N-dodecyl-[Nε-(tert-butyloxycarbonyl)]lysinamide | 910794-16-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-dodecyl-[Nε-(tert-butyloxycarbonyl)]lysinamide
• 英文别名: N-dodecyl-[N^ε-(tert-butyloxycarbonyl)]lysinamide；tert-butyl (5-amino-6-(dodecylamino)-6-oxohexyl)carbamate
• CAS: 910794-16-0
• 化学式: C₂₃H₄₇N₃O₃
• 分子量: 413.644
• InChiKey: MPFHRPSLEPTCAJ-FQEVSTJZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.05
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.91
• 拓扑面积：
  93.45
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-dodecyl-[Nε-(tert-butyloxycarbonyl)]lysinamide 在 sodium methylate 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 38.0h， 生成 N-[1-(dodecylcarbamoyl)-5-(ammonio)pentyl]-22-[2-(β-D-galactopyranosyloxy)ethylcarbamoyl]-12-thiadocosanamide trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and preliminary biological studies of hemifluorinated bifunctional bolaamphiphiles designed for gene delivery

  摘要：

  描述了一种新型不对称半氟碳双亲类化合物系列的多步骤合成方法，这些化合物专为基因传输设计。通过不对称功能化的二碘全氟辛烷，合成了由部分氟碳核心两端分别以糖苷和来源于组氨酸或赖氨酸的季铵盐封端的双亲分子。初步的生物学结果显示，其中一种双亲分子——以赖氨酸和乳糖酰胺残基封端——对COS-7细胞诱导了极低的细胞毒性，并且当其与DNA质粒自组装时，在不添加任何融合脂质的情况下，产生了显著的体外转染效率。

  DOI：

  10.1039/b513944a
• 作为产物：
  描述：

  N-dodecyl-[Nα-(benzyloxycarbonyl)-Nε-(tert-butyloxycarbonyl)]lysinamide 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 20.0 ℃ 、800.0 kPa 条件下， 反应 6.0h， 生成 N-dodecyl-[Nε-(tert-butyloxycarbonyl)]lysinamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and preliminary biological studies of hemifluorinated bifunctional bolaamphiphiles designed for gene delivery

  摘要：

  描述了一种新型不对称半氟碳双亲类化合物系列的多步骤合成方法，这些化合物专为基因传输设计。通过不对称功能化的二碘全氟辛烷，合成了由部分氟碳核心两端分别以糖苷和来源于组氨酸或赖氨酸的季铵盐封端的双亲分子。初步的生物学结果显示，其中一种双亲分子——以赖氨酸和乳糖酰胺残基封端——对COS-7细胞诱导了极低的细胞毒性，并且当其与DNA质粒自组装时，在不添加任何融合脂质的情况下，产生了显著的体外转染效率。

  DOI：

  10.1039/b513944a

文献信息

• Differential modulation of SIRT6 deacetylase and deacylase activities by lysine-based small molecules
  作者：Giovanna Sociali、Nara Liessi、Alessia Grozio、Irene Caffa、Marco Daniele Parenti、Silvia Ravera、Bruno Tasso、Andrea Benzi、Alessio Nencioni、Alberto Del Rio、Inmaculada Robina、Enrico Millo、Santina Bruzzone

  DOI：10.1007/s11030-019-09971-2

  日期：2020.8

  Sirtuin 6 (SIRT6) is an NAD+-dependent deacetylase regulating important functions: modulators of its enzymatic activity have been considered as possible therapeutic agents. Besides the deacetylase activity, SIRT6 also has NAD+-dependent deacylase activity, whereby it regulates the secretion of cytokines and proteins. We identified novel SIRT6 modulators with a lysine-based structure: compound 1 enhances SIRT6 deacylase while inhibiting the deacetylase activity. As expected based on the biological effects of SIRT6 deacetylase activity, compound 1 increased histone 3 lysine 9 acetylation and the activity of glycolytic enzymes. Moreover, the fact that compound 1 enhanced SIRT6 deacylase activity was accompanied by an increased TNF-α release. In conclusion, new SIRT6 modulators with a lysine-like structure were identified, with differential effects on specific SIRT6 activities. The novel SIRT6 modulator concomitantly inhibits deacetylase and enhances deacylase activity.

  Sirtuin 6（SIRT6）是一种依赖于 NAD+ 的去乙酰化酶，具有重要的调节功能：其酶活性调节剂已被视为可能的治疗药物。除了去乙酰化酶活性外，SIRT6 还具有 NAD+ 依赖性去酰化酶活性，从而调节细胞因子和蛋白质的分泌。我们发现了具有赖氨酸结构的新型 SIRT6 调节剂：化合物 1 在抑制脱乙酰化酶活性的同时，还能增强 SIRT6 的脱乙酰化酶活性。正如基于 SIRT6 去乙酰化酶活性的生物学效应所预期的那样，化合物 1 增加了组蛋白 3 赖氨酸 9 乙酰化和糖酵解酶的活性。此外，化合物 1 在增强 SIRT6 脱乙酰酶活性的同时还增加了 TNF-α 的释放。总之，我们发现了具有类似赖氨酸结构的新型 SIRT6 调节剂，它们对特定的 SIRT6 活性具有不同的影响。新型 SIRT6 调节剂可同时抑制去乙酰化酶和增强去乙酰化酶的活性。