enthalpies. Unexpectedly, binding entropies of the constrained ligands were uniformly disfavored relative to their flexible controls, demonstrating that the widely held belief that ligand preorganization should result in an entropic advantage is not necessarily true. Crystallographic studies of complexes of several flexible and constrained ligands having the same amino acid at the pY+1 position revealed extensive
琥珀酸和
环丙烷衍生的
磷酸酪氨酸 (pY) 置换被纳入一系列 Grb2 SH2 结合
配体,其中 pY+1 残基发生变化,以确定
配体预组织的变化如何影响结合能量学和结构。这些
配体与 Grb2 SH2 结构域的配合物在一系列热力学和结构研究中使用等温滴定量热法和 X 射线晶体学进行了检查。所有
配体的结合焓都是有利的,尽管在 pY+1 位点具有疏
水残基的所有
配体的结合熵是有利的,但在该位点具有亲
水残基的那些的结合熵是不利的。与灵活的控制相比,预组织的
配体通常与更有利的吉布斯能量结合,但这种增加的亲和力是相对更有利的结合焓的结果。出乎意料的是,相对于它们的灵活控制,受限
配体的结合熵一致不受欢迎,这表明普遍认为
配体预组织应该导致熵优势的观点不一定正确。对在 pY+1 位置具有相同
氨基酸的几种柔性和受限
配体的复合物的晶体学研究揭示了广泛的相似性,但存在一些显着的差异。在受限
配体的复合物中有更多的直接极性