides and photoaffinity labelled analogues to study glycan T-cell specificity

  摘要：

  利用糖基化结构单元 1â4 和 7â21 通过多柱肽合成法合成了一系列 O-糖基化肽和光亲和标记的小鼠血红蛋白衍生十肽 Hb（67â76）的糖肽类似物 VITAFNEGLK，它能很好地与 MHC II 类 Ek 分子结合，并且对 CBA/J 小鼠无免疫原性。通过在十肽的中心位置 Asn-72 引入不同的肿瘤相关碳水化合物分子 [δ-D-GlcNAc-O-Ser/Thr、δ-D-GalNAc-O-Ser/Thr（TN 抗原）核心 1（T 抗原）、核心 2、核心 3 和核心 4]，将非免疫原性肽 VITAFNEGLK 转化为免疫原。 以往的研究表明，T 细胞可能能够识别部分由聚糖定义的表位，并可能与 T 细胞受体直接接触。为了研究聚糖与 T 细胞受体相互作用的特异性，我们合成了一系列在碳水化合物氨基功能上用 2- 叠氮苯甲酰胺标记的相应聚糖肽。聚糖结构随 O-GlcNAc、T 和 TN 抗原分子以及异构体构型的不同而变化。自始至终，含 N-二硫代丁二酰基和叠氮官能团的结构单元 1、2、7、8、11、12、13、16、18 和 20 都可以通过以下两种方法实现高效还原：(i) 在溶液中用 Zn 在 THFâHOAcâAc2O 中同时原位还原；或 (ii) 在固相上用二异丙基乙胺和过量的二硫苏糖醇或δ-巯基-N-甲基乙酰胺处理。对树脂结合的糖肽进行 N-乙酰化，可得到 O-糖肽 24、25 和 31â36。在使用 N-乙酰化结构单元 3、4、9、10、14、15、17、19 和 21 时，不需要在固相上进一步修饰碳水化合物分子。此外，在合成 O-连接糖肽 24、25 和 31â36 时，还进行了固相还原比较研究，采用的是 1â4 和 7â21 中的任何一种构建模块。光亲和标记的糖肽 39â45 是通过使用构建模块 1、2、7、8 和 11â13 合成的，方法是用二硫苏糖醇进行硫醇分解还原叠氮或 N-Dts 官能，然后将活化的光亲和标记 38 与树脂结合的糖肽的甘氨酸基偶联。通过一维和二维 1H NMR 光谱以及电喷雾质谱法，对合成的粘蛋白 O 型糖肽 24、25 和 31â36 以及光亲和标记的类似物 39â45 进行了全面鉴定。

  DOI：

  10.1039/a606725e
• 作为产物：
  描述：

  2-叠氮-D-半乳糖四乙酸酯 在 4 A molecular sieve 、 四乙基氯化铵 、 silver perchlorate 、 溴化钛(IV) 、 silver carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 乙腈 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 N^α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-L-serine pentafluorophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  Paulsen, Hans; Bielfeldt, Tim; Peters, Stefan, Liebigs Annalen der Chemie, 1994, # 4, p. 369 - 380

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Positional Scanning MUC1 Glycopeptide Library Reveals the Importance of PDTR Epitope Glycosylation for Lectin Binding
  作者：YashoNandini Singh、Maria C. Rodriguez Benavente、Mohammed H. Al-Huniti、Donella Beckwith、Ramya Ayyalasomayajula、Eric Patino、William S. Miranda、Alex Wade、Maré Cudic

  DOI：10.1021/acs.joc.9b02396

  日期：2020.2.7

  screen PS-SGCL against two plant lectins, Glycine max soybean agglutinin and Vicia villosa. The results revealed a carbohydrate density-dependent affinity trend and site-specific glycosylation requirements for high affinity binding to these lectins. Hence, PS-SGCLs provide a platform to systematically elucidate MUC1-lectin binding specificities, which in the long term may provide a rational design for

  解释基于聚糖的改变在癌症中的功能重要性的主要障碍之一是在癌细胞表面上发现的天然表位异质性。为了帮助解决这一知识鸿沟，我们专注于设计合成工具，以探索与凝集素相关的MUC1肿瘤相关聚糖在转移形成中的作用。在这项研究中，我们首次合成了MUC1衍生的位置扫描合成糖肽组合文库（PS-SGCL），该文库使用“茶袋”方法改变了癌症相关Tn抗原的数量和位置。确定了将（糖）氨基酸混合物等摩尔掺入树脂结合的氨基酸所必需的等速比，以及开发一种用于O-乙酰基树脂脱保护的有效方案。使用酶联凝集素测定法针对两种植物凝集素Glycine max大豆凝集素和蚕豆Vicia筛选PS-SGCL。结果揭示了碳水化合物密度依赖性亲和趋势和对这些凝集素的高亲和力结合的位点特异性糖基化要求。因此，PS-SGCL为系统地阐明MUC1-凝集素结合特异性提供了一个平台，从长远来看，它可以为涉及肿瘤扩散和基于糖肽的癌症疫苗中的MUC1-凝集
• Synthesis and characterisation of highly glycosylated glycopeptides with Tn-antigenic structures corresponding to human glycophorin AN
  作者：Gunther Klich、Hans Paulsen、Bernd Meyer、Morten Meldal、Klaus Bock

  DOI：10.1016/s0008-6215(96)00337-0

  日期：1997.3

  Two highly glycosylated O-glycopeptides corresponding to human glycophorin AN with Tn-antigenic structures were synthesised. The first glycopeptide has two glycosylated clusters with three and six adjacent 2-acetamido-2-deoxy-D-galactose (GalNAc) glycosylation sites and represents the N-terminal octadecapeptide from Leu-1 to Lys-18. The second glycopeptide, a decapeptide from His-9 to Lys-18, contains

  合成了两个具有人糖蛋白AN的具有Tn抗原结构的高度糖基化的O-糖肽。第一糖肽具有两个具有三个和六个相邻的2-乙酰氨基-2-脱氧-D-半乳糖（GalNAc）糖基化位点的糖基化簇，并且代表从Leu-1至Lys-18的N-末端八肽。第二个糖肽，即从His-9到Lys-18的十肽，包含6个相邻的GalNAc糖基化位点作为紧密簇。通过使用含碳水化合物的结构单元Fmoc-Ser（Ac3GalN3）-Pfp和Fmoc-Thr（Ac3GalN3）-Pfp实现固相合成。合成的物质通过NMR光谱技术表征。使用的主要技术是同核TOCSY和NOESY以及用于13C，1H相关性的HMQC和HMBC。
• Syntheses of TN building blocks Nα-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-α-d-galactopyranosyl)-l-serine/l-threonine pentafluorophenyl esters: comparison of protocols and elucidation of side reactions
  作者：Mian Liu、Victor G. Young、Sachin Lohani、David Live、George Barany

  DOI：10.1016/j.carres.2005.02.029

  日期：2005.5

  T-N antigen building blocks N-alpha-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranosyl)-L-serine/L-threonine pentafluorophenyl ester [Fmoc-L-Ser/L-Thr(Ac-3-alpha-D-GalN(3))-OPfP, 13/14] have been synthesized by two different routes, which have been compared. Overall isolated yields [three or four chemical steps, and minimal intermediary purification steps] of enantiopure 13 and 14 were 5-18% and 6-10%, respectively, based on 3,4,6-tri-O-acetyl-D-galactal (1). A byproduct of the initial azidonitration reaction of the synthetic sequence, that is, N-acetyl-3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranosylamine (5), has been characterized by X-ray crystallography, and shown by H-1 NMR spectroscopy to form complexes with lithium bromide, lithium iodide, or sodium iodide in acetonitrile-d(3). Intermediates 3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido2-deoxy-alpha-D-galactopyranosyl bromide (6) and 3,4,6-tri-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-beta-D-galactopyranosyl chloride (7) were used to glycosylate N-alpha-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-serine/L-threonine pentafluorophenyl esters [Fmoc-L-Ser/L-Thr-OPfp, 11/12]. Previously undescribed low-level dehydration side reactions were observed at this stage; the unwanted byproducts were easily removed by column chromatography. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Arsequell, Gemma; Haurum, John S.; Elliott, Tim, Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1995, # 13, p. 1739 - 1746
  作者：Arsequell, Gemma、Haurum, John S.、Elliott, Tim、Dwek, Raymond A.、Lellouch, Annemarie C.

  DOI：——

  日期：——
• Bielfeldt, Tim; Peters, Stefan; Meldal, Morten, Angewandte Chemie, 1992, vol. 104, # 7, p. 881 - 883
  作者：Bielfeldt, Tim、Peters, Stefan、Meldal, Morten、Bock, Klaus、Paulsen, Hans

  DOI：——

  日期：——