1-(2,2-dimethoxyethyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole | 1613694-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 1-(2,2-dimethoxyethyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole
• 英文别名: 4-(1-(2,2-dimethoxyethyl)-2-phenethyl-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)-3,5-dimethylisoxazole
• CAS: 1613694-61-3
• 化学式: C₂₄H₂₇N₃O₃
• 分子量: 405.497
• InChiKey: JMTLLVFUYXJTCA-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  105-107 °C
• 沸点：
  579.7±50.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.18±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.71
• 重原子数：
  30.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  62.31
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2,2-dimethoxyethyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole 在 三乙酰氧基硼氢化钠 、 溶剂黄146 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 2.83h， 生成 tert-butyl 4-{2-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazol-1-yl]ethyl}piperazine-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  CBP/p300 溴结构域小分子配体的发现和优化

  摘要：

  缺乏针对溴结构域和末端外 (BET) 亚家族之外的溴结构域的小分子抑制剂。在这里，我们描述了人类赖氨酸乙酰转移酶 CBP/p300 溴结构域模块的高效和选择性配体，由一系列 5-异恶唑基苯并咪唑开发而成。我们的出发点是片段命中，使用 Suzuki 偶联、苯并咪唑形成反应和还原胺化的平行合成将其优化为更有效和选择性更强的先导化合物。使用热稳定性测定法研究了先导化合物对其他溴结构域家族成员的选择性，结果显示对结构相关的 BET 家族成员有一些抑制作用。为了解决 BET 选择性问题，与 CREB ​​结合蛋白 (CBP) 和 BRD4 的第一个溴结构域 (BRD4(1)) 结合的先导化合物的 X 射线晶体结构用于指导更具选择性的化合物的设计。获得的晶体结构揭示了两种不同的结合模式。通过改变芳基取代模式和开发构象受限的类似物，增加了 CBP 超过 BRD4(1) 的选择性。优化后的化合物具有高效 (Kd

  DOI：

  10.1021/ja412434f
• 作为产物：
  描述：

  4-(4-fluoro-3-nitrophenyl)-3,5-dimethylisoxazole 在 sodium dithionite 作用下， 以 甲醇 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 1-(2,2-dimethoxyethyl)-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  CBP/p300 溴结构域小分子配体的发现和优化

  摘要：

  缺乏针对溴结构域和末端外 (BET) 亚家族之外的溴结构域的小分子抑制剂。在这里，我们描述了人类赖氨酸乙酰转移酶 CBP/p300 溴结构域模块的高效和选择性配体，由一系列 5-异恶唑基苯并咪唑开发而成。我们的出发点是片段命中，使用 Suzuki 偶联、苯并咪唑形成反应和还原胺化的平行合成将其优化为更有效和选择性更强的先导化合物。使用热稳定性测定法研究了先导化合物对其他溴结构域家族成员的选择性，结果显示对结构相关的 BET 家族成员有一些抑制作用。为了解决 BET 选择性问题，与 CREB ​​结合蛋白 (CBP) 和 BRD4 的第一个溴结构域 (BRD4(1)) 结合的先导化合物的 X 射线晶体结构用于指导更具选择性的化合物的设计。获得的晶体结构揭示了两种不同的结合模式。通过改变芳基取代模式和开发构象受限的类似物，增加了 CBP 超过 BRD4(1) 的选择性。优化后的化合物具有高效 (Kd

  DOI：

  10.1021/ja412434f

文献信息

• One‐Step Synthesis of Photoaffinity Probes for Live‐Cell MS‐Based Proteomics
  作者：David J. Fallon、Stephanie Lehmann、Chun‐wa Chung、Alex Phillipou、Christian Eberl、Ken G. M. Fantom、Francesca Zappacosta、Vipulkumar K. Patel、Marcus Bantscheff、Christopher J. Schofield、Nicholas C. O. Tomkinson、Jacob T. Bush

  DOI：10.1002/chem.202102036

  日期：2021.12.20

  Get PALs quick: A multicomponent reaction for the one-step synthesis of PAL probes. A library of diverse bromodomain (BET)-targeting PAL probes was synthesized and profiled extensively (physicochemical properties, biochemical and cellular activities, photolabeling efficiencies and crystallographic studies). Optimal probes were profiled by MS-based proteomics to capture BET proteins from live cells

  快速获取 PAL ：一种用于一步合成 PAL 探针的多组分反应。合成了多种靶向溴结构域 (BET) 的 PAL 探针库，并对其进行了广泛的分析（物理化学性质、生化和细胞活性、光标记效率和晶体学研究）。通过基于 MS 的蛋白质组学对最佳探针进行分析，以从活细胞中捕获 BET 蛋白，并揭示其潜在的靶向/脱靶特征。我们设想这种方法可用于快速访问其他感兴趣化合物的 PAL 探针并获得其目标概况。